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Nat Commun?|?蘇俊實驗室揭示哺乳動物卵母細胞染色質成熟的分子與生物物理機制

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卵母細胞是哺乳動物體內(nèi)最大的細胞,其 獨特的 生長 模式 依賴 于 發(fā)育過程中染色質轉錄大量的 mRNA 以合成大量的蛋白質。生長期卵母細胞的染色質 呈現(xiàn)非包繞核仁( non-surrounded nucleolus ,NSN)的構 象 :染色質彌散且相對均勻分布在細胞核內(nèi),具有高轉錄活性。隨著卵母細胞完成生長,其染色質會變得緊湊并轉變成包繞核仁( surrounded nucleolus ,SN)的構 象 , 該過程 伴隨著轉錄沉默的發(fā)生。自上世紀七十年代 初 科學家首次觀察到卵母細胞 具 有這兩種染色質構 象后(圖1,已有一系列的研究證明 SN 型卵母細胞的發(fā)育潛能比 NSN 型 的 高,并嘗試 通過 多組學技術 比較發(fā)現(xiàn)其 中的 分子差異。然而, 干預 這些過往被報道的差異分子 并不能 在卵母細胞里 實現(xiàn)染色質構 象 的 實時 轉換,因此 NSN 向 SN 轉變?nèi)绾伟l(fā)生 這一關鍵問題 亟待 闡明 。 攻克 其中的分子機制 對 于 實現(xiàn) 卵母細胞染色質成熟的體 外誘導至關重要,對 解決 臨床上卵子成熟障礙、 IVM 周期等 NSN 型易發(fā) 的 情況有重要 影響 。


圖 1 哺乳動物卵母細胞 的兩種染色質構象

2025 年 12 月 12 日,北京生命科學研究所 / 清華大學生物醫(yī)學交叉研究院蘇俊實驗室在 Nature Communications 雜志發(fā)表了題為

Natural degradation of RNA polymerase II is essential for oocyte chromatin reorganization and maternal-to-zygotic transition
的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)發(fā)育過程中RNA聚合酶II的自然降解是卵母細胞染色質從NSN轉變成SN構象的關鍵驅動因素。


通過分選不同染色質構象的卵母細胞并進行高分辨成像, 研究人員 首先系統(tǒng)比較 了 NSN 型和 SN 型卵母細胞 中 大概 30 種不同核蛋白的染色強度與分布 , 發(fā)現(xiàn)大多數(shù)核蛋白 在 SN 型卵母細胞里被下調。 為篩選 能 驅動 NSN 向 SN 轉變的關鍵核蛋白,研究人員采用小分子抑制劑與 mRNA 過表達的手段來模擬 NSN 向 SN 轉變過程中不同蛋白的變化,意外發(fā)現(xiàn)一種名為放線菌素DActD) 的化學小分子可以瞬時誘導 NSN 向 SN 轉變。

ActD 是一種 DNA 嵌入劑,可以同時抑制 RNA 聚合酶 I 和 II 。 利用特異的 RNA 聚合酶 I 和 II 抑制劑,研究人員發(fā)現(xiàn)只有 RNA 聚合酶 II ( RNAPII )的抑制劑 α- 鵝膏蕈堿( α-amanitin )和 雷公藤內(nèi)酯( Triptolide )可以誘導 NSN 向 SN 轉變。通過進一步 的 表觀遺傳、高通量染色質構象捕獲和卵子發(fā)育潛能等測試,確認了 經(jīng) α-amanitin 誘導出來的 和自然的 SN 型卵母細胞高度相似。 RNAPII 是 mRNA 轉錄的關鍵酶。為了明確 NSN 向 SN 轉變是否直接由轉錄沉默所介導,研究人員采用了 另一類 RNAPII 抑制劑 核苷類似物 直接終止 其 轉錄 活動 。有趣的是,核苷類似物可以有效的抑制轉錄但未能誘導 NSN 向 SN 轉變,說明 α-amanitin 和 triptolide 經(jīng)其他途徑介導 NSN 向 SN 轉變。經(jīng)過一系列的排查,研究人員 最終 發(fā)現(xiàn) α-amanitin 和 triptolide 實際上并不直接抑制轉錄,而是通過降解 RNAPII 而 發(fā)揮其作用。

要證明 NSN 向 SN 轉變與內(nèi)源 RNAPII 的蛋白 水平 相關,需要在卵母細胞里敲除 或敲降 RNAPII ??墒?RNAPII 是細胞里的必需基因,無法通過遺傳學手段獲得 RNAPII 敲除的卵母細胞。為此,研究人員 革新了 2017 年發(fā)表的 Trim-Away 急性蛋白去除技術,通過把 單鏈抗體與 Trim21 E3 泛素化酶的 RING 結構 域融合開發(fā)出了 miniTrim-Away 技術 , 克服 了 原技術不能靶向 長期滯留在核內(nèi)的蛋白的痛點。通過 RNAPII 的 miniTrim -Away ,研究人員成功在小鼠和人卵母細胞 里 瞬時降解內(nèi)源 RNAPII 并確立 其 降解驅動 NSN 向 SN 轉變(圖2。 進一步的體內(nèi)實驗亦發(fā)現(xiàn)NSNSN轉變與RNAPII的天然降解有關,利用解折疊酶和蛋白酶體抑制劑可以在離體卵泡培養(yǎng)模型阻止NSNSN轉變的發(fā)生。


圖 2 利用新開發(fā)的 miniTrim -Away 技術 降解內(nèi)源 RNAPII 并重現(xiàn) NSN 向 SN 轉變 的表型

為了深入解析 RNAPII 降解如何驅動 NSN 向 SN 轉變,研究人員通過超分辨成像 、 CUT&Tag 和 磷酸酶 抑制劑處理 發(fā)現(xiàn)轉錄活躍的 磷酸化 RNAPII 會積累在 染色質 (尤其 是 在轉錄活躍的轉錄起點和轉錄終點后 10kb 的區(qū)域) 并參與 NSN 向 SN 的 轉變 ,而不活躍的非磷酸化 RNA P II 會游離在核質。 因此,研究人員 提出假設:磷酸化RNAPII的結合約束了染色質動態(tài),繼而把染色質鎖在了彌散的NSN構象。利用 高速活細胞成像 和 均方位移 分析 , 研究人員 發(fā)現(xiàn) NSN 型染色質 的動態(tài) 的確 比 SN 型的低。 進一步, 研究人員通過過表達組蛋白 H2B 和錨定染色質到核膜 上 這兩種不同限制染色質動態(tài)的方法, 在功能層面上證明了 約束染色質的動態(tài) 可以阻止 NSN 向 SN 轉變 時旁染色質的凝聚。意外的是,這兩種干預并不影響核仁 邊 染色質的凝聚,說 明在 RNAPII 降解的過程中 有兩種不同的作用力驅動 NSN 向 SN 轉變 :一種是染色質動態(tài)恢復所產(chǎn)生的塌陷力,而另一種可能是與核仁表面有關的吸引力。通過 向 核 內(nèi) 注射核仁大小的無生物活性油滴和利用沒有核仁的 Npm2 條件敲除小鼠,研究人員最終發(fā)現(xiàn) RNAPII 的降解同時會引發(fā)核仁表面蛋白的重塑,并提出 哺乳動物卵母細胞染色質 從 NSN 向 SN 轉變的完整模型(圖3


圖 3 本研究提出的 哺乳動物卵母細胞染色質 成熟 的 機制

綜上,本研究首次揭示卵母細胞染色質成熟的機制:生長過程中,RNAPII經(jīng)非經(jīng)典的非泛素化依賴途徑逐漸被降解。隨著 RNAPII 從染色質上被 剝離 ,轉錄 終止 的同時會增加 染色質動態(tài) 和 引 發(fā) 核仁表面 重塑 , 繼而產(chǎn)生兩種不同的作用力驅動 NSN 向 SN 轉變。 若 該過程 受阻, 受精卵的 RNAPII 蛋白 水平和定位 會出現(xiàn) 異常, 影響 母源 向 合子 轉變和后期早期胚胎發(fā)育 。

蘇俊實驗室的博士生王靜為該論文的第一作者。北京生命科學研究所 / 清華大學生物醫(yī)學交叉研究院蘇俊研究員、黎斌研究員和 中南大學基礎醫(yī)學院 / 中信湘雅生殖與遺傳??漆t(yī)院 林戈教授為本文的共同通訊作者。論文的其他作者包括黎斌實驗室的李網(wǎng)、中南大學基礎醫(yī)學院 / 中信湘雅 生殖與遺傳??漆t(yī)院郭靜副教授和北京家園醫(yī)院徐小明博士在多組學數(shù)據(jù)分析和人卵母細胞的募集做出了貢獻。

原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-025-67476-z

制版人: 十一

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