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你的下一批科研隊友,將是AI智能體!生物醫(yī)學研究進入智能體驅(qū)動新階段

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編譯丨王聰

編輯丨王多魚

排版丨水成文

人工智能(AI)技術(shù)的最新進展正在重塑諸如信息檢索(例如 ChatGPT)、編程(例如 GitHub Copilot)和圖像生成(例如 DALL-E)等傳統(tǒng)上勞動密集型任務。這些發(fā)展得益于算法的顯著改進,例如大語言模型(LLM)和強化學習(RL),從而重新激發(fā)了人們對Agent(智能體)和Agentic AI(代理式 AI)的興趣。

Agent被定義為一個系統(tǒng),該系統(tǒng)包含一個或多個計算模型,這些模型能夠自主運行,通過處理數(shù)據(jù)來引導解決方案的生成、決策制定和執(zhí)行,從而實現(xiàn)人類指定的目標。而Agentic AI則是一種新型 AI 架構(gòu),它能讓一個或多個智能體協(xié)同工作,以實現(xiàn)共同的高層次目標,Agentic AI 在變革長期以來被認為具有獨特人類屬性的活動方面展現(xiàn)出巨大潛力。生物醫(yī)學研究就是其中之一,它通常涉及文獻回顧、假設生成、實驗設計、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果解讀以及真實世界驗證等反復且迭代的過程。生物醫(yī)學研究面臨諸多阻礙,包括專家資源有限、時間緊迫、資金資源匱乏以及對多種技能和知識的高需求。而 Agentic AI 正開始展現(xiàn)出作為有效工具的潛力,能夠通過創(chuàng)建特定領域的專家智能體、處理科學文獻語料庫以及迭代更新實驗計劃來緩解生物醫(yī)學研究中的一些障礙。

近日,西達賽奈醫(yī)學中心的Jason H. Moore團隊在Nature Biotechnology上發(fā)表了題為:Agentic AI and the rise of in silico team science in biomedical research 的觀點文章。

Agentic AI系統(tǒng)正在作為智能計算專家團隊涌現(xiàn),能夠在文獻綜述、假設提出、數(shù)據(jù)分析和模型解釋等勞動密集型任務中作為媲美人類的表現(xiàn)。這些系統(tǒng)有望通過基于情境信息和專家反饋自主決策,來加速勞動密集型的生物醫(yī)學研究。

該文章討論了推動Agentic AI發(fā)展的三項關(guān)鍵算法和七項基礎構(gòu)建模塊特征,重點介紹了它們在生物醫(yī)學領域的應用、設計考慮因素,以及部署 Agentic AI 系統(tǒng)以推進協(xié)作科學研究所面臨的挑戰(zhàn)與機遇。


目前,在生物醫(yī)學領域,Agentic AI仍處于早期發(fā)展階段,相關(guān)進展大多以預印本或技術(shù)報告的形式發(fā)布,通常尚未經(jīng)過全面的同行評審,但 AI 算法和工程技術(shù)的持續(xù)進步,正在迅速拓展其能力。


人類研究團隊 vs Agentic AI 研究團隊


AI 智能體的內(nèi)部架構(gòu)示例

驅(qū)動Agentic AI 的關(guān)鍵算法

Agentic AI的發(fā)展主要由三大算法驅(qū)動:

  • 大語言模型: GPT-5.2、Claude Opus 4.5、Gemini 3、DeepSeek-V3.2 等大語言模型(LLM)作為 Agentic AI的主要驅(qū)動引擎,將人類指令轉(zhuǎn)化為計算操作。

  • 強化學習: 用于訓練和改進 Agentic AI,通過獎勵機制使 AI 行為與人類偏好或倫理原則對齊,包括基于人類反饋的強化學習和基于可驗證獎勵的強化學習等方法。

  • 進化算法: 受生物進化原理啟發(fā),用于優(yōu)化 Agentic AI 的響應或架構(gòu)設計,能發(fā)現(xiàn)不同于人類直覺的新穎解決方案。

Agentic AI 的七大特征

文章指出,以下七大特征是構(gòu)建用于生物醫(yī)學研究的 Agentic AI 的關(guān)鍵——

  • 推理: 從已有知識和情境信息中推導結(jié)論,模仿人類認知策略和應用邏輯推理技術(shù)。

  • 驗證: 確保推理過程和最終答案的正確性,與事實知識對齊,旨在減輕大語言模型的“幻覺”問題。

  • 反思: 通過迭代的自我改進來增強推理能力,分析失敗原因并避免重復錯誤。

  • 規(guī)劃: 將復雜任務分解為更易管理的子任務,并組織行動順序。可以是靜態(tài)、動態(tài)或按需規(guī)劃。

  • 工具使用: 決定如何及何時使用專業(yè)工具(例如生物信息學工具、機器學習庫、生物醫(yī)學知識圖譜),這是 Agentic AI 與傳統(tǒng) AI 的區(qū)別之一。

  • 記憶: 存儲和檢索情境信息或過去事件的摘要,包括短期記憶和長期記憶,防止遺忘關(guān)鍵信息或重復失敗實驗。

  • 通信: 智能體之間、智能體與人類、智能體與工具之間的高效溝通,對于 Agentic AI 的整體工作質(zhì)量至關(guān)重要。

當前 Agentic AI 在生物醫(yī)學中的應用

目前,Agentic AI 已應用于生物醫(yī)學研究的多個環(huán)節(jié)——

  • 文獻綜述: 自動化文獻檢索和信息提取。

  • 假設生成: 基于多輪文獻檢索生成并持續(xù)優(yōu)化生物醫(yī)學假設,評估其相關(guān)性、新穎性、可行性和意義。

  • 實驗設計: 理解實驗室協(xié)議和專業(yè)分析工具并設計實驗。

  • 數(shù)據(jù)分析: 執(zhí)行端到端的分析流程,自動化編程,或優(yōu)化領域特定的計算方法。

  • 端到端研究周期: 協(xié)調(diào)多個智能體完成從目標設定到發(fā)現(xiàn)的全流程研究,例如,Virtual Lab 系統(tǒng)成功設計了新的 SARS-CoV-2 納米抗體。


Agentic AI 系統(tǒng)在各類生物醫(yī)學研究任務中的應用


生物醫(yī)學研究各個領域(功能基因組學、基因組編輯、藥物發(fā)現(xiàn)、空間基因組學、蛋白組學)中的 Agentic AI 系統(tǒng)案例

生物醫(yī)學應用中的挑戰(zhàn)

  • 數(shù)據(jù): 格式、維度和異質(zhì)性帶來的處理與整合困難。

  • 隱私與安全: 處理敏感患者數(shù)據(jù)時需滿足高標準,防范大語言模型的數(shù)據(jù)記憶和泄露風險。

  • 成本、能源與硬件: 訓練和推理的高計算成本與能源消耗。

  • 公平性: 確保模型在不同群體中性能等效,避免加劇醫(yī)療不平等。

  • 可靠性: 系統(tǒng)可能因架構(gòu)缺陷、智能體協(xié)作不力或研究問題定義不清而失敗。

未來展望

作者們預計,Agentic AI 將從專門的單一智能體系統(tǒng)向通用的多智能體系統(tǒng)演進,并強調(diào)了適應性自主的重要性——Agentic AI 應能有效理解何時需要就模糊或高風險任務咨詢?nèi)祟悓<遥亲非笸耆灾?。社區(qū)開發(fā)與產(chǎn)業(yè)驅(qū)動的系統(tǒng)各有優(yōu)劣,未來的混合協(xié)作模式可能結(jié)合雙方優(yōu)勢。最終,人類研究者在設計、實施和管理 Agentic AI 方面仍將扮演不可或缺的角色,確保其科學有效性、倫理合規(guī)和負責任部署。

論文鏈接

https://www.nature.com/articles/s41587-026-03035-1


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