2026年4月7日，中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心主任袁鈞瑛院士和單冰副研究員 在Vita期刊在線發(fā)表了題為Distinct necrotic protein cleavages define terminal events in necrosis的研究論文。該研究在單細(xì)胞水平上對(duì)細(xì)胞死亡機(jī)理進(jìn)行了研究，意外地發(fā)現(xiàn)在同一種促細(xì)胞死亡的條件下，細(xì)胞會(huì)選擇進(jìn)行凋亡或者壞死，把細(xì)胞死亡的機(jī)理調(diào)控提到了單細(xì)胞的水平。該工作進(jìn)一步系統(tǒng)研究了細(xì)胞壞死的執(zhí)行機(jī)理，意外地發(fā)現(xiàn)原來(lái)認(rèn)為的細(xì)胞壞死的執(zhí)行機(jī)理并不足以導(dǎo)致細(xì)胞死亡：細(xì)胞壞死的最終步驟包括胞外蛋白酶介入。由胞外蛋白酶參加的大規(guī)模且特異性的蛋白水解，導(dǎo)致了壞死細(xì)胞中會(huì)發(fā)生類似細(xì)胞凋亡由caspase介導(dǎo)的蛋白水解，而且這些胞外蛋白酶 發(fā)揮 了促進(jìn)壞死細(xì)胞清除、抑制自身免疫中的關(guān)鍵作用。基于這一發(fā)現(xiàn)，研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步開(kāi)發(fā)了能夠特異性識(shí)別壞死細(xì)胞蛋白切割產(chǎn)物的單克隆抗體，為在病理樣本中精準(zhǔn)識(shí)別和研究壞死細(xì)胞提供了全新的分子工具。

壞死細(xì)胞膜破裂觸發(fā)胞外蛋白酶介導(dǎo)的特異性蛋白切割

過(guò)去對(duì)壞死性細(xì)胞死亡的研究，主要聚焦于膜破裂后釋放出的損傷相關(guān)分子模式（DAMPs）、炎癥因子和趨化因子對(duì)組織微環(huán)境及免疫系統(tǒng)的影響，而較少關(guān)注膜破裂之后，組織液或血液中的物質(zhì)是否會(huì)反向進(jìn)入死亡細(xì)胞，并繼續(xù)參與調(diào)控其終末命運(yùn)。

針對(duì)這一問(wèn)題，研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，在多種壞死性細(xì)胞死亡（包括程序性壞死，鐵死亡和細(xì)胞焦亡）中普遍存在一個(gè)共同現(xiàn)象：細(xì)胞膜破裂后，原本存在于組織液、血液或細(xì)胞外環(huán)境中的蛋白酶可進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部，進(jìn)而誘導(dǎo)一系列壞死特異性的蛋白切割事件。通過(guò)新生N端標(biāo)記蛋白質(zhì)質(zhì)譜（neo-N-terminomic）分析，研究人員系統(tǒng)繪制了壞死細(xì)胞的切割位點(diǎn)圖譜。結(jié)果顯示，這些切割主要發(fā)生在精氨酸（Arg）和賴氨酸（Lys）殘基的碳端，呈現(xiàn)出明顯不同于凋亡中caspase切割的位點(diǎn)偏好。

這些切割事件廣泛分布于多個(gè)細(xì)胞區(qū)室，包括細(xì)胞核、細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)、高爾基體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等。盡管不同細(xì)胞系、不同壞死方式以及不同組織樣本間存在一定的異質(zhì)性，但該研究仍鑒定到一系列在多種條件下保守存在的底物及切割位點(diǎn)。這表明，壞死性蛋白切割并非膜破裂后的隨機(jī)性降解，而是具有底物偏好和位點(diǎn)選擇性的分子事件，提示其可能承擔(dān)特定的生理功能。

圖1. 胞外蛋白酶主要識(shí)別并切割精氨酸（Arg）和賴氨酸（Lys）殘基

壞死性蛋白切割調(diào)控壞死細(xì)胞清除與免疫原性

細(xì)胞凋亡的發(fā)生由caspase家族主導(dǎo)，其特點(diǎn)是細(xì)胞膜保持完整，內(nèi)容物不泄露。凋亡細(xì)胞中caspase的激活不僅執(zhí)行了細(xì)胞死亡，同時(shí)通過(guò)調(diào)節(jié)磷脂酰絲氨酸（PS）外翻、膜出泡和凋亡小體形成、基因組DNA降解等過(guò)程，保證了凋亡細(xì)胞的清除與降解。而壞死則以細(xì)胞膜完整性喪失為特征，但目前我們?nèi)圆磺宄乃兰?xì)胞具體是如何實(shí)現(xiàn)細(xì)胞清除的。

該研究發(fā)現(xiàn)，使用亮肽素抑制壞死蛋白切割可顯著抑制程序性壞死、鐵死亡和細(xì)胞焦亡過(guò)程中細(xì)胞基因組DNA的降解。進(jìn)一步的體外吞噬實(shí)驗(yàn)和體內(nèi)腹腔注射實(shí)驗(yàn)表明，當(dāng)壞死性蛋白切割被抑制后，吞噬細(xì)胞對(duì)壞死細(xì)胞、尤其是對(duì)核碎片的清除效率明顯下降。更重要的是，這種清除障礙并非單純影響殘骸處理，而會(huì)進(jìn)一步誘發(fā)病理后果，使受試小鼠出現(xiàn)針對(duì)自身蛋白的抗體升高以及脾腫大等自身免疫相關(guān)表型。

這些結(jié)果表明，膜破裂后由胞外蛋白酶介導(dǎo)的壞死性切割，并不是壞死后的伴隨現(xiàn)象，而是機(jī)體高效、安全清除壞死細(xì)胞殘骸的重要機(jī)制。該研究因此將壞死終末階段從傳統(tǒng)意義上的“被動(dòng)瓦解”，推進(jìn)為一個(gè)具有明確功能意義的主動(dòng)清理過(guò)程。

圖2. 胞外蛋白酶進(jìn)入壞死細(xì)胞后促進(jìn)DNA降解與清除，并避免自身免疫反應(yīng)

單細(xì)胞視角揭示細(xì)胞死亡方式的異質(zhì)性與研究新范式

傳統(tǒng)細(xì)胞死亡研究多基于群體水平分析，即通過(guò)整體樣本的分子變化來(lái)定義某一刺激誘導(dǎo)的死亡方式。然而，這種策略容易掩蓋單細(xì)胞層面的命運(yùn)異質(zhì)性。

該研究團(tuán)隊(duì)利用改進(jìn)的超高分辨率三維光學(xué)衍射斷層掃描（super resolution optical diffraction tomography,ODT）技術(shù)，在單細(xì)胞尺度上動(dòng)態(tài)觀察細(xì)胞死亡進(jìn)程。研究人員在細(xì)胞焦亡模型中發(fā)現(xiàn)，即便是在同一刺激條件下，細(xì)胞群體內(nèi)部也并非沿單一路徑死亡：一部分細(xì)胞表現(xiàn)出經(jīng)典凋亡樣形態(tài)，另一部分則表現(xiàn)出GSDMD介導(dǎo)的膜破裂壞死樣死亡。與之對(duì)應(yīng)，在分子層面，研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)檢測(cè)到caspase介導(dǎo)的凋亡性蛋白切割和胞外蛋白酶介導(dǎo)的壞死性蛋白切割。所以，細(xì)胞焦亡是由細(xì)胞凋亡和細(xì)胞壞死來(lái)共同執(zhí)行的死亡形式。

進(jìn)一步利用識(shí)別壞死切割新生末端的抗體ABHD16A-C進(jìn)行分析，研究人員在LPS/Nigericin誘導(dǎo)的細(xì)胞焦亡中觀察到至少三類細(xì)胞：一類為caspase-3不激活但ABHD16A-C陽(yáng)性的細(xì)胞，代表GSDMD介導(dǎo)的壞死樣細(xì)胞；一類為caspase-3激活但ABHD16A-C陰性的細(xì)胞，代表凋亡細(xì)胞；還有一類同時(shí)具有兩類標(biāo)志，代表凋亡后的繼發(fā)性壞死細(xì)胞。該結(jié)果說(shuō)明，即使在單一刺激下，不同細(xì)胞也可能進(jìn)入不同死亡軌道，而群體平均信號(hào)往往會(huì)將這些本質(zhì)不同的過(guò)程混合在一起。

這一發(fā)現(xiàn)提示，在研究復(fù)雜生理和病理?xiàng)l件下的細(xì)胞死亡時(shí)，不能僅憑群體水平的總體效應(yīng)簡(jiǎn)單定義死亡類型，而需要結(jié)合單細(xì)胞動(dòng)態(tài)觀察和終末標(biāo)志物識(shí)別，重新理解細(xì)胞死亡的異質(zhì)性與層級(jí)性。因此，該研究不僅揭示了壞死終末階段的新機(jī)制，也為細(xì)胞死亡研究提供了從“群體分類”走向“單細(xì)胞命運(yùn)解析”的新范式。

圖3. LPS/Nigericin誘導(dǎo)的細(xì)胞焦亡中，單細(xì)胞層面呈現(xiàn)凋亡與壞死兩種死亡方式

論文的通訊作者是中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心主任袁鈞瑛院士和單冰副研究員。第一作者是中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心李甘泉博士。中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生物與化學(xué)交叉研究中心張耀陽(yáng)研究員給N端標(biāo)記蛋白質(zhì)譜分析提供寶貴建議，北京大學(xué)陳良怡研究員對(duì)超分辨率ODT顯微成像技術(shù)的使用提供了寶貴幫助，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院李佩盈研究員提供了寶貴的病人樣本。

原文鏈接：https://www.vita-journal.com/vita/EN/10.15302/vita.2026.04.0023

制版人： 十一

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