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Nature發(fā)表!破解鼻咽癌高發(fā)之謎:病毒與宿主“里應(yīng)外合”

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4月15日,中山大學(xué)腫瘤防治中心徐淼教授團(tuán)隊(duì),聯(lián)合新加坡基因組研究所劉建軍教授、中科院動(dòng)物研究所翟巍巍教授、哥倫比亞大學(xué)劉中華教授在國際頂級(jí)期刊《自然》(Nature)上發(fā)表了題為《EBV毒株與宿主HLA互作驅(qū)動(dòng)鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)》的研究成果。該研究首次揭示,鼻咽癌的高發(fā)并非由高危EB病毒或宿主遺傳背景單一因素決定,而是兩者“里應(yīng)外合”協(xié)同作用的結(jié)果——特定宿主基因型與高危EB病毒亞型互作,使發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)飆升17倍,從病毒-宿主互作的全新角度,解開了華南地區(qū)鼻咽癌高發(fā)的“地域魔咒”。


論文要點(diǎn)速覽:

高發(fā)之謎:為什么EB病毒幾乎人人感染,鼻咽癌卻在華南等少數(shù)地區(qū)高發(fā)?這一現(xiàn)象長期困擾科學(xué)界。

兩條線索:圍繞鼻咽癌高發(fā),過去的研究逐漸積累出兩條重要線索:一條指向高危EB病毒亞型,另一條指向宿主遺傳易感性。

新的推進(jìn):最新研究揭示,真正關(guān)鍵的,或許不是單獨(dú)看病毒或宿主哪一方更“危險(xiǎn)”,而是二者相遇時(shí)如何互作,并由此決定宿主免疫系統(tǒng)能否有效識(shí)別和控制高危病毒。

風(fēng)險(xiǎn)組合:風(fēng)險(xiǎn)最高的,并不是單獨(dú)攜帶高危EB病毒,或單獨(dú)具有某種易感背景,而是高危EB病毒與特定宿主HLA背景形成了高風(fēng)險(xiǎn)組合。

免疫機(jī)制:這種風(fēng)險(xiǎn)差異的背后,是一個(gè)具體的免疫學(xué)機(jī)制:宿主能否有效呈遞病毒抗原,并激活特異T細(xì)胞識(shí)別和控制高危EB病毒感染細(xì)胞。

區(qū)域格局:華南高發(fā)并非由單一因素造成,而是高危EB病毒在當(dāng)?shù)馗患⑴c之發(fā)生關(guān)鍵互作的宿主HLA背景也在當(dāng)?shù)馗患?,二者共同塑造了華南鼻咽癌的高風(fēng)險(xiǎn)格局。

防控意義:這項(xiàng)研究的意義,不只是解釋鼻咽癌為何高發(fā)于華南,更在于進(jìn)一步回答了“哪些宿主對高危EB病毒致癌更易感”以及“何種生物學(xué)過程是控制EB病毒致癌的關(guān)鍵”,為高危人群識(shí)別、早診早治和疫苗研發(fā)提供了更清晰的方向。

謎題:鼻咽癌為何“青睞”華南?

鼻咽癌是極具地域特征的惡性腫瘤。華南地區(qū)僅占全球2%人口,卻負(fù)擔(dān)超過40%的全球新發(fā)病例。這一“地域魔咒”困擾科學(xué)界已久。

EB病毒是鼻咽癌的重要致病因素。在高發(fā)地區(qū),幾乎所有鼻咽癌腫瘤組織均為EB病毒陽性,并持續(xù)表達(dá)病毒編碼的蛋白或RNA。那么,鼻咽癌在華南地區(qū)高發(fā),究竟是因?yàn)槿A南人群存在遺傳易感背景,還是當(dāng)?shù)亓餍兄呶5腅B病毒亞型?

為了尋找鼻咽癌高發(fā)的病因,中腫團(tuán)隊(duì)于2002年和2010年在《自然·遺傳學(xué)》(Nature Genetics)上發(fā)表兩項(xiàng)研究成果,分別鑒定出鼻咽癌家系和散發(fā)人群的基因易感位點(diǎn),從遺傳學(xué)角度闡明了鼻咽癌發(fā)病因素。然而,一個(gè)長期未解的關(guān)鍵問題是:既往發(fā)現(xiàn)的遺傳易感因素和環(huán)境暴露因素,通常僅增加鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)1-3倍,仍不足以解釋華南地區(qū)的聚集性高發(fā)。與此同時(shí),EB病毒雖是鼻咽癌發(fā)生發(fā)展的核心病因,但是全球人群普遍感染,而鼻咽癌卻只在特定地區(qū)高發(fā)。這一“廣泛感染”與“局部高發(fā)”之間的矛盾,提示在遺傳和環(huán)境之外,可能還存在尚未被識(shí)別的關(guān)鍵致病因素,也由此引出了一個(gè)重要科學(xué)問題:在鼻咽癌高發(fā)區(qū),是否存在特異EB病毒亞型,從而導(dǎo)致鼻咽癌的發(fā)生?

破局:鎖定高危病毒,卻非唯一答案

圍繞這一問題,徐淼團(tuán)隊(duì)聯(lián)合新加坡基因組研究所劉建軍、中科院動(dòng)物研究所翟巍巍、哥倫比亞大學(xué)劉中華和福建醫(yī)科大學(xué)葉為民等團(tuán)隊(duì),開展了持續(xù)近十年的系統(tǒng)合作研究。

2019年,研究團(tuán)隊(duì)率先鑒定出鼻咽癌致瘤高危EB病毒亞型BALF2-CCT,成果發(fā)表在《自然·遺傳學(xué)》雜志。該亞型是目前已知最強(qiáng)鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)因素,可增加約7倍的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。更為重要的是,其地理分布與鼻咽癌發(fā)病格局高度一致:華南地區(qū)攜帶率高達(dá)35-40%,而北方地區(qū)不到5%,歐美幾乎沒有。該發(fā)現(xiàn)揭示了高危EB病毒感染是華南地區(qū)鼻咽癌高發(fā)的主要驅(qū)動(dòng)因素,從病毒層面解釋了“EB病毒普遍感染、鼻咽癌局部高發(fā)”的關(guān)鍵悖論。

然而,高危病毒雖在華南人群中廣泛傳播,卻僅有少數(shù)感染者最終進(jìn)展為鼻咽癌,提示高危EB病毒本身并不足以決定發(fā)病,其致癌效應(yīng)可能取決于特定宿主遺傳背景。然而,宿主與病毒風(fēng)險(xiǎn)因素如何協(xié)同致癌長期不清楚。基于上述發(fā)現(xiàn),研究進(jìn)一步提出本領(lǐng)域另一個(gè)亟待突破的核心科學(xué)問題:高危EB病毒究竟更易導(dǎo)致哪些宿主發(fā)???決定其致癌易感性的宿主—病毒互作機(jī)制是什么?

解密:病毒與宿主“里應(yīng)外合”,風(fēng)險(xiǎn)飆升17倍

這一問題是疾病相關(guān)宿主-病原互作研究中極具挑戰(zhàn)性的關(guān)鍵問題。研究不僅需要配對的宿主-EB病毒基因組信息,更要從約3Gb的人類基因組與170kb的 EB病毒全基因組的大規(guī)模變異組合中,識(shí)別真正具有致病意義的互作位點(diǎn)。

研究團(tuán)隊(duì)利用先進(jìn)的廣義線性混合模型,創(chuàng)新性地建立宿主-EB病毒雙基因組互作分步掃描的分析框架,突破了病毒和宿主復(fù)雜遺傳結(jié)構(gòu)混雜和雙基因組高維掃描帶來的方法學(xué)瓶頸,最終鑒定出決定鼻咽癌易感性的核心高危EB病毒-宿主HLA基因互作對,并在分子水平進(jìn)一步解析其作用機(jī)制。

研究發(fā)現(xiàn),鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)由HLA-A等位基因和高危EB病毒的85841位點(diǎn)A>G 變異互作共同決定,并非由宿主或病毒亞型單一因素決定。在功能層面,該高危EB病毒變異通過改變EBNA3B抗原表位(VVI表位第9位氨基酸Q>R),決定其能否被HLA-A*11:01有效呈遞,并直接影響CD8 T細(xì)胞對高危EB病毒感染細(xì)胞的識(shí)別和殺傷效率。

通俗地說,HLA-A*11:01就像一把“鑰匙”,能幫助免疫系統(tǒng)識(shí)別被病毒感染的細(xì)胞;高危EB病毒則像一把“變形的鎖”,只有特定鑰匙才能打開;當(dāng)“變形的鎖”遇到“不匹配的鑰匙”,免疫系統(tǒng)就無法識(shí)別并清除感染細(xì)胞。

這一“病毒-宿主”互作效應(yīng),導(dǎo)致感染高危病毒且缺失A*11:01的“雙重風(fēng)險(xiǎn)因素?cái)y帶者”,其鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)比基線提高約17倍,遠(yuǎn)大于單一高危病毒或遺傳風(fēng)險(xiǎn)的簡單加和。


該研究回答了“高危病毒-宿主互作決定發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的機(jī)制是什么”以及“什么樣的宿主感染高危病毒后更易發(fā)病”,為高效的高危人群篩查奠定理論基礎(chǔ)。

溯源:高危病毒為何在華南富集?

研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步追溯高危EB病毒的演化起源,發(fā)現(xiàn)約4000年前,中國南北方EB病毒譜系在華南發(fā)生重組,形成高危型中最主要一支。這一病毒表現(xiàn)出適應(yīng)性優(yōu)勢并發(fā)生克隆擴(kuò)散,目前已感染約35%華南人群,成為該地區(qū)感染率最高的亞型(相關(guān)成果2024年發(fā)表于National Science Review)。

更重要的是,高危EB病毒與互作HLA-A亞型在華南共富集,從群體層面強(qiáng)化了“病毒-宿主”互作的遺傳效應(yīng),共同塑造了華南人群鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)結(jié)構(gòu)。

展望:從“事后治療”邁向“事前預(yù)防”

開發(fā)疫苗是預(yù)防病毒感染腫瘤最有效、經(jīng)濟(jì)的手段。EB病毒是人類于1964年發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)致瘤病毒,該病毒結(jié)構(gòu)和生活周期復(fù)雜,人類對其十分易感。明確預(yù)防哪種病毒亞型、保護(hù)哪些高危人群對研發(fā)疫苗預(yù)防鼻咽癌十分重要。

研究團(tuán)隊(duì)的一系列研究,首次鑒別出驅(qū)動(dòng)鼻咽癌高發(fā)的高危EB病毒亞型,為今后疫苗研發(fā)提供了重要依據(jù);另一方面,通過識(shí)別對高危病毒致癌更易感的宿主特征,聯(lián)合高危病毒與宿主易感因素,可實(shí)現(xiàn)鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)分層與高危人群的識(shí)別。

未來,對識(shí)別出的高危人群開展定期隨訪和持續(xù)監(jiān)測,是實(shí)現(xiàn)鼻咽癌早診早治的基礎(chǔ);同時(shí),這部分人群也是未來疫苗接種和精準(zhǔn)預(yù)防策略實(shí)施的重點(diǎn)目標(biāo)人群。

中山大學(xué)腫瘤防治中心徐淼教授、新加坡基因組研究所劉建軍教授、中科院動(dòng)物研究所翟巍巍教授、哥倫比亞大學(xué)劉中華教授為該論文的共同通訊作者。中山大學(xué)腫瘤防治中心陳燕洪博士、梁婧彤博士為該論文的共同第一作者。該研究獲得國家自然科學(xué)基金和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃支持。獲得福建醫(yī)科大學(xué)葉為民、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院李貴登、上??萍即髮W(xué)李哲、西湖大學(xué)楊劍、中山大學(xué)腫瘤防治中心高嵩和曹雨露等多位專家的寶貴指導(dǎo)。

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