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柳葉刀子刊:評估AI預(yù)測模型性能的常見指標(biāo)和可視化圖形

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2025年12月,《Lancet Digital Health》發(fā)表了一篇文章“Evaluation of performance measures in predictive artificial intelligence models to support medical decisions: overview and guidance”,對評估AI預(yù)測模型性能的幾大類指標(biāo)進行了總結(jié)。

在前一篇推文中,我們介紹了幾大類指標(biāo)的概念:1)區(qū)分度(discrimination)、2)校準(zhǔn)度(calibration)、3)整體性能(overall performance)、4)分類(classification)、5)臨床效用(clinical utility)。

詳見:

接下來仍以ADNEX模型為例(該模型預(yù)測女性卵巢腫瘤的惡性概率),具體聊一聊這些指標(biāo)以及相應(yīng)的可視化圖形。所有R和Python代碼,均已公開于GitHub代碼倉庫,鏈接如下:

https://github.com/benvancalster/PerfMeasuresOverview

前文提到,性能指標(biāo)應(yīng)具備兩項關(guān)鍵特征(1)該指標(biāo)應(yīng)為“恰當(dāng)”(proper)的指標(biāo);(2)該指標(biāo)應(yīng)明確聚焦于是反映統(tǒng)計價值還是決策分析價值。不具備第一項特征的指標(biāo)不可信賴,缺乏第二項特征的指標(biāo)則含義模糊、難以解釋。下面在討論各指標(biāo)時,會提及到這兩項特征。

區(qū)分度(Discrimination)

常見的區(qū)分度指標(biāo)是一致性概率(concordance probability)或C統(tǒng)計量(C-statistic。對于二分類結(jié)局,C統(tǒng)計量等于受試者工作特征曲線下面積(AUROC),但當(dāng)事件發(fā)生率遠(yuǎn)遠(yuǎn)偏離0.5時,一些研究者建議不要使用AUROC。有觀點認(rèn)為,在罕見事件時,AUROC具有誤導(dǎo)性或過于樂觀。

作為ROC曲線及AUROC的替代方案,常推薦使用精確率–召回率曲線(PR曲線)及其曲線下面積(AUPRC)。另一種替代AUROC的指標(biāo)是部分AUROC(pAUROC),關(guān)注ROC曲線中特異度或靈敏度達到某個最低可接受水平的部分。AUROC、AUPRC和pAUROC均為“半恰當(dāng)(semi-proper)”指標(biāo)。

區(qū)分能力對預(yù)測性AI模型至關(guān)重要,但僅憑AUROC一項指標(biāo)不足以判定一個模型是否優(yōu)秀或?qū)嵱?/b>。使用PR曲線或ROC曲線進行可視化展示是可以接受的,但根據(jù)本文作者的經(jīng)驗,這些圖所提供的信息并不比匯總性指標(biāo)(如AUROC)或相關(guān)的臨床效用指標(biāo)(如凈效益net benefit)更有價值。

下圖1展示了本案例研究(ADNEX模型)的ROC曲線和PR曲線,基于“靈敏度低于0.8不可接受”這一觀點(但該觀點未經(jīng)證實),展示出了pAUROC。

ADNEX模型的AUROC為0.91(95%CI 0.89–0.93),AUPRC為0.89(95%CI 0.86–0.91)。去掉靈敏度低于0.8的部分后,pAUROC為0.14(95%CI 0.13–0.15)。




圖1. ADNEX模型的ROC曲線(A)、PR曲線(B)和pAUROC(C)

校準(zhǔn)度(Calibration)

統(tǒng)計學(xué)和機器學(xué)習(xí)文獻提過多種評估模型校準(zhǔn)度的方法,這些方法可分為三個逐級嚴(yán)格的層級:均值校準(zhǔn)(mean calibration)、弱校準(zhǔn)(weak calibration)、中度校準(zhǔn)(moderate calibration),前兩個層級主要源自統(tǒng)計學(xué)文獻。目前,關(guān)于第四個層級“強校準(zhǔn)(strong calibration)”的量化研究仍在進行中。

均值校準(zhǔn)(也稱“整體校準(zhǔn)”,calibration-in-the-large)用于評估模型預(yù)測概率的均值是否等于數(shù)據(jù)集觀察到的實際事件患病率。衡量整體校準(zhǔn)的兩個常用指標(biāo)是觀察值與預(yù)期值之比(O/E ratio)和校準(zhǔn)截距(calibration intercept)。

在本案例中,ADNEX模型的O/E比為1.23(95%CI:1.17–1.29),表明實際觀察到的事件數(shù)比模型預(yù)期高23%。校準(zhǔn)截距為0.81(95%CI:0.62–1.01),提示模型平均而言低估了事件發(fā)生率(截距>0)。相比校準(zhǔn)截距,O/E比具有更直觀的解釋意義。

當(dāng)一個模型的整體校準(zhǔn)良好,且預(yù)測概率的離散程度(即分布范圍)不過大也不過小(通過校準(zhǔn)斜率[calibration slope]量化),該模型被認(rèn)為具有弱校準(zhǔn)。若預(yù)測概率離散度過大,其預(yù)測概率值會過于接近0或1(校準(zhǔn)斜率<1);若離散度過小,則預(yù)測值會集中在整體患病率附近(斜率>1)。在內(nèi)部驗證中,校準(zhǔn)斜率小于1可能提示模型存在過擬合風(fēng)險。在本案例研究中,ADNEX模型的校準(zhǔn)斜率為0.93(95%CI:0.83–1.05),表明預(yù)測概率的離散程度基本合適。

中度校準(zhǔn)意味著:對于所有預(yù)測概率為x的個體,實際事件的發(fā)生率也恰好等于x。評估中度校準(zhǔn)最常用的方法是繪制校準(zhǔn)圖(calibration plot),也稱為可靠性圖(reliability diagram)。校準(zhǔn)圖可通過對個體分組或使用平滑法(smoothing)生成。

圖2展示了本案例研究中使用的兩種校準(zhǔn)圖:一種基于等量分十組,另一種采用局部加權(quán)回歸平滑法(loess)進行平滑處理。兩條曲線大部分位于對角線的上方,表明在整個預(yù)測概率范圍內(nèi),模型系統(tǒng)性低估了事件風(fēng)險。一個可能的原因是,在驗證研究的六個參與中心中,有五個是三級中心,因此惡性腫瘤的實際患病率較高。需要注意的是,分組校準(zhǔn)圖無法全面評估中度校準(zhǔn),因為預(yù)測概率差異很大的個體仍可能被歸入同一組。


圖2. ADNEX模型的校準(zhǔn)圖

已有研究提出了一些針對校準(zhǔn)圖的匯總指標(biāo),例如針對分組校準(zhǔn)圖的期望校準(zhǔn)誤差(Expected Calibration Error, ECE),針對平滑校準(zhǔn)圖的估計校準(zhǔn)指數(shù)(Estimated Calibration Index, ECI)和整合校準(zhǔn)指數(shù)(Integrated Calibration Index, ICI)。

然而,與Hosmer–Lemeshow檢驗等統(tǒng)計學(xué)檢驗類似,這些匯總指標(biāo)無法說明校準(zhǔn)偏差方向,即模型是系統(tǒng)性高估還是低估風(fēng)險。此外,ECE、ECI和ICI的數(shù)值依賴于所采用的分組或平滑方法,并且在統(tǒng)計一致性方面存在局限性。目前,學(xué)界正在研究更優(yōu)的匯總指標(biāo)。因此,包含置信區(qū)間的校準(zhǔn)圖是評估校準(zhǔn)性能的關(guān)鍵工具,因其能夠直觀展示在不同預(yù)測風(fēng)險水平下的校準(zhǔn)表現(xiàn)。

上述所有校準(zhǔn)指標(biāo)均為半恰當(dāng)(semi-proper)指標(biāo),聚焦于統(tǒng)計性能。

整體性能(Overall performance)

整體性能的基本評估指標(biāo)包括基于似然函數(shù)的指標(biāo),如對數(shù)損(logloss,也稱為交叉熵?fù)p失)以及Brier評分(Brier score)。

通過與零模型(null model)比較來表達模型性能的指標(biāo),包括標(biāo)準(zhǔn)化Brier評分(scaled Brier score,也稱預(yù)測準(zhǔn)確度指數(shù)),以及用于測量解釋變異比例的R2類指標(biāo),例如McFadden R2、Cox–Snell R2和Nagelkerke R2。

較少使用的整體性能指標(biāo)還包括區(qū)分度斜率(discrimination slope,也稱判別系數(shù))和平均絕對預(yù)測誤差(mean absolute prediction error,MAPE)。

對數(shù)似然(loglikelihood)、對數(shù)損失(logloss)以及Brier評分屬于“嚴(yán)格恰當(dāng)”(strictly proper)的指標(biāo);標(biāo)準(zhǔn)化Brier評分和各類R2指標(biāo)屬于“漸近嚴(yán)格恰當(dāng)”(asymptotically strictly proper)的指標(biāo)(樣本量較大時,例如超過100,是嚴(yán)格恰當(dāng)?shù)模?;區(qū)分度斜率和平均絕對預(yù)測誤差屬于不恰當(dāng)(improper)的指標(biāo)。上述所有整體性能指標(biāo)均聚焦于統(tǒng)計性能(模型的第二個關(guān)鍵特征,見上文所述)。

整體性能的可視化,通常是分別展示事件組和非事件組預(yù)測概率的分布情況。圖3展示了ADNEX模型的小提琴圖(violin plots):良性腫瘤患者絕大多數(shù)具有極低的惡性風(fēng)險預(yù)測概率;惡性腫瘤患者的預(yù)測概率大多處于中至較高水平,且分布更為分散。


圖3. 基于ADNEX模型惡性風(fēng)險預(yù)測概率的小提琴圖和散點圖

分類指標(biāo)

(Classification measures)

本案例使用的ADNEX模型推薦的常用閾值為10%。在此閾值下,將578名患者分類為高風(fēng)險,其中414名確實患有惡性腫瘤(即真陽性),而164名實際為良性腫瘤(假陽性)。模型將剩余的316名患者分類為低風(fēng)險,其中296名患者確實為良性腫瘤(真陰性),20名實際為惡性腫瘤(假陰性)。

分類指標(biāo)分為匯總指標(biāo)(summary measures)和描述性部分指標(biāo)(descriptive partial measures)。常見的部分指標(biāo)包括靈敏度(也稱為召回率recall)、特異度、陽性預(yù)測值(PPV,也稱為精確率precision)和陰性預(yù)測值(NPV)。靈敏度和特異度是基于實際結(jié)果的分類準(zhǔn)確性,但在預(yù)測時實際結(jié)果是未知的;PPV和NPV更具臨床相關(guān)性。匯總指標(biāo)包括分類準(zhǔn)確率、平衡準(zhǔn)確率約登指數(shù)、Kappa診斷比值比、F1、Matthew相關(guān)系數(shù)(MCC)

F1有點類似AUPRC,且存在一些共同的問題:(1) F1忽略了真陰性的問題;(2) F1沒有直觀的解釋;(3) 僅通過交換結(jié)果標(biāo)簽(將1變?yōu)?,0變?yōu)?),F(xiàn)1的絕對值就會發(fā)生變化。MCC同樣也沒有直觀的解釋。

在給定的決策閾值t下,所有的分類指標(biāo)都屬于不恰當(dāng)(improper)的指標(biāo)。某些分類指標(biāo)(如平衡準(zhǔn)確率、約登指數(shù)和F1)在t=0.5(分類準(zhǔn)確率)或t等于真實患病率時是半恰當(dāng)(semi-proper)的指標(biāo),但這些閾值t很少是最具臨床相關(guān)性的閾值。F1是唯一一個沒有明確關(guān)注統(tǒng)計性能的匯總指標(biāo),因為它混合了分類效能與臨床效用。

與分類性能相關(guān)的圖表包括ROC曲線和PR曲線,這些圖展示了在所有可能的決策閾值下的部分分類指標(biāo)。這些圖的局限性在于并不容易直接觀察到閾值(見圖1)。另一種圖是分類圖(classification plot)(圖4),在x軸上展示決策閾值,在y軸上展示一個或多個分類指標(biāo)。


圖4. ADNEX模型的分類圖

ADNEX模型在10%的閾值下,顯示出分類準(zhǔn)確率為0.79(95% CI 0.77–0.82),F(xiàn)1為0.82(0.79–0.84),MCC為0.63(0.58–0.67)。

臨床效用(Clinical utility)

根據(jù)經(jīng)典的決策分析理論,臨床效用關(guān)注的是基于模型分類所做出的決策質(zhì)量,這些分類需要對應(yīng)于臨床相關(guān)的閾值。為了評估效用,要明確考慮誤分類成本。在醫(yī)療領(lǐng)域的預(yù)測研究中,用于評估臨床效用最常用的指標(biāo)是凈效益(net benefit)。標(biāo)準(zhǔn)化凈效益等于凈效益除以患病率,最大值為1。

凈效益根據(jù)誤分類成本設(shè)定決策閾值。設(shè)定誤分類成本并不容易,關(guān)于成本應(yīng)該是什么,還存在爭議。因此,凈效益或標(biāo)準(zhǔn)化凈效益會在一系列合理的決策閾值范圍內(nèi)繪制決策曲線。凈效益和標(biāo)準(zhǔn)化凈效益屬于半恰當(dāng)指標(biāo)。

還有一個指標(biāo)是預(yù)期成本(expected cost)。與凈效益不同,預(yù)期成本關(guān)注的是,給定誤分類成本時讓總成本最小化的決策閾值,預(yù)期成本也是半恰當(dāng)指標(biāo)。如果把成本標(biāo)準(zhǔn)化為總和為1,可以繪制出一系列標(biāo)準(zhǔn)化的假陽性和假陰性成本的預(yù)期成本圖。

根據(jù)決策理論,關(guān)鍵是要檢查模型是否比參考策略(即治療所有的人或任何人都不治療)具有更好的效用,如果更好的話,還要和其他競爭模型比較。在所有合理的決策閾值范圍內(nèi),ADNEX的(標(biāo)準(zhǔn)化)凈效益均優(yōu)于參考策略(圖5A-B)。預(yù)期成本曲線也給出了相同的結(jié)果(圖5C)。當(dāng)t=0.1時,模型的凈效益為0.44。假陰性的標(biāo)準(zhǔn)化成本為0.9,預(yù)期成本在t=0.06時最小化至0.35。




圖5. ADNEX模型的決策曲線:凈效益、標(biāo)準(zhǔn)化凈效益和預(yù)期成本

總結(jié)

本文評估了用于醫(yī)療實踐的預(yù)測性AI模型在五個性能維度(區(qū)分度、校準(zhǔn)度、整體性能、分類性能和臨床效用)的32項指標(biāo)。在驗證預(yù)測模型性能時,要避免使用那些不恰當(dāng)(improper)的指標(biāo)(共13項),或那些未能明確聚焦于統(tǒng)計性能或決策分析性能的指標(biāo)(3項;見表1)。其中,F1是唯一同時違反上述兩項特征的指標(biāo)。

不恰當(dāng)指標(biāo)可能誤導(dǎo)研究者,而那些在未妥善考慮誤分類成本的情況下,將統(tǒng)計性能與決策分析性能混為一談的指標(biāo)則具有模糊性,應(yīng)被專門用于評估臨床效用的指標(biāo)所取代。

表1. 在驗證用于臨床決策的預(yù)測模型時,常用的各類指標(biāo)與圖表的建議

指標(biāo)

建議

區(qū)分度(Discrimination)

AUROC

該指標(biāo)量化模型的區(qū)分度,是統(tǒng)計模型性能的關(guān)鍵組成部分。

AUPRC和pAUROC

不建議

這些指標(biāo)試圖超越單純的統(tǒng)計評估,但又不符合決策分析的基本原則。

ROC曲線和PR曲線

非必需,但也沒有不建議

相較于AUROC,這些曲線提供的額外信息有限。

校準(zhǔn)度(Calibration)

O/E比(觀察值/期望值比)

非必需,但也沒有不建議

該指標(biāo)易于解釋,但僅能部分反映校準(zhǔn)情況;在內(nèi)部驗證中,O/E比常為1或接近1。

校準(zhǔn)截距與校準(zhǔn)斜率

非必需,但也沒有不建議

這些指標(biāo)難以直觀解釋,且僅提供部分校準(zhǔn)信息;內(nèi)部驗證時,校準(zhǔn)斜率可用于評估過擬合風(fēng)險。

ECI、ICI和ECE

非必需

這些指標(biāo)是對校準(zhǔn)圖的匯總性指標(biāo),會掩蓋校準(zhǔn)偏差的性質(zhì)和方向,且存在統(tǒng)計一致性問題。

校準(zhǔn)圖或可靠性圖

這是評估校準(zhǔn)度最富洞察的方法,推薦使用平滑法而非分組法;內(nèi)部驗證時可優(yōu)先使用校準(zhǔn)圖,若僅報告校準(zhǔn)斜率也是可接受的;外部驗證時強烈推薦使用校準(zhǔn)圖,并應(yīng)標(biāo)明不確定性(例如95%CI)。

整體性能(Overall performance)

對數(shù)似然、Brier 評分、R2 類指標(biāo)

非必需,但也沒有不建議

建議將區(qū)分度與校準(zhǔn)度分開評估。這些指標(biāo)在模型選擇中高度相關(guān),但本文未涵蓋該內(nèi)容。

區(qū)分度斜率與平均絕對預(yù)測誤差(MAPE)

不建議

這些指標(biāo)屬于“不恰當(dāng)”指標(biāo),即錯誤模型的得分可能優(yōu)于正確模型。

風(fēng)險分布圖

展示不同結(jié)局類別下風(fēng)險預(yù)測值的分布,有助于深入理解模型。

分類性能(Classification)

分類準(zhǔn)確率、平衡準(zhǔn)確率、約登指數(shù)、診斷比值比、Kappa、F1、MCC

不建議

在臨床相關(guān)決策閾值下,這些指標(biāo)均“不恰當(dāng)”;此外,部分指標(biāo)難以解釋。

靈敏度與特異度

非必需;若一起報告可作為描述性指標(biāo)

分別單獨報告是不合適的,但若兩者同時報告,可作為描述性指標(biāo)。然而,因其依賴實際結(jié)局,在預(yù)測時不具備直接實用性。

陽性預(yù)測值(PPV)與陰性預(yù)測值(NPV)

非必需;若一起報告可作為描述性指標(biāo)

分別單獨報告是不合適的,但同時報告具有高度臨床實用性。

分類圖

非必需,但也沒有不建議

可作為描述性圖表呈現(xiàn),按閾值展示靈敏度與特異度,或PPV與NPV。

臨床效用(Clinical utility)

凈效益或標(biāo)準(zhǔn)化凈效益(帶決策曲線),預(yù)期成本(帶成本曲線)

這些是量化模型能否促成更優(yōu)臨床決策的重要指標(biāo)。凈效益的決策曲線可展示在不同臨床相關(guān)閾值下,相對于參考策略(及其他競爭模型)的潛在臨床價值。

本文認(rèn)為,面向醫(yī)療實踐的預(yù)測性AI模型的性能評估應(yīng)聚焦于區(qū)分度、校準(zhǔn)度和臨床效用。區(qū)分度和校準(zhǔn)度有助于建模者和臨床醫(yī)生理解如何改進模型,臨床效用則從決策者和患者的角度出發(fā),評估模型是否能促成更優(yōu)的臨床決策。

本文推薦采用以下核心指標(biāo)與圖表組合在研究報告中呈現(xiàn):

  • AUROC(用于評估區(qū)分度);

  • 平滑校準(zhǔn)圖(用于評估校準(zhǔn)度);

  • 臨床效用指標(biāo)(如帶決策曲線的凈效益);

  • 按結(jié)局類別展示預(yù)測概率分布的圖形

在內(nèi)部驗證AI模型時,校準(zhǔn)度的重要性可能相對較低,因為模型開發(fā)與內(nèi)部驗證基于相同的人群。但在外部驗證中(即在不同人群或臨床環(huán)境中評估模型時),校準(zhǔn)度就尤為關(guān)鍵。盡管內(nèi)部驗證時使用校準(zhǔn)圖也有價值,但僅報告校準(zhǔn)斜率,輔以O(shè)/E比通常已足夠,對于構(gòu)建良好的模型,預(yù)期其O/E比應(yīng)接近1。

除上述核心指標(biāo)外,PPV聯(lián)合NPV,或靈敏度聯(lián)合特異度,也可作為描述性指標(biāo)予以報告。但需注意,這些指標(biāo)若單獨報告則屬于“不恰當(dāng)”指標(biāo)。

所有報告的指標(biāo)和圖表,在可能的情況下都應(yīng)附帶置信區(qū)間,臨床效用指標(biāo)除外,針對其不確定性的量化仍是近期學(xué)術(shù)爭論與研究的焦點。

本文建議不要使用 F1、AUPRC 或 pAUROC,而應(yīng)采用專門的臨床效用指標(biāo)來評估模型性能。需要指出的是,本文的觀點不適用于某些真陰性難以明確定義的醫(yī)療場景,例如病灶檢測。

有三個與性能評估相關(guān)的重要問題值得強調(diào):樣本量(sample size)、性能異質(zhì)性(performance heterogeneity)、報告透明度(reporting transparency)。

充足的樣本量對于精確評估模型性能至關(guān)重要。以往建議最小的結(jié)局類別中至少包含100至200名個體。目前已有更具體的樣本量計算方法用于基于回歸的預(yù)測模型。在比較不同模型的校準(zhǔn)性能時,通常需要更大的樣本量。

由于不同地區(qū)、環(huán)境或時間段的人群特征和測量流程存在差異,模型性能的異質(zhì)性是預(yù)料中的??赏ㄟ^Meta分析和Meta回歸對多個外部驗證研究的性能異質(zhì)性進行量化和解釋。若簡單地將基于不同外部數(shù)據(jù)集驗證的模型進行直接比較,可能得出錯誤結(jié)論。

全面透明地報告預(yù)測性AI模型研究至關(guān)重要,可遵循TRIPOD+AI及相關(guān)報告規(guī)范。為避免“性能操縱”(performance hacking),應(yīng)重視預(yù)先發(fā)表研究方案,并在合理可行的情況下共享代碼和數(shù)據(jù)。

本文整理自:Lancet Digit Health. 2025 Dec 13:100916.


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2026-03-01 02:05:27
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溫讀史
2026-01-24 07:39:28
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丁丁鯉史紀(jì)
2025-11-17 15:58:28
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2026-02-28 19:21:57
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2026-02-28 21:38:27
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2026-02-11 10:54:58
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2026-03-01 10:54:11
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2026-02-28 16:16:42
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2026-03-01 11:13:03
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