近日，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)沈其榮院士團(tuán)隊(duì)張瑞福教授課題組、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所與河南大學(xué)農(nóng)學(xué)院合作在《Nature Communications》期刊上發(fā)表題為“General variation in the Fusarium wilt rhizosphere microbiome”的研究成果。中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所蘇律副研究員和河南大學(xué)農(nóng)學(xué)院馮海超研究員為共同第一作者，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)張瑞福教授和中國(guó)農(nóng)科院生物技術(shù)研究所燕永亮研究員為共同通訊作者。

該研究通過(guò)Meta分析整合了來(lái)自多個(gè)獨(dú)立研究的根際微生物組數(shù)據(jù)，并結(jié)合代謝組、宏基因組、轉(zhuǎn)錄組，系統(tǒng)揭示了鐮刀菌侵染下根際微生物組的功能與結(jié)構(gòu)變化規(guī)律。此外，研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地提出了“操作性分析單元”概念（OAU），將來(lái)自不同地點(diǎn)、不同寄主植物根際樣本，在盡可能相同的條件下進(jìn)行分組比較，以剝離環(huán)境噪音，捕捉真實(shí)的病害信號(hào)。研究發(fā)現(xiàn)鐮刀菌侵染可穩(wěn)定地改變根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。其中，黃桿菌屬在發(fā)病植株根際顯著富集，并可抑制病原菌生長(zhǎng)。進(jìn)一步研究通過(guò)代謝組鑒定到發(fā)病植株根系分泌物中的生育酚顯著富集，該物質(zhì)能促進(jìn)根際黃桿菌生長(zhǎng)。黃桿菌與生育酚聯(lián)合使用可顯著降低番茄枯萎病的發(fā)病指數(shù)，并有效提升根際黃桿菌豐度。