明清之際江南大地大量城市遭到屠城。清廷奉行“抗拒者誅”的屠城政策，有意將屠城作為政治、軍事策略使用。順治二年（1645）春夏之交，在攝政王多爾袞的部署下，清軍分豫親王多鐸、英親王阿濟(jì)格兩路南下，迅速占領(lǐng)南京，摧毀南明弘光政權(quán)。江南各地在八旗兵鋒之下也隨之傳檄而定，準(zhǔn)備服從新朝統(tǒng)治。不料清廷突然在六月初頒布“剃發(fā)令”，要求官紳軍民一律迅速剃發(fā)。原本業(yè)已“歸順”的江南州縣又紛紛揭竿而起。

清廷遂調(diào)兵遣將，逐一武力鎮(zhèn)壓，釀成多起屠城慘案。元末胡三省已認(rèn)為：“自古以來(lái)，以攻下城而盡殺城中人為屠城，亦曰洗城?！?/p>

1645年7月30日，清軍抵達(dá)江蘇一個(gè)叫沙鎮(zhèn)的地方，具體鄉(xiāng)鎮(zhèn)名稱或因年代久遠(yuǎn)、記載簡(jiǎn)略而難以精確考證。其地理位置應(yīng)與揚(yáng)州、江陰等江南抗清核心區(qū)相近，屬于清軍南下鎮(zhèn)壓路線的一部分。根據(jù)《研堂見聞雜記》記載，清軍南下過(guò)程中，在“沙鎮(zhèn)”對(duì)居民進(jìn)行屠殺，清軍對(duì)沙鎮(zhèn)百姓采取“先逼索金銀”的手段，男性若交出財(cái)物后仍遭殺害，婦女則被擄走奸淫。“遇男女，則牽頸而發(fā)其地中之藏，少或支吾，即剖腹刳腸?！蹦行员粴⒑螅瑡D女被“奸淫后擄入舟中”，淪為性奴隸。清軍以繩索套住民眾脖子，逼迫交出財(cái)物，稍有不從便當(dāng)場(chǎng)開膛破肚。目擊者描述：“血泚焦土掩紅顏，孤孩尚探娘懷乳”。

朔州之屠發(fā)生于1649年（順治六年）八月二十九日，是清軍鎮(zhèn)壓山西反清復(fù)明運(yùn)動(dòng)的關(guān)鍵事件。此前，大同總兵姜瓖于1648年反正歸明，朔州軍民響應(yīng)起義，殺清軍官員并迎姜瓖部隊(duì)入城。清廷調(diào)集多爾袞、阿濟(jì)格、博洛等親王率軍圍剿，最終以屠城震懾反抗勢(shì)力。

清軍以紅衣大炮連續(xù)轟擊朔州城，摧毀北城墻45丈、大小城樓3座，并焚毀南門及西南角樓。守軍雖浴血奮戰(zhàn)，終因寡不敵眾，城破后清軍涌入。清軍入城后執(zhí)行“盡行誅之”的命令，街道巷戰(zhàn)中的軍民被悉數(shù)斬殺，史載“尸橫遍地，血流成河”。普通百姓無(wú)論男女老幼皆遭屠戮，《朔州志》記載“城破，悉遭屠戮”，僅存者多為隱匿山林者。清軍焚毀糧倉(cāng)、衙署及民居，劫掠財(cái)物，并破壞城墻防御體系。戰(zhàn)后朔州“蕩然一空”，行政機(jī)構(gòu)被迫遷移?！肚迨雷鎸?shí)錄》稱大同、朔州、渾源三城“已經(jīng)王師屠戮，人民不存”。山西總督佟養(yǎng)量揭帖中記錄：“朔州原額地三千二百六十五頃，屠戮后僅存成熟地三百八十九頃，人口死亡一萬(wàn)八千八百六十四丁”。

清軍掃蕩豫中，許昌（明稱許州）位于河南腹地，清軍為切斷中原反清勢(shì)力聯(lián)系，于順治二年（1645年）攻占許昌。據(jù)《明季南略》記載，清軍以“追剿流賊余黨”為名，對(duì)抵抗者實(shí)施無(wú)差別殺戮，男子多被砍殺，婦女擄為奴隸。地方志載“街衢生荊棘，十室九空”，戰(zhàn)后耕地荒廢率超過(guò)70%。清軍焚毀糧倉(cāng)、衙署及城墻，并將護(hù)城河填平以削弱防御功能，導(dǎo)致許昌失去區(qū)域經(jīng)濟(jì)樞紐地位，直至康熙年間才逐步恢復(fù)。洛陽(yáng)作為明代福王封地，清軍為震懾中原，于順治元年（1644年）攻陷后采取極端手段，守城軍民遭集體處決，尸體被拋入洛河，“血染伊水三日”，福王府被洗劫一空，典籍文物焚毀殆盡，寺院古跡（如白馬寺）亦遭破壞。明末洛陽(yáng)人口約30萬(wàn)，清初僅存不足5萬(wàn)。順治五年（1648年）河南巡撫羅繡錦奏報(bào)稱“洛陽(yáng)地荒人稀，賦稅無(wú)征”，需從山西移民填補(bǔ)勞動(dòng)力。

清軍于1646年占領(lǐng)皖南后，強(qiáng)制推行“剃發(fā)令”，引發(fā)涇縣、徽州、績(jī)溪等地民眾起義。涇縣士紳尹民興聯(lián)合徽州金聲、江天一等人起兵抗清，試圖恢復(fù)南明政權(quán)。清軍提督張?zhí)斓撀什坑?646年8月攻破涇縣城，守城義軍全員戰(zhàn)死。清軍入城后展開報(bào)復(fù)性屠殺，據(jù)《明清史料》記載，城內(nèi)“橫尸遍地，血流成渠”，僅存90余人幸存，死亡人數(shù)達(dá)5萬(wàn)以上。此事件因慘烈程度被稱為“乙酉之難”，成為清初江南反剃發(fā)運(yùn)動(dòng)的標(biāo)志性案例，魯迅曾評(píng)價(jià)此類屠殺“屠盡漢人骨氣廉恥”。

與涇縣起義同步，徽州士紳金聲、江天一起兵響應(yīng)，聯(lián)合寧國(guó)、石埭等地義軍收復(fù)青陽(yáng)、旌德等縣，但終因兵力分散被清軍鎮(zhèn)壓。清軍攻陷徽州府后，以“叛亂”罪名對(duì)六縣實(shí)施無(wú)差別殺戮，焚毀書院、宗祠等文化場(chǎng)所。徽州人口銳減70%，農(nóng)田荒廢，手工業(yè)（如徽墨、茶葉）徹底崩潰。根據(jù)《清世祖實(shí)錄》，1646年清軍鎮(zhèn)壓皖南時(shí)，績(jī)溪與涇縣同遭屠戮，死亡約2萬(wàn)人。清軍焚毀村莊、擄掠?jì)D女，并將尸體拋入河流，導(dǎo)致“溪水腥臭數(shù)月”。

徐州作為南北交通樞紐，清軍南下時(shí)遭遇南明將領(lǐng)高杰舊部抵抗。1645年多鐸攻占揚(yáng)州后，分兵北上徐州。清軍破城后以“拒不剃發(fā)”為由屠城三日，據(jù)《徐州府志》載，城內(nèi)“積尸塞巷，泗水為之?dāng)嗔鳌?，死亡人?shù)超10萬(wàn)。戰(zhàn)后徐州城墻被拆毀五尺，漕運(yùn)碼頭焚毀，經(jīng)濟(jì)地位一落千丈。

1646年清軍貝勒博洛攻占浙江金華府，南明兵部尚書朱大典率軍民據(jù)城抵抗，城破后清軍展開報(bào)復(fù)性屠殺。清軍通過(guò)叛徒內(nèi)應(yīng)攻破西門，朱大典點(diǎn)燃火藥庫(kù)自盡殉國(guó)，其妻妾攜孫投井。巷戰(zhàn)中剩余守軍退守東市街，最終全員戰(zhàn)死。清軍入城后“三日人頭如雨落”，死亡人數(shù)約5萬(wàn)。

舟山是魯王朱以?？骨逭?quán)的最后據(jù)點(diǎn)，清軍由陳錦、金礪率軍圍攻。清軍以紅衣大炮破城，明軍將領(lǐng)劉世勛、張名揚(yáng)等巷戰(zhàn)殉國(guó)，尸體拋入護(hù)城河導(dǎo)致“血水三日不散”。戰(zhàn)后統(tǒng)計(jì)死亡約1.8萬(wàn)人，幸存者僅53人，清軍檔案記載“全城蕩然一空”。1645年，清軍因蘇州反抗“剃發(fā)令”展開無(wú)差別殺戮，據(jù)《蘇州市志》記載“積尸塞巷，泗水?dāng)嗔鳌?，死亡約10萬(wàn)人。

清軍攻破海寧硤石，舉人周宗彝率義軍抵抗失敗，其弟周啟琦腸斷仍戰(zhàn)，周氏全家42人投青蘿池自盡。海寧手工業(yè)與農(nóng)業(yè)遭毀滅性破壞，地方志記載“血染焦土，十室九空”。

在常熟，清軍以“拒剃發(fā)”為由屠城三日，尸體拋入河道導(dǎo)致“沿河皆人頭”，幸存者僅90余人。地方志載“街衢荊棘，無(wú)人可守”。

1649年，除夕夜，清軍尚可喜、耿繼茂遣間諜放火焚燒鼓樓，趁亂攻入南雄城，屠殺軍民約2萬(wàn)人。幸存者描述“家家燕子巢空林，伏尸如山莽充斥”，戰(zhàn)后僅存20%-30%人口。

1652年，清軍因沅江民眾響應(yīng)李定國(guó)反清，破城后“滿城殺盡，封刀三日”，死亡約10萬(wàn)人。

1648年，福建邵武義軍起義失敗后，清軍“福建總兵”王之綱屠城，死亡人數(shù)不詳，但“街巷無(wú)活口”。

永昌之屠（1659年）發(fā)生于南明永歷十三年（1659年），清軍平定云南時(shí)，由征南將軍趙布泰、提督線國(guó)安主導(dǎo)。永昌府（今云南保山）因長(zhǎng)期支持南明政權(quán)，成為清軍重點(diǎn)鎮(zhèn)壓對(duì)象。清軍以“剿滅南明余黨”為名，對(duì)永昌府及周邊地區(qū)，清軍“沿途燒殺搶掠，百里無(wú)人煙”，村莊被焚毀，居民不分老幼皆遭屠戮。地方文獻(xiàn)記載，清軍將尸體拋入瀾滄江，“血染江水三日不散”，并擄掠?jì)D女兒童為奴，部分被押往北方充作旗人包衣。

潼關(guān)之屠（1645年）1645年清軍多鐸部為打通入陜通道，與李自成大順軍在潼關(guān)激戰(zhàn)。大順將領(lǐng)馬世耀詐降失敗，導(dǎo)致七千士兵被屠。據(jù)《清世祖實(shí)錄》載，多鐸以“慶功宴”為名解除降兵武裝，隨后集體砍殺，“尸塞潼關(guān)道，血染渭河水”?！朵P(guān)志》補(bǔ)充：清軍將人頭堆成“京觀”，女性敏感部位被割下炫耀武功。