導(dǎo)語

免疫現(xiàn)象是思考生命復(fù)雜性的理想場景。免疫系統(tǒng)能在數(shù)十億種可能的病原體中識別威脅并將之消除，也能在機體遭遇損傷時協(xié)調(diào)資源啟動修復(fù)。

如何在AI驅(qū)動的復(fù)雜科學(xué)世紀，迭代我們對免疫現(xiàn)象的認知？這是我們組織這場讀書會的初衷。

本次讀書會由秦健勇、敖平、雷錦志、張曉實及秦曉玉共同發(fā)起，試圖基于新生物學(xué)2009白皮書從多個維度——物理、數(shù)學(xué)、AI、臨床——實現(xiàn)對免疫現(xiàn)象的迭代理解。

免疫現(xiàn)象是思考生命復(fù)雜性的理想場景。免疫系統(tǒng)能在數(shù)十億種可能的病原體中識別威脅并將之消除，也能在機體遭遇損傷時協(xié)調(diào)資源啟動修復(fù)。

——然而，我們當(dāng)前仍對這種每時每刻發(fā)生在我們體內(nèi)數(shù)以萬億級各類細胞間的交互作用全景，仍知之不多。

現(xiàn)有的觀察、證據(jù)和理論已經(jīng)將免疫視作一個動態(tài)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，其中有數(shù)不清的節(jié)點和交互作用模塊。

免疫網(wǎng)絡(luò)理論，最早由 Niels Jerne在1974年正式發(fā)表文章提出，當(dāng)時成為學(xué)術(shù)界關(guān)注的熱點。其后經(jīng)歷了分子生物學(xué)的崛起，免疫研究開始進入高分辨率解讀的時代。免疫機制的解讀歷來是諾貝爾獎的聚焦點，革命性的免疫檢查點抑制劑最終打破了腫瘤免疫治療的尷尬局面，2025年諾獎再次花落免疫：Treg研究獲得諾獎。而Treg正是免疫網(wǎng)絡(luò)中陰陽對稱性結(jié)構(gòu)中極為重要的一環(huán)。

如果將免疫現(xiàn)象視作網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)，目前仍面臨微觀機制解析和分辨率不足的困境，且由于大量多hierarchy數(shù)據(jù)的積累，亟需理論指導(dǎo)與算力加持配合以獲得清晰的免疫調(diào)控機制框架。

目前理論生物學(xué)和生物學(xué)研究機制之間仍存在著巨大的裂隙，亟需彌合。

復(fù)雜科學(xué)興起于20世紀80年代，其建立者代表了人類頂尖的智力水準(zhǔn)，其初衷似乎是在響應(yīng)Max Karl Ernst Ludwig Planck在世紀之初關(guān)于學(xué)科壁壘的思考。

位于美國西部的那座山巔神殿SFI是復(fù)雜科學(xué)研究的圣地，一代宗師Philip Anderson參與了早期奠基。Anderson堅信21世紀是復(fù)雜科學(xué)的世紀，其曾特意詢問好友楊振寧的觀點，楊老默而不語。SFI成立40余年來，致力于尋求理解復(fù)雜現(xiàn)象的通用理論框架，雖理論探索頗有成果，對諸多學(xué)科也頗有影響，但在轉(zhuǎn)化實踐上舉步維艱，亟需突破。

2025年，現(xiàn)任SFI所長David Krakauer薈萃群英，將之前系統(tǒng)回顧提煉出的對構(gòu)建復(fù)雜科學(xué)理論最為關(guān)鍵89篇經(jīng)典文獻編撰成冊，試圖從經(jīng)典中尋求靈感。

已有的復(fù)雜科學(xué)體系已經(jīng)在生命現(xiàn)象的基本理論框架上有了頗具啟發(fā)的建構(gòu)。SFI所長David Krakauer在《Multiple Paths to Multiple Life》中建構(gòu)的一個三明治式理論模型，就試圖基于第一性原理剖析生命現(xiàn)象的底層運行機制，對理解復(fù)雜生命現(xiàn)象背后的簡單性原理極有啟發(fā)。

中國學(xué)者敖平是理論物理學(xué)博士出身，師從多位一流學(xué)者；早在1999年，已是瑞典某大學(xué)理論物理副教授的他，最終決定追隨系統(tǒng)生物學(xué)的奠基人之一Leroy Hood進入生命科學(xué)領(lǐng)域。隨后，敖平加入Hood新成立的系統(tǒng)生物研究院（Institute for Systems Biology，簡稱ISB），成為一名系統(tǒng)生物學(xué)家。

2005年，敖平教授基于第一性原理視角構(gòu)建了達爾文演化力學(xué)，試圖為生命現(xiàn)象提供一個第一性原理框架。20余年來，敖教授致力于使用以演化力學(xué)為基座的內(nèi)源性網(wǎng)絡(luò)這一方法論去剖析復(fù)雜生命現(xiàn)象的底層運行機制。敖平教授苦心孤詣的努力，似乎是在接力著Niels Jerne提出免疫網(wǎng)絡(luò)理論后另一位學(xué)者Alan Perelson對免疫網(wǎng)絡(luò)的首次數(shù)學(xué)建構(gòu)（1989年）。敖平演化力學(xué)方程極為簡潔優(yōu)美，dq/dt=-[D(q)-J(q)]▽H(q)+ξ(q,t)，企圖為復(fù)雜現(xiàn)象的演化過程構(gòu)建一個統(tǒng)一的動力學(xué)方程。

從原核生物的CRISPR，這種最基礎(chǔ)的適應(yīng)性免疫形式，到脊椎動物以免疫球蛋白家族為基本元素的復(fù)雜適應(yīng)性免疫，演化已經(jīng)跨越了數(shù)十億年。數(shù)百種細胞亞群、數(shù)以萬計的信號分子與代謝物，再加上微生物群落與宿主之間的實時博弈，構(gòu)成了一個以獵手和獵物為主角的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)圖景。而免疫失調(diào)，直接對應(yīng)著癌癥、自身免疫疾病、COVID-19感染后長新冠的免疫紊亂綜合征等臨床現(xiàn)實。免疫紊亂，從普通的過敏到致命的癌癥，是一個常見的健康問題。

理解免疫現(xiàn)象，現(xiàn)有的研究提供了大量素材，但非常碎片化；只有將它們放置在生命理論框架的背景中，才可能洞察那些數(shù)據(jù)的物理意義。例如，理解和調(diào)控T淋巴細胞的功能和行為，需要結(jié)合腫瘤微環(huán)境的代謝狀態(tài)、腸道菌群的構(gòu)成、宿主的心理壓力水平，乃至?xí)円构?jié)律等。

如何在AI驅(qū)動的復(fù)雜科學(xué)世紀，迭代我們對免疫現(xiàn)象的認知？這是我們組織這場讀書會的初衷。

本次讀書會由秦健勇、敖平、雷錦志、張曉實及秦曉玉共同發(fā)起，試圖基于新生物學(xué)2009白皮書從多個維度——物理、數(shù)學(xué)、AI、臨床——實現(xiàn)對免疫現(xiàn)象的迭代理解。

背景：

正在發(fā)生的科學(xué)范式轉(zhuǎn)型

2009年，美國國家科學(xué)院發(fā)布了一份白皮書，名為《新生物學(xué)：確保美國引領(lǐng)即將到來的生物學(xué)革命》（A New Biology for the 21st Century）。白皮書的核心判斷是：生物學(xué)正站在一場革命的入口。

——這場革命，可不僅僅是技術(shù)的躍進，也包含了科學(xué)研究范式的轉(zhuǎn)型。

報告指出，新生物學(xué)的實踐在于整合物理科學(xué)、數(shù)學(xué)、計算科學(xué)與工程學(xué)的理論與方法，能對生命系統(tǒng)的復(fù)雜性做出前所未有的解讀。新生物學(xué)家，不僅要會做傳統(tǒng)“濕實驗”，也需具有較高的理論水平，成為能在物理、數(shù)學(xué)、計算與生物之間自由穿行的跨學(xué)科建構(gòu)者。

15年后的2024年，一篇發(fā)表于 PNAS Nexus 的論文對科學(xué)史上761項重大發(fā)現(xiàn)進行了系統(tǒng)分析，報告認為：25%的重大科學(xué)發(fā)現(xiàn)并不符合“提出假設(shè)—設(shè)計實驗—驗證假設(shè)”的傳統(tǒng)科學(xué)范式；推動這些發(fā)現(xiàn)的一個共同要素是復(fù)雜科學(xué)方法與工具的使用——數(shù)學(xué)與統(tǒng)計方法、多維建模，粒子加速器、X射線……

這些延伸了人類認知邊界的工具，才是科學(xué)突破的獨有引擎。而我們傳統(tǒng)認為的“假設(shè)—實驗—驗證”范式，不過是一種基礎(chǔ)普適思維底座。

21世紀的生命科學(xué)，以NBIC為主旋律的科技體系已經(jīng)取得巨大進展，但我們尚需要一套新的認知框架來整合所取得的龐大的碎片化知識，然后再重新出發(fā)。

讀書會簡介

免疫復(fù)雜性讀書會，是一個以免疫現(xiàn)象為核心場景，以復(fù)雜科學(xué)為方法論，試圖整合機制研究、數(shù)理建模、研發(fā)和臨床實踐問題來思考21世紀生命科學(xué)認知范式轉(zhuǎn)型的跨學(xué)科研討社群。

講者們來自各自領(lǐng)域的一線前沿，將基于自己長期的工作積淀與思考展開演講，同時提供精要的參考文獻。

本讀書會將圍繞一個臨床問題——如何優(yōu)化以免疫治療為中心的控瘤策略？——來展開討論。

試圖以范式思考與理論建模視角，回歸到第一性原理的起點，去重構(gòu)認知框架，激發(fā)對話與洞見。

發(fā)起人團隊認為，將免疫系統(tǒng)視為動態(tài)復(fù)雜適應(yīng)性網(wǎng)絡(luò)，基于認知范式思考腫瘤免疫治療的瓶頸——或能對當(dāng)前免疫治療的困境有所突破，構(gòu)建出一套有效的聯(lián)合治療原則性框架，為臨床實踐提供指引。

讀書會主題：范式、理論與工具

——從假說驅(qū)動到復(fù)雜技術(shù)體系，從分子還原到系統(tǒng)涌現(xiàn)。

1. 復(fù)雜科學(xué)范式：學(xué)科壁壘的破除

科學(xué)本質(zhì)上是一個內(nèi)在統(tǒng)一的整體。它被劃分為不同學(xué)科并非事物本質(zhì)使然，而是源于人類認知能力的局限性，這種局限必然導(dǎo)致分工。實際上，從物理學(xué)到化學(xué)，從生物學(xué)和人類學(xué)直到社會學(xué)，存在著一條 不可分割的連續(xù)鏈條——任何環(huán)節(jié)都不應(yīng)被武斷割裂。

——Max Karl Ernst Ludwig Planck

按照美國科學(xué)家Warren Weaver在1948年的分類，生命現(xiàn)象屬于有序復(fù)雜現(xiàn)象，需要跨學(xué)科的方法論。

隨著系統(tǒng)生物學(xué)的興起，目前已經(jīng)實現(xiàn)對最小人造細胞JCVI-syn3A的4D高精度動力學(xué)建模，這個最新報道的虛擬細胞雖然不是完全基于第一性原理，而是綜合使用海量數(shù)據(jù)以參數(shù)擬合的方法實現(xiàn)的，但已經(jīng)展示出壯麗的產(chǎn)業(yè)前景，如虛擬臨床試驗和藥物設(shè)計等。

免疫學(xué)在過去一個世紀的發(fā)展，在方法論上深受分子生物學(xué)的還原論范式主導(dǎo)。這一范式的成功是毋庸置疑的：從Jerne的免疫網(wǎng)絡(luò)理論（1974），到Sakaguchi發(fā)現(xiàn)CD4+CD25+ Treg細胞（1995）；從Brunkow鑒定FOXP3基因（2001），到Chen和Mellman提出腫瘤免疫循環(huán)（2013）——正是基于分子生物學(xué)技術(shù)通過對個別分子或細胞的精細解析實現(xiàn)的。

當(dāng)我們積累了足夠多的分子細節(jié)之后，一種迷惑展現(xiàn)出來：

我們知道得越多，似乎離“理解”越遠。

當(dāng)還原論推進認知受到局限，范式轉(zhuǎn)移便成為歷史的召喚。美國科學(xué)院在2009年發(fā)布的《新生物學(xué)》白皮書，正是對此的回應(yīng)。

該白皮書主張：生命科學(xué)正在從“分析單個組分”的時代，進入“理解組成部分如何協(xié)同互作以產(chǎn)生復(fù)雜系統(tǒng)行為”的時代。這不僅需要生物學(xué)內(nèi)部的整合，更需要物理學(xué)、數(shù)學(xué)、工程學(xué)和計算科學(xué)的深度介入。

這一范式轉(zhuǎn)移當(dāng)前已在系統(tǒng)免疫學(xué)、定量建模與跨尺度耦合等領(lǐng)域初步展現(xiàn)。

1. 理論的價值：“新生物學(xué)”理論框架

一切科學(xué)的偉大目標(biāo)，是從盡可能少的假設(shè)或公理出發(fā)，通過邏輯演繹，概括盡可能多的經(jīng)驗事實。

——Albert Einstein

Einstein的這句話揭示了科學(xué)理論的最高理想：用極簡的邏輯框架解釋極豐富的經(jīng)驗現(xiàn)象。人類對免疫現(xiàn)象的認知模式，可以歸類為描述性、機制研究、形式化與統(tǒng)一框架探索四種。

在數(shù)學(xué)形式化方向上，Harlapur等（2024）的工作展示了布爾邏輯網(wǎng)絡(luò)和常微分方程（ODE）如何捕捉Th細胞分化的核心動力學(xué)特征。這些模型揭示，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的多穩(wěn)態(tài)性（multistability）是由轉(zhuǎn)錄因子之間的相互拮抗和自激活反饋所編碼的系統(tǒng)級屬性。T-bet與GATA3的相互抑制可導(dǎo)致Th1/Th2的多穩(wěn)態(tài)；RORγt與FOXP3的相互抑制產(chǎn)生Th17/Treg的多穩(wěn)態(tài)。當(dāng)自激活強度超過相互抑制時，兩種命運決定因子可共表達，形成具有功能意義的雜交狀態(tài)——這一預(yù)測已被實驗證實。

這類形式化理論的價值不僅可解釋已知現(xiàn)象，也具有預(yù)測能力：模型可以預(yù)測哪些參數(shù)擾動將導(dǎo)致狀態(tài)轉(zhuǎn)換，從而指導(dǎo)實驗設(shè)計和治療干預(yù)。

Tripathi等提出的Treg-Tconv-APC三細胞回路理論，試圖用同一框架解釋Treg在不同情境下的所有功能。在這個抽象模型中，穩(wěn)態(tài)耐受、防御應(yīng)答和炎癥消退這三個程序被看作是同一回路在不同參數(shù)配置下的動力學(xué)操作模式——這類似于動力系統(tǒng)中的分岔（bifurcation）現(xiàn)象。

當(dāng)回路參數(shù)（如Treg頻率、IL-2親和力、APC共刺激水平等）正常時，系統(tǒng)運行于穩(wěn)態(tài)耐受模式；當(dāng)病原體抗原大量呈遞打破平衡時，系統(tǒng)切換至防御模式；當(dāng)病原體清除后，系統(tǒng)通過參數(shù)反饋恢復(fù)至穩(wěn)態(tài)。

這一理論強調(diào)了前饋與反饋的相對強度如何決定系統(tǒng)的整體行為——這展現(xiàn)了用極少的假設(shè)（三個細胞類型之間的相互作用拓撲）來解釋大量經(jīng)驗事實（Treg的多功能性）的科學(xué)思想。

1. 技術(shù)與工具的本質(zhì)，技術(shù)和認知的交互

技術(shù)，是被捕獲并加以利用的現(xiàn)象的集合，是對現(xiàn)象有目的的編程。而我們所使用的每一個工具、每一臺裝置，都是這種編程在現(xiàn)實中的一次遞歸組合與封裝——它們既是已有技術(shù)的產(chǎn)物，又是構(gòu)建未來技術(shù)的模塊。技術(shù)正是通過這樣無限遞歸的組合，從自身中創(chuàng)生自身，并像生命一樣不斷進化。

——William Brian Arthur

Arthur的這段話揭示了一個深刻的技術(shù)哲學(xué)：技術(shù)是一個自我進化的生態(tài)系統(tǒng)。回顧免疫現(xiàn)象研究中的技術(shù)演進，我們恰好可以看到Arthur所說的“遞歸組合與封裝”。

在“前單細胞時代”，研究者傾向于將Treg視為一個相對均一的群體，核心問題是“哪個分子負責(zé)Treg抑制”。

Treg不是靠單一分子運作的“剎車片”，而是類似能夠在不同炎癥場景中調(diào)用不同工具箱的調(diào)控系統(tǒng)。這種從“清單式機制羅列”到“原則式生物學(xué)解釋”的轉(zhuǎn)變，很大程度上得益于單細胞技術(shù)所揭示的Treg高度異質(zhì)性。

同樣，CD4+ T細胞分化的經(jīng)典范式——Th1/Th2的二分格局——統(tǒng)治了近二十年，直至Th17細胞的發(fā)現(xiàn)才被打破。而今，得益于單細胞技術(shù)和計算建模，我們知道Th1/Th2/Th17/Treg之間的邊界并非固定——雜交表型的存在、表觀遺傳的雙價修飾（H3K4me3與H3K27me3共存）維持的“ poised ”狀態(tài)、以及細胞因子環(huán)境驅(qū)動的可塑性轉(zhuǎn)化，都指向一個比經(jīng)典范式所描述的更為動態(tài)和靈活的景觀。

在免疫檢查點領(lǐng)域，技術(shù)進步同樣推動了認知更新。PD-1和CTLA-4抑制劑的突破性成功催生了大量針對“第二代免疫檢查點”（LAG-3、TIM-3、TIGIT等）的藥物開發(fā)努力。但Tang和Veillette冷靜地指出，這些努力大多未能重現(xiàn)PD-1/CTLA-4的成功。

原因在于，免疫系統(tǒng)中的檢查點調(diào)控遠非簡單的“阻斷即激活”開關(guān)模型，而是涉及多細胞類型、多信號通路和多層次代償?shù)膹?fù)雜網(wǎng)絡(luò)。

這一認知的修正，正是新一代高通量技術(shù)——特別是單細胞多組學(xué)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)——所推動的。

在代謝領(lǐng)域，傳統(tǒng)觀點認為T細胞活化遵循從氧化磷酸化到有氧糖酵解的經(jīng)典代謝轉(zhuǎn)換范式。但Longo等利用穩(wěn)定同位素示蹤等先進技術(shù)揭示，這一模型過于簡化：活化的T細胞實際上同時運行糖酵解和氧化磷酸化程序，將不同營養(yǎng)物質(zhì)戰(zhàn)略性分配至特定途徑。生理條件下，CD8+效應(yīng)T細胞優(yōu)先將葡萄糖分配用于磷酸戊糖途徑和核苷酸合成等合成代謝分支，而非大量轉(zhuǎn)化為乳酸——這一發(fā)現(xiàn)完全依賴于先進代謝示蹤技術(shù)，并改變了我們對T細胞代謝編程的理解。

1. 臨床實踐：治療響應(yīng)預(yù)測與聯(lián)合調(diào)控

1891年人類的第一個治療性抗體用于治療致死性傳染病白喉，其中一個個案中取得顯著效果。隨后的1894年，經(jīng)系統(tǒng)化科學(xué)觀察其臨床療效得到科學(xué)驗證，該治療性抗體的出現(xiàn)使得白喉的臨床結(jié)局因之發(fā)生了突破性的改善。

1984年，距離Watsen與Crick這對好基友基于X衍射成像與第一性原理在建模的基礎(chǔ)上推測出量子英雄們苦思不得解的DNA結(jié)構(gòu)已經(jīng)過去了31年。該年，法國科學(xué)家基于分子生物學(xué)技術(shù)，發(fā)現(xiàn)了細胞膜上一種在自然界存在了數(shù)億年的蛋白質(zhì)分子CTLA-4。

1995年，11年后，美國科學(xué)家James Allison通過實驗證明，阻斷CTLA-4可以增強T細胞抗腫瘤活性，并導(dǎo)致小鼠腫瘤消退。

如今距離第一個免疫檢查點抑制劑上市已經(jīng)15年，以免疫為中心的聯(lián)合治療成為癌癥控制策略的主旋律。

本讀書會將最終聚焦在一個臨床現(xiàn)實問題：宿主免疫響應(yīng)的評估與全程管理，聯(lián)合治療策略的原理、機制框架與策略證據(jù)；基于第一性原理的癌癥生存者系統(tǒng)治療與局部管控策略框架。

讀書會框架

發(fā)起人

秦健勇：腫瘤?？漆t(yī)生

長期從事臨床腫瘤學(xué)工作，中國抗癌協(xié)會腫瘤內(nèi)分泌及運動康復(fù)專委會委員，食管腫瘤整合康復(fù)專委會常委。對腫瘤代謝與免疫、癌癥生存者問題有深入探索，長期關(guān)注復(fù)雜科學(xué)框架對復(fù)雜生命現(xiàn)象的工具價值，嘗試以新生物學(xué)理念理解復(fù)雜生命現(xiàn)象。

聯(lián)合發(fā)起人

敖平：理論物理學(xué)博士，系統(tǒng)生物學(xué)的早期開拓者，演化力學(xué)理論的建構(gòu)者。

四川大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師。本科畢業(yè)于北京大學(xué)，獲學(xué)士學(xué)位，隨后由李政道先生的cuspea學(xué)者項目赴美國伊利諾大學(xué)香檳分校攻讀博士學(xué)位，并曾在華盛頓大學(xué)物理系從事博士后研究。

敖平教授的研究集中于系統(tǒng)生物學(xué)中的計算方法和基礎(chǔ)理論框架的建立，主要包括λ噬菌體遺傳開關(guān)的穩(wěn)定性，以及生物網(wǎng)絡(luò)中可靠性和穩(wěn)定性的隨機統(tǒng)計方法；利用隨機動力學(xué)方程組的特解方法的優(yōu)勢，將Darwin-Wallace演化動力學(xué)融入了具備一致性和簡明性特點的數(shù)學(xué)框架中。

在復(fù)雜疾病機理上與系統(tǒng)生物倡導(dǎo)人Leroy Hood等提出癌癥發(fā)生、發(fā)展的新理論：癌癥的內(nèi)源性網(wǎng)絡(luò)理論；并發(fā)展相應(yīng)數(shù)學(xué)和計算工具：隨機過程中的勢函數(shù)。

目前敖平教授的博士論文總引用超過1000次，已發(fā)表了近145篇研究論文，其中3篇發(fā)表于國際頂級期刊美國科學(xué)院院刊（PNAS），16篇發(fā)表于物理學(xué)領(lǐng)域頂級期刊物理評論快報（PRL），超過45篇為生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的論文。

雷錦志：一般力學(xué)博士，數(shù)學(xué)生物學(xué)研究者。

天津工業(yè)大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師，主要從事應(yīng)用數(shù)學(xué)、生物數(shù)學(xué)和計算系統(tǒng)生物學(xué)等研究，在癌癥演變動力學(xué)、干細胞增殖的多尺度建模等領(lǐng)域取得一系列研究成果，提出原創(chuàng)的異質(zhì)性干細胞增殖過程數(shù)學(xué)模型框架。主要研究方向為應(yīng)用數(shù)學(xué)、計算系統(tǒng)生物學(xué)、生物數(shù)學(xué)。

張曉實：臨床醫(yī)生，腫瘤免疫治療深度思考者。

中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院生物治療研究中心副主任兼病區(qū)區(qū)長，教授、主任醫(yī)師，博士生導(dǎo)師、黑色素瘤首席專家。

1983年畢業(yè)于重慶醫(yī)科大學(xué)大學(xué)醫(yī)療系，1998年重慶醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)博士畢業(yè)。張曉實教授是我國腫瘤免疫治療的早期探索者，擅長黑色素瘤的綜合治療及肝癌、腸癌、肺癌、乳腺癌等實體腫瘤的免疫治療。

秦曉玉：生物工程專業(yè)博士生，生命科學(xué)研究范式思考者。

中國科技大學(xué)生命科學(xué)院博士生。本科期間加入視覺系統(tǒng)課題組完成科研啟蒙。在美國跨學(xué)科生物工程實驗室留學(xué)期間，從事生命科學(xué)多Hierarchy研究。頗受SFI復(fù)雜科學(xué)思維框架啟發(fā)，引發(fā)對生命科學(xué)研究范式的探索。

特邀嘉賓

呂有勇：腫瘤生物學(xué)科研工作者，生命科學(xué)范式反思者。

北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院二級教授，北京市腫瘤防治研究所資深研究員。

國家杰出青年基金獲得者；北京大學(xué)(醫(yī)學(xué)部)優(yōu)秀人才獎勵計劃教授，美國中華醫(yī)學(xué)會杰出教授獎獲得者（1994),全國百名青年醫(yī)學(xué)科技新星稱號（1993），國務(wù)院特殊津貼專家（1992）。

主要從事腫瘤基因組、蛋白質(zhì)組、腫瘤生物學(xué)和分子診斷與細胞基因治療研究，積極推動胃腸腫瘤分子分型與個體化治療的轉(zhuǎn)化研究；承擔(dān)國家杰出青年基金、國家973和863重大項目等課題。重點推動我國重大疾病分子分型和個體化診療及腫瘤基因組研究。

在開展研究工作的同時注重技術(shù)平臺和跨學(xué)科研究體系與范式的建立、積極開展國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流和科研合作，并致力與促進臨床與基礎(chǔ)一體化研究模式的建立和科研成果的轉(zhuǎn)化與應(yīng)用推廣。

王小川：百川智能創(chuàng)始人兼 CEO，清華計算機工程博士。

對生命復(fù)雜性充滿好奇心，試圖以數(shù)學(xué)為工具建構(gòu)生命大模型。

高中時用吳文俊消元法在微型機完成初等幾何命題證明，1996 年獲國際信息學(xué)奧賽金牌。曾任搜狗 CEO，主導(dǎo)開發(fā)搜狗輸入法、瀏覽器、搜索等產(chǎn)品，獲多項國家級科技獎項與榮譽。

2023 年創(chuàng)立百川智能，聚焦醫(yī)療 AI，以 “為生命建模型，為人類造醫(yī)生” 為使命。作為國內(nèi)專注醫(yī)療領(lǐng)域的大模型企業(yè)，其成果顯著：2024 年 10 月，百川醫(yī)療大模型在中美執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試準(zhǔn)確率超越 OpenAI；2025 年 2 月，全球首個 AI 兒科醫(yī)生在北京兒童醫(yī)院投入使用并獲專家認可。

特邀主持人

張雅文：集智俱樂部上海站聯(lián)合發(fā)起人。

作為AI產(chǎn)品經(jīng)理與AI創(chuàng)新戰(zhàn)略專家，她同時也是博雅與復(fù)雜科學(xué)愛好者，以及 AI for Good 的踐行者。她曾主導(dǎo)發(fā)布中國首本《科技包容 數(shù)字普惠》白皮書，長期致力于用商業(yè)與技術(shù)賦能具有中國當(dāng)代特色的社會創(chuàng)新。面對智力資源無限的AI時代，她堅信個體已被賦予獨立完成「科研-產(chǎn)業(yè)-博雅」全鏈路閉環(huán)的超級能力。她正致力于推動個體賦能，促進創(chuàng)新者之間的連接與深度溝通，以期涌現(xiàn)出群體智能。她主張將這種技術(shù)驅(qū)動的涌現(xiàn)力量，切實轉(zhuǎn)化為推動良好健康與福祉（SDG 3）、優(yōu)質(zhì)教育（SDG 4）及產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新（SDG 9）的落地價值。

運營助理

曹雨：廊坊師范學(xué)院電子信息工程學(xué)院軟件工程專業(yè)本科生。

適合誰參加？

本次讀書會以免疫現(xiàn)象為具體場景，聚焦腫瘤免疫學(xué)實踐中的核心困惑這一真實臨床問題，嘗試以多學(xué)科和第一性原理的方式來一次持續(xù)約半年的討論，試圖回歸到本體論的源頭探討當(dāng)前腫瘤免疫治療臨床中核心挑戰(zhàn)的邊界和優(yōu)化框架。

本次讀書會薈萃了領(lǐng)域內(nèi)前沿一線的專家學(xué)者，每次線上會討論時間長達1小時左右；非常適合同樣也在困惑中思考的你，加入社區(qū)在線交流，分享、爭鳴、聚合或思維接力，互相激發(fā)出前所未有的思想火花。

本讀書會面向：

· 生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)相關(guān)的本科生、研究生及科研工作者，希望從范式層面深化對本領(lǐng)域的理解

· 物理、數(shù)學(xué)、計算機等理工背景的研究者，對生命系統(tǒng)的復(fù)雜性充滿好奇

· 臨床醫(yī)生與醫(yī)療從業(yè)者，希望從系統(tǒng)科學(xué)視角重新理解疾病與治療

· 對生命復(fù)雜性感興趣的知識分子，渴望在科學(xué)與哲學(xué)的交匯處獲得思想啟發(fā)

· 集智俱樂部復(fù)雜科學(xué)社群成員，希望將復(fù)雜科學(xué)工具拓展至生命與醫(yī)學(xué)領(lǐng)域

信息論的開山宗師Claude Shannon1952年在貝爾實驗室做過一個內(nèi)部演講《Creative Thinking》，其中提到一條是“以盡可能多的不同形式復(fù)述問題”。

他認為“換個詞來描述問題。改變已有的觀點。從每一個可能的角度來看問題。做完之后，你可以嘗試同時從多個角度來看，或許你可以洞察問題的真正基本問題，從而將重要因素關(guān)聯(lián)起來，得出結(jié)論。做到這一點真的很難，但做到這一點很重要。如果你不這樣做，很容易陷入思維定式?！?/p>

其實每個人都有自己的看問題視角，也有自己的思維定式，不自覺地就把自己裝進了籠子里。旁觀者清，在討論與交流中，你可以超越肉體的囚籠，在他人身上看到一個另外的自己。這可能就是討論的意義所在。

誠摯邀請求知若渴的你帶著開放輕松的態(tài)度，讓我們一起開啟一場直擊靈魂的激情之旅吧。

本讀書會的思想邏輯

工具延伸認知 → 認知重塑范式 → 范式生產(chǎn)洞見 → 洞見突破邊界

面對生命這樣高維度的復(fù)雜系統(tǒng)，積累更多數(shù)據(jù)本身并不構(gòu)成理解。新工具帶來新的可見度，但把可見的東西組織成可解釋的知識，卻是一項藝術(shù)，標(biāo)刻著認知的新境界。

實驗室與臨床的隔離、學(xué)科與學(xué)科之間的壁壘，是知識生產(chǎn)效率低下的根本原因。新生物學(xué)2009呼吁打破這些壁壘，在“ 從基礎(chǔ)科學(xué)到應(yīng)用” 的全鏈條上實現(xiàn)知識的自由流動與協(xié)同創(chuàng)新。

美國科學(xué)院新生物學(xué)2009宣稱：

新生物學(xué)家不是懂一點兒所有學(xué)科的人，而是在某一學(xué)科擁有深厚積累、同時對多個領(lǐng)域具備基本流利度的人。

通過本次讀書會，如果希望達到以下三個方面有所啟發(fā)，刷新您對生命科學(xué)認知范式圖景的理解：

范式層面，從Planck的科學(xué)統(tǒng)一愿景出發(fā)，基于免疫學(xué)正在經(jīng)歷從分子還原到系統(tǒng)綜合的事實，打破學(xué)科邊界，構(gòu)建起以問題為驅(qū)動的資源整合信仰。

理論層面，以Einstein的公理化理想為標(biāo)尺，審視當(dāng)前免疫學(xué)理論的成熟度，基于已有的描述性框架和形式化模型探索，探尋具有普遍解釋力的理論框架，重現(xiàn)Niels Jerne1974的榮光。

工具層面，參考Arthur的技術(shù)進化哲學(xué)，追蹤免疫學(xué)技術(shù)棧的遞歸演化，重塑我們的認知框架，在科學(xué)發(fā)現(xiàn)的道路上構(gòu)建服務(wù)于自己科研體系的技術(shù)與工具系統(tǒng)。

讀書會在做什么

免疫復(fù)雜性讀書會，從2026年4月13日開始，每周一晚19：30，連續(xù)半年，聚焦免疫復(fù)雜性主題。

讀書會主題劃分為三個模塊：

【導(dǎo)言】生命科學(xué)范式漫談

由資深生命科學(xué)研究者朱景德教授激情暢談復(fù)雜系統(tǒng)范式對于生命科學(xué)研究的意義。

【機制解讀篇】

由中國學(xué)者敖平教授介紹基于普適的達爾文演化力學(xué)這個第一性原理發(fā)展起來內(nèi)源性網(wǎng)絡(luò)理論在理解復(fù)雜生命現(xiàn)象中的應(yīng)用；這部分的整體架構(gòu)是以EVO-DEV-ECO框架展開的，邀請國內(nèi)研究免疫機制演化和發(fā)育的頂尖團隊，分享他們的研究成果。同時對免疫機制的核心問題如免疫代謝、T細胞功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、神經(jīng)-免疫的對話由長期關(guān)注此問題的資深學(xué)者展開探討。

范式轉(zhuǎn)換需以方法論為基礎(chǔ)，由在此領(lǐng)域深耕的青年才俊介紹干濕結(jié)合的生物學(xué)機制研究方法，免疫穩(wěn)態(tài)與免疫韌性是免疫健康的主旋律，我們也嘗試基于復(fù)雜科學(xué)視角嘗試對其進行解讀……

【數(shù)理建模篇】

數(shù)學(xué)本質(zhì)上是一種精確和強邏輯的描述性語言工具，通用的數(shù)學(xué)符號體系建立起來后數(shù)學(xué)作為工具為人類深化對自然界的認知起了不可或缺的驅(qū)動作用，數(shù)學(xué)在不斷演化中發(fā)展，不斷拓展著人類的認知邊疆。

不少大物理學(xué)家都曾感嘆數(shù)學(xué)不可思議的有效性，數(shù)學(xué)，尤其是對稱性思想在構(gòu)建物理學(xué)宏偉大廈的過程中是不可缺少的工具。數(shù)學(xué)在科學(xué)發(fā)展史上的巨大作用，使得科學(xué)家們又嘗試以數(shù)學(xué)工具介入對生命現(xiàn)象的探索，但又難免惆悵：喟嘆其不可思議的無效性。

癌生物學(xué)家 Robert Weinberg 提出“數(shù)學(xué)能否幫助人們理解生物系統(tǒng)復(fù)雜行為的合理性”這樣一個極具挑戰(zhàn)的問題。應(yīng)用數(shù)學(xué)家林家翹先生提出“20世紀的應(yīng)用數(shù)學(xué)聚焦于物理學(xué)問題，21世紀的應(yīng)用數(shù)學(xué)數(shù)學(xué)應(yīng)致力解決生命學(xué)問題”，預(yù)示了數(shù)學(xué)與生命科學(xué)交叉融合的重要性。在數(shù)理建模篇，將由國內(nèi)一流的數(shù)學(xué)生物學(xué)團隊介紹他們在這一領(lǐng)域的探索，側(cè)重于腫瘤免疫相互作用的數(shù)學(xué)建模，嘗試通過機理與數(shù)據(jù)驅(qū)動相結(jié)合的研究手段，采用微分方程組(隨機或確定性)并結(jié)合隨機模擬來描述腫瘤免疫響應(yīng)的動力學(xué)演變過程。

虛擬細胞在當(dāng)前AI高歌猛進的時代背景下似乎成了時代的寵兒——2026年伊始，最小人造細胞JCVI-syn3A的數(shù)字克隆取得新的進展——虛擬細胞精確復(fù)現(xiàn)了細胞分裂動力學(xué)周期和關(guān)鍵事件。虛擬細胞是理解生命現(xiàn)象的前沿領(lǐng)域，被寄希望應(yīng)用于藥物研發(fā)和臨床藥理學(xué)領(lǐng)域。本次讀書會邀請到了首屆全球虛擬細胞大賽冠軍團隊百圖生科技術(shù)副總監(jiān)郭玉成博士，他將對該次突破性虛擬細胞建模的技術(shù)路線進行解讀，郭玉成博士目前已經(jīng)著手在實驗室復(fù)現(xiàn)此次虛擬細胞的動力學(xué)過程。

【工程技術(shù)篇】

這一模塊將從國藥之光康方生物雙抗類藥物的研發(fā)實踐開始，討論免疫調(diào)節(jié)工具研發(fā)的工程實踐，藥物的臨床驗證和優(yōu)化使用情況。最后聚焦到臨床痛點，宿主治療響應(yīng)的評估與監(jiān)測，提高藥物有效率的聯(lián)合治療和系統(tǒng)管理策略。

模塊的設(shè)計初衷是希望通過系統(tǒng)回顧雙特異性抗體的研發(fā)邏輯、PD-1抑制劑的臨床藥理、免疫紊亂的抗炎治療、情緒應(yīng)激與免疫應(yīng)答之間的機制，結(jié)合幾個具體的典型案例，來討論：

宿主免疫對治療響應(yīng)的監(jiān)控與控制

如何優(yōu)化腫瘤免疫聯(lián)合治療方案？

進而在本模塊跨學(xué)科討論的基礎(chǔ)上回歸到第一性原理，探討新生物視角下臨床困境的出路和科學(xué)探索方向。

【總結(jié)】由在腫瘤免疫學(xué)領(lǐng)域深耕20余年的張曉實教授主持討論，主題是“提高腫瘤免疫治療應(yīng)答率的聯(lián)合用藥策略和系統(tǒng)管理框架”。

運行模式

「免疫復(fù)雜性」讀書會2026季正式啟動

時間規(guī)劃：2026年4月13日開營，共持續(xù)26周左右。

參與形式：騰訊會議——每周一晚上 19：30-21：30。

報名您將獲得：

• 掃描二維碼直達報名通道，鎖定學(xué)習(xí)席位。

• 加入專屬學(xué)員群，與讀書會發(fā)起人、主講人及優(yōu)秀同行直接交流。

• 每期內(nèi)容結(jié)束后可隨時觀看高清視頻回放，支持反復(fù)學(xué)習(xí)與復(fù)習(xí)。

報名參與讀書會

讀書會價格：529元

報名方式

第一步：微信掃碼填寫報名信息。

第二步：填寫信息后，付費報名。如需用支付寶支付，請在PC端進入讀書會頁面報名支付：

第三步：添加運營助理微信，拉入對應(yīng)主題的讀書會社區(qū)（微信群）。

PS：

我們鼓勵圍繞系統(tǒng)腫瘤免疫學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)與數(shù)學(xué)生物學(xué)及相關(guān)具體問題的深入探討。為保證討論質(zhì)量，請避免發(fā)表脫離本期讀書會主題、缺乏實證基礎(chǔ)或過于空泛的哲學(xué)思辨類內(nèi)容。

若討論內(nèi)容明顯偏離主題，經(jīng)主持人提醒后仍未調(diào)整，為維護整體學(xué)習(xí)環(huán)境，我們將不得不將該成員請出討論群，并根據(jù)其實際參與進度，對未參與部分按比例辦理退費。

感謝您的理解與配合，讓我們共同營造一個專注、深入、有收獲的共學(xué)空間。

加入社區(qū)可享核心資源

成為會員即可解鎖完整學(xué)習(xí)生態(tài)，包括：線上實時問答、全部課程錄播回看、獨家資料共享、高質(zhì)量社群交流、第一手信息同步，以及通過參與共創(chuàng)任務(wù)獲取積分等權(quán)益。

特色退費與激勵機制

我們提供以下兩種途徑，讓您的投入獲得實際回饋：

1. 任務(wù)達標(biāo)退費路徑認領(lǐng)并合格完成任意三期字幕任務(wù)，即可退還全額報名費，并額外獲得集智專屬周邊獎勵。

2. 運營成長激勵路徑合格完成一個字幕任務(wù)后，可申請成為運營助理。在讀書會項目順利結(jié)項后，將退還學(xué)費。表現(xiàn)優(yōu)異者，還有機會獲得額外的獎學(xué)金。

一點期待

以免疫檢查點抑制劑為代表的突破性腫瘤免疫治療已經(jīng)走過了15年的歷史，檢查點抑制劑在很多癌種里確實改變了預(yù)后。

但在多數(shù)實體瘤中，客觀緩解率還停留在20%上下。我們?nèi)缃駥γ庖呔W(wǎng)路系統(tǒng)的啟動與調(diào)節(jié)機制仍然理解甚少，未來仍需要望遠鏡和顯微鏡并用，才能一點點迭代我們的認知，優(yōu)化我們的調(diào)控工具。

一部文明史，就是一部人類認知的迭代史。相信SFI關(guān)于生命第一性原理的探索和新生物2009這樣的整合性框架必定會給我們前進的道路上帶來一些有益的啟示和助力。

推薦閱讀文獻

· Hermann Kossel（1894）：Ueber die Behandlung der Diphtherie des Menschen mit Diphtherieheilserum

. Niels Jerne（1974）：Towards a network theory of the immune system

· Alan Perelson（1989）：Immune Network Theory

· 敖平（2005）：Laws in Darwinian evolutionary theory

· Geoffrey Hoffmann（2008）：Immune Network Theory

· Klaus Eichmann（2008）：The Network Collective：Rise and Fall of a Scientific Paradigm

· 左漢賓（2008）：從抗體到復(fù)合免疫網(wǎng)絡(luò)：免疫學(xué)理論進化及其方法論研究

· 美國國家科學(xué)院（2009）：A New Biology for the 21st Century： Ensuring the United States Leads the Coming Biology Revolution

· Robert Weinberg（2010）：Tumor-Host Interactions: A Far-Reaching Relationship

· Daniel Chen & Ira Mellman（2013）：Oncology meets immunology： the cancer-immunity cycle

· Athena Aktipis（2015）：Cancer across the tree of life: cooperation and cheating in multicellularity

· James Allison（2015）：Immune Checkpoint Targeting in Cancer Therapy： Toward Combination Strategies with Curative Potential

· 曹雪濤（2016）：Characteristics and Significance of the Pre-metastatic Niche

· 吳克復(fù)（2016）：免疫的細胞社會生態(tài)學(xué)原理

· Daniel Chen & Ira Mellman（2017）：Elements of cancer immunity and the cancer-immune set point

· Beata Ujvar et al.（2017）：Ecology and Evolution of Cancer

· Galluzzi L et al.（2018）：The hallmarks of successful anticancer immunotherapy

· 陳列平（2018）：A Paradigm Shift in Cancer Immunotherapy: From Enhancement to Normalization

· Bernhard Strauss et al.（2021）：Rethinking Cancer: A New Paradigm for the Postgenomics Era

· Guido Kroemer（2023）：Bodywide ecological interventions on cancer

· 吳家睿（2024）：新科學(xué)時代的思考

· 王峰（2024）：Combined anti-PD-1, HDAC inhibitor and anti-VEGF for MSS/pMMR colorectal cancer: a randomized phase 2 trial.

· Alexander Krauss（2024）：Redefining the scientific method： As the use of sophisticated scientific methods that extend our mind

· 雷錦志（2025）：Mathematical Modeling of Tumor-Immune Interactions： Methods， Applications， and Future Perspectives, CSIAM Trans. Life Sci. 1(2): 200-257. doi:10.4208/csiam-ls.SO-2024-0008.

· Charles Swanton（2024）：Embracing cancer complexity： Hallmarks of systemic disease

· Maya Arce（2024）：Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation

· 周彩存（2025）：Ivonescimab versus pembrolizumab for PD-L1-positive non-small cell lung cancer (HARMONi-2): a randomised, double-blind, phase 3 study in China

· Douglas Hanahan（2026）：Hallmarks of cancer—Then and now， and beyond

閱讀材料選取說明

從1894年第一個治療性抗體的臨床觀察發(fā)表，一直到2026年Hanahan對癌癥現(xiàn)象的最新綜述，這中間跨越了132年。

期間，生命科技迅猛發(fā)展，經(jīng)歷了DNA結(jié)構(gòu)的解析、物理學(xué)家Delbruck將定量研究方法引入生命科學(xué)研究、分子生物學(xué)的興起、單克隆抗體技術(shù)和DNA測序技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用、CRISPR技術(shù)、最小人造細胞的探索、虛擬細胞技術(shù)的發(fā)展，以及AI技術(shù)的爆火。

在長達132年的時間里，選取的這些文獻企圖以蜻蜓點水的手法，對這百年來壯麗的認知迭代史致敬。時間起點為1894年，這是一個中國人難以忘卻的時間節(jié)點，也是中國人大規(guī)模覺醒的時間節(jié)點，但更是人類第一個治療性抗體有效性得到科學(xué)認證的時間節(jié)點。對我而言，這次讀書會也有另外一層意思，某種意義上是為了紀念2018年初的一個讀書總結(jié)（），這篇讀書體會出來后正值免疫治療獲得諾獎的那一年，無意中蹭了一個熱點。

如今這個線上讀書會，也算是對2018年的這個8年前讀書經(jīng)歷的一種紀念吧。