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上海交通大學醫(yī)學院

人工智能蛋白質(zhì)設(shè)計課題組

課題組介紹

課題組網(wǎng)站

https://aiproteindesign.org/

課題組長簡介

張海倉，上海交通大學醫(yī)學院藥學AI系PI、研究員、博士生導師。博士畢業(yè)于中國科學院計算技術(shù)研究所計算機專業(yè)，曾先后在字節(jié)跳動擔任人工智能算法工程師、美國哥倫比亞大學擔任博士后科學家、中國科學院計算技術(shù)研究所擔任副研究員。研究方向聚焦人工智能算法及“AI + 生命科學”交叉領(lǐng)域，尤其在 AI 蛋白質(zhì)設(shè)計 與 AI 藥物設(shè)計方面有長期積累。課題組已經(jīng)開發(fā)了 CarbonDesign、CarbonNovo 等蛋白質(zhì)從頭設(shè)計算法，gMVP、MVP 等蛋白質(zhì)定向進化設(shè)計算法，以及 AbX、AbNovo、DiffAffinity 等抗體設(shè)計專用算法。學術(shù)成果以第一作者或通訊作者身份發(fā)表在Nature Machine Intelligence (2022、2024兩篇)和Nature Communications (2021)等國際期刊，以及 NeurIPS 2023、ICML 2024（兩篇)、ICLR 2025 等人工智能頂會上。曾入選2022年中科院青促會人才項目，主持國自然面上和國家軍科委等國家級項目2項，中科院院級項目1項，上海市人工智能躍升計劃1項。

課題組研究方向

1.人工智能驅(qū)動的蛋白質(zhì)設(shè)計

基于前沿生成式AI模型，建立可編程、高可控、模塊化的蛋白質(zhì)從頭設(shè)計方法，設(shè)計受溫度、磁、光照、離子和小分子等外部刺激調(diào)控的蛋白質(zhì)；開發(fā)蛋白質(zhì)原創(chuàng)藥物，例如抗體、納米抗體、肽和小蛋白等。

2.人工智能驅(qū)動的計算免疫學

構(gòu)建AI 底座模型，解碼 TCR-抗原識別規(guī)則；結(jié)合 AI 模型與高通量濕實驗系統(tǒng)，加速CAR-T、TCR-T等免疫療法的開發(fā)。

3.下一代生成式AI

開發(fā)新一代生成式AI模型；基于強化學習的模型對齊。

招聘崗位要求及待遇

招聘崗位1:助理研究員1名

【崗位要求】

1.具有人工智能、免疫學、數(shù)學、物理、生物信息學、或相關(guān)研究背景；有博士后研究經(jīng)歷（或者國外一流院校獲得博士學位）或相當科研經(jīng)歷，年齡不超過40周歲。

2.以第一作者身份發(fā)表過SCI期刊論文或人工智能頂會(ICML, NeurIPS, ICLR)論文，能獨立完成文章的撰寫等工作。

3.具有一定的基金申請經(jīng)歷，參與或者獨立撰寫過國內(nèi)外基金申請。

4.為人樂觀友善，積極向上。

【崗位職責】

1.在課題組長指導下，完成相應(yīng)科研任務(wù)。

2.協(xié)助課題組長撰寫基金和申報課題等相關(guān)工作。

3.協(xié)助課題組長管理實驗室和相關(guān)行政事務(wù)，指導學生。

【薪資待遇】

應(yīng)聘者一經(jīng)錄用，其工資、福利和社會保險等相關(guān)待遇按上海交通大學醫(yī)學院有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，具體情況面議。

招聘崗位2：博后4名（基礎(chǔ)醫(yī)學院、柔性醫(yī)療機器人重點實驗室、思源博后）

【崗位要求】

1.獲得包括但不限于計算機科學、數(shù)學、免疫學、生物信息學或者相關(guān)專業(yè)方向的博士學位，年齡不超過 35周歲。

2.熱愛科研，有自我驅(qū)動力和快速學習新領(lǐng)域知識的能力。

3.以第一作者身份發(fā)表過SCI期刊論文或人工智能頂會(ICML, NeurIPS, ICLR)論文。具有良好的英文閱讀、寫作能力，能獨立完成文章的撰寫工作。

4.積極樂觀，善于溝通交流，有良好團隊協(xié)作精神。

5.熟悉Linux環(huán)境，Python編程，熟悉Pytorch或Tensorflow。

【崗位職責】

1.在課題組長指導下開展課題研究、論文撰寫等相關(guān)科研工作。

2.協(xié)助課題組長指導學生。

3.協(xié)助課題組長撰寫基金和申報課題等相關(guān)工作，鼓勵申請博后基金。

【薪資待遇】

（一）基礎(chǔ)醫(yī)學院博后待遇

1.提供有競爭力的薪酬，相關(guān)待遇按上海交通大學醫(yī)學院有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，具體情況面議。

2.支持申報各級基金及人才計劃，符合條件者可申請交大醫(yī)學院博士后激勵計劃、上海市“超級博士后”激勵計劃、“博新計劃”等。

3.按規(guī)定繳納相關(guān)社會保險，協(xié)助辦理落戶事宜，參照事業(yè)編制人員標準享受體檢待遇，享有學校公共資源及住房相關(guān)服務(wù)。

（二）柔性醫(yī)療機器人重點實驗室博后待遇

1.參照國內(nèi)/國際同等崗位優(yōu)秀人才，提供有競爭力的薪酬；入站博士后根據(jù)綜合評估（學術(shù)水平、工作計劃、創(chuàng)新能力、發(fā)展?jié)摿Φ龋?，可享受上海市“超級博士后”待遇（年?0萬元起）或優(yōu)秀博士后待遇（年薪30萬元起），提供免費公寓住宿。

2.鼓勵依托本單位申報各級各類科研基金或激勵計劃，配套相應(yīng)科研啟動經(jīng)費；鼓勵開展國際合作和參加國際會議。

3.按規(guī)定繳納相關(guān)社會保險，協(xié)助辦理落戶事宜。

4.學術(shù)成果根據(jù)單位科研績效管理辦法獲得醫(yī)院相應(yīng)的獎勵。

5.海外博士入站可協(xié)助申請上海市及長寧區(qū)等各類補貼。

6.博士后期滿出站，經(jīng)考核和專家評議優(yōu)秀者，優(yōu)先考慮留院工作，認定或評審通過后可取得相應(yīng)專業(yè)技術(shù)資格和職稱證書，按要求協(xié)助申請上海市及長寧區(qū)等各類補貼及安家費。

（三）思源博后待遇及申請條件

待遇：

1.博士后在站期間可以申報國家自然科學基金青年科學基金項目、面上項目、地區(qū)科學基金項目。按照不重復支持的原則，在站期間可以申報國家高層次人才特殊支持計劃青年拔尖人才項目，可以申報“長江學者獎勵計劃”青年學者項目等。

2.資助標準為30萬元/年，資助期3年，給予一次性安家費3萬元。

申請條件：

1.擁護中華人民共和國憲法，遵守國家法律法規(guī)，不得反對中國共產(chǎn)黨的領(lǐng)導和中國特色社會主義制度，品行端正。

2.具有較強的科研創(chuàng)新潛力，從事國際前沿領(lǐng)域研究。

3.博士學位所屬學科為業(yè)內(nèi)公認的世界一流學科，或博士導師為國際公認的一流專家。

4.年齡一般不超過35周歲（1991年1月1日以后出生）。

5.目前尚未回國(來華)或2025年1月1日后回國（來華）。

6.須全職回國(來華)從事博士后研究。

招聘崗位3：實習生4名

【崗位要求】

1.碩士或者博士在讀或者已經(jīng)完成學位，年齡不超過35歲。可來課題組客座實習>=4個月。

2.熱愛科研，充滿好奇心。

3.熟悉Linux環(huán)境，Python編程，熟悉Pytorch或Tensorflow。

4.積極樂觀，善于溝通交流，有良好團隊協(xié)作精神。

【崗位職責】

1.參與課題組科研工作，承擔相應(yīng)科研任務(wù)。

【薪資待遇】

一經(jīng)錄用，其工資等相關(guān)待遇按上海交通大學醫(yī)學院有關(guān)規(guī)定執(zhí)行，具體情況面議。

應(yīng)聘材料及方式

請將下述材料按照以下任一方式投遞至郵箱 ，請在應(yīng)聘材料標題中注明“應(yīng)聘者姓名+應(yīng)聘職位”。應(yīng)聘者應(yīng)提供個人簡歷、申請信（簡述科研興趣及科研計劃，不超過2頁）及至少2名推薦人的聯(lián)系方式。

對于實習生，只需將個人簡歷發(fā)送至上述郵箱。

對于符合要求并通過初審者，將通過電話或郵件的方式發(fā)出面試邀請。申請者信息和相關(guān)材料將嚴格保密。我們熱誠期待您的加盟！該招聘自發(fā)布之日起長期有效，額滿為止。

投遞簡歷請選擇：上海交通大學醫(yī)學院人工智能蛋白質(zhì)設(shè)計課題組

簡歷投遞方式（可選任一）：

1. 掃描二維碼投遞簡歷；

3. 點擊鏈接投遞簡歷：https://data.bioart.com.cn/f/p0EB2y（復制鏈接至瀏覽器投遞簡歷）

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制版人：半夏