特朗普政府削減科研經(jīng)費(fèi)下，已經(jīng)嚴(yán)重波及到AI生命科學(xué)。

　　根據(jù)Science報道，著名的CASP比賽（結(jié)構(gòu)預(yù)測的關(guān)鍵評估）將因為NIH經(jīng)費(fèi)不足而停辦。

　　要知道，AlphaFold2就是在CASP14上一舉成名，以近乎實(shí)驗室的精度實(shí)現(xiàn)對蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的精準(zhǔn)預(yù)測，碾壓所有對手，解決困擾生命科學(xué)60年的難題。

　　就在該比賽4年后，AlphaFold2以重磅級成果獲得了2024年諾貝爾化學(xué)獎，足以見得其對行業(yè)的深遠(yuǎn)意義。

　　可以說CASP促進(jìn)并見證了AI+生命科學(xué)的里程碑式突破。

　　202年諾貝爾化學(xué)獎得主

　　CASP極大程度地推動了AI+生命科學(xué)的進(jìn)展。然而，這項舉辦了30年的計算生物學(xué)卻面臨著停辦危機(jī)。

　　據(jù)報道，來自美國NIH（美國國立衛(wèi)生研究院）的資金已經(jīng)用完，并將在8月8日耗盡負(fù)責(zé)監(jiān)督該贈款的加州大學(xué) 戴維斯分校的緊急支持。

　　或許，我們將等不到CASP17了。

　　AI生命科學(xué)推動者

　　CASP全稱為Critical Assessment of Protein Structure Prediction，意為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的關(guān)鍵評估。

　　該賽事始于1994年，當(dāng)時計算生物學(xué)開始在學(xué)界興起，但所有團(tuán)隊都聲稱自己的蛋白質(zhì)折疊算法最優(yōu)，各家都能給出自己的理由。

　　大家意見不統(tǒng)一，是騾子是馬，不如拉出來溜溜？

　　于是，為了幫助學(xué)界建立一個客觀、統(tǒng)一的評估標(biāo)準(zhǔn)，科學(xué)家John Moult及其伙伴創(chuàng)辦了CASP比賽。

　　它通過盲測和獨(dú)立評估的方式，逐漸成為了評估蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測技術(shù)準(zhǔn)確性的“黃金標(biāo)準(zhǔn)”。

　　比賽中，參賽者們預(yù)測的是一些結(jié)構(gòu)尚未公開的蛋白質(zhì)，同時以獨(dú)立評估的方式，將其和實(shí)驗室結(jié)果進(jìn)行嚴(yán)格的評分。

　　其公正性得到了學(xué)界的一致認(rèn)可，因此當(dāng)AlphaFold2經(jīng)驗亮相CASP14時，雖然震驚了學(xué)界，但科學(xué)家依然相信其評估結(jié)果。

　　如今，該賽事已經(jīng)發(fā)展成全球性的、兩年一度的結(jié)構(gòu)預(yù)測比賽，每年有數(shù)百個團(tuán)隊參與，被譽(yù)為AI生命科學(xué)界的“奧林匹克”。

　　中國也有不少團(tuán)隊拿下過好成績，CASP15中拿下多個第一。常規(guī)target（單體蛋白）預(yù)測類別中，山東大學(xué)楊建益團(tuán)隊排名第一；RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測類別中，中國公司智峪生科居榜首；蛋白質(zhì)-配體復(fù)合物預(yù)測類別中，江蘇理工大學(xué)常珊博士團(tuán)隊位列第一；蛋白質(zhì)復(fù)合物界面接觸殘基精度評估類別中，浙江工業(yè)大學(xué)張貴軍團(tuán)隊排名第一。

　　可以說，CASP對于AI生命科學(xué)的意義是革命性的。它不僅驅(qū)動AI在生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用，也促進(jìn)了AI在整個藥物研發(fā)的應(yīng)用。

　　甚至因AlphaFold2獲得諾貝爾獎的Demis Hassabis稱，也許就在未來十年左右，我們也許能治愈所有疾病。

　　沒有人想停下AI+生命科學(xué)的腳步。

　　無奈停辦？

　　盡管CASP見證了AlphaFold2這一諾貝爾獎成果，但一項諾獎成果只是AI+生命科學(xué)的開始。

　　因為AlphAFold2只解決了單體蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測，CASP已經(jīng)開始將目光投向更復(fù)雜的挑戰(zhàn)，如RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)-配體相互作用、蛋白質(zhì)動力學(xué)等。

　　如今的CASP已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過其最初的規(guī)模，不僅項目一再拓展，同時不僅局限于科研，和產(chǎn)業(yè)界有了更多的聯(lián)系。

　　例如，CASP新增一項比賽項目中是確定藥物分子如何與蛋白質(zhì)靶標(biāo)結(jié)合，這是發(fā)現(xiàn)新藥的關(guān)鍵。如果停辦，這些更前沿、更復(fù)雜的領(lǐng)域的評估和推動將面臨困難。

　　然而現(xiàn)實(shí)是，不止是CASP比賽，很多科學(xué)家因為NIH經(jīng)費(fèi)削減連生存都處了問題。

　　特朗普上臺后，白宮計劃在2026年將美國醫(yī)療健康支出費(fèi)用削減四分之一以上，并將NIH的預(yù)算在今年的基礎(chǔ)上減少180億美元至270億美元，降幅達(dá)40%。

　　由于經(jīng)費(fèi)大幅度削減，導(dǎo)致NIH開啟徹底重組，據(jù)稱，已有近5000名NIH員工和承包商已被解雇，數(shù)千項研究與實(shí)驗陷入停滯狀態(tài)。

　　今年2月，白宮還宣布要求將NIH的“間接經(jīng)費(fèi)”削減至預(yù)算的15%，引發(fā)了強(qiáng)烈的不滿。

　　學(xué)界嚴(yán)厲地指出：特朗普政府的科研經(jīng)費(fèi)削減行動動搖了自第二次世界大戰(zhàn)以來美國聯(lián)邦政府資助大學(xué)科學(xué)研究的制度基礎(chǔ)。

　　而CASP的停擺可能會在一定程度上削弱其作為AI驅(qū)動生物學(xué)進(jìn)步的催化劑作用。

　　因為CASP是唯一一個全球性的、獨(dú)立評估蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法準(zhǔn)確性的比賽。如果停辦，研究人員將缺乏一個客觀、權(quán)威的平臺來比較和驗證新的方法。

　　不僅項目本身需要資助，還包括加州大學(xué)戴維斯分校的贈款用于協(xié)調(diào)大批科學(xué)志愿者，包括實(shí)驗小組、建模小組、評估員等。

　　組織者們?nèi)匀幌Ｍ鸆ASP 能夠得到資助。主辦方表示，如果NIH或其他資助者沒有通過，加州大學(xué)戴維斯分校目前正在探索是否有能力存檔CASP的計算機(jī)服務(wù)器。這樣，競爭對手幾十年的資源就不會丟失。

　　科學(xué)家們紛紛痛惜，希望有人能夠繼續(xù)資助這項賽事。

　　有人表示，谷歌或者Google DeepMind應(yīng)該資助這項賽事，因為它們有充足的資源。

　　但是，即使資金真的到賬，也不能保證在運(yùn)行該計劃的人離開并且科學(xué)志愿者網(wǎng)絡(luò)解散后，CASP的成功會持續(xù)下去。

　　—The End—