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《自然》劉如謙團(tuán)隊(duì)成果:一種療法,有望治多種遺傳??!通用型基因編輯療法登場(chǎng)

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在基因治療領(lǐng)域,科學(xué)家一直面臨一個(gè)嚴(yán)峻挑戰(zhàn):每一種致病突變都需要“單獨(dú)定制”一款基因治療藥物。這種投入高昂、開(kāi)發(fā)周期漫長(zhǎng)的模式難以滿足全球數(shù)千種罕見(jiàn)病的巨大需求。如今,這一困境正被一項(xiàng)突破性技術(shù)打破。

近日,哈佛大學(xué)的劉如謙教授領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)在《自然》雜志上發(fā)表了一項(xiàng)開(kāi)創(chuàng)性研究,他們成功開(kāi)發(fā)出了一種名為“先導(dǎo)編輯介導(dǎo)的提前終止密碼子通讀”(PERT)的創(chuàng)新基因編輯策略。該技術(shù)直指約30%罕見(jiàn)病的共同致病機(jī)制——無(wú)義突變,有望用一種基因編輯藥物同時(shí)治療多種遺傳疾病。


在正常蛋白質(zhì)合成過(guò)程中,細(xì)胞按照mRNA上的遺傳指令逐一組裝氨基酸形成功能蛋白。當(dāng)翻譯裝置讀到UAA、UAG或UGA等終止密碼子時(shí),蛋白質(zhì)合成過(guò)程自然結(jié)束。然而,當(dāng)DNA序列中出現(xiàn)無(wú)義突變時(shí),異常的終止密碼子會(huì)提前出現(xiàn),使翻譯過(guò)程過(guò)早終止,導(dǎo)致細(xì)胞只能產(chǎn)出截短且無(wú)功能的異常蛋白。根據(jù)ClinVar數(shù)據(jù)庫(kù),在超過(guò)20萬(wàn)個(gè)記錄的致病突變中,無(wú)義突變占比高達(dá)24%,涉及巴滕病、泰-薩克斯病、C1型尼曼-皮克病等多種罕見(jiàn)遺傳病。

傳統(tǒng)基因治療通?!爸鹨恍拚辈煌臒o(wú)義突變,但每一種突變都需獨(dú)立開(kāi)發(fā)基因編輯工具,難以規(guī)?;茝V。在最新研究中,劉如謙團(tuán)隊(duì)則提出了更具普適性的思路:通過(guò)基因編輯讓細(xì)胞永久獲得察覺(jué)到終止密碼子異常過(guò)早出現(xiàn)的能力,從源頭上恢復(fù)完整蛋白質(zhì)的生成。這意味著,無(wú)論患者攜帶何種無(wú)義突變,都可能通過(guò)同一種療法獲益,從而推動(dòng)罕見(jiàn)病基因治療向“通用型、一勞永逸”的方向發(fā)展。

這一策略的關(guān)鍵創(chuàng)新在于將先導(dǎo)編輯系統(tǒng)與工程化抑制型tRNA(sup-tRNA)有機(jī)結(jié)合。抑制型tRNA是一類特殊tRNA分子,能夠識(shí)別提前出現(xiàn)的終止密碼子并添加相應(yīng)氨基酸,使翻譯得以繼續(xù)進(jìn)行,從而生成功能性蛋白。在該研究中,團(tuán)隊(duì)通過(guò)系統(tǒng)篩選數(shù)萬(wàn)種tRNA變體,最終構(gòu)建出一種新型抑制型tRNA。

隨后,研究人員利用先導(dǎo)編輯技術(shù)將這種工程化tRNA精準(zhǔn)整合進(jìn)細(xì)胞基因組中,用以替換原有的冗余tRNA序列。研究共同第一作者Steven Erwood博士指出,此次突破得益于先導(dǎo)編輯系統(tǒng)的多功能性,使他們能夠進(jìn)行以往技術(shù)難以實(shí)現(xiàn)的tRNA復(fù)雜修飾。團(tuán)隊(duì)測(cè)試了數(shù)千種先導(dǎo)編輯方案,最終篩選出效率最佳的設(shè)計(jì)。


圖片來(lái)源:123RF

在細(xì)胞模型實(shí)驗(yàn)中,研究者運(yùn)用先導(dǎo)編輯技術(shù),將新型抑制型tRNA分別整合至巴滕病、泰-薩克斯病和C1型尼曼-皮克病的人類細(xì)胞模型。在相同的基因編輯條件下,這些模型中的關(guān)鍵酶活性均恢復(fù)到正常水平的20%-70%,而這一幅度足以達(dá)到緩解臨床癥狀的理論閾值。

在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步在黏多糖貯積癥IH型小鼠模型中驗(yàn)證了PERT策略的有效性。在大腦、肝臟和脾臟等受累組織中,PERT技術(shù)使酶活性恢復(fù)至正常水平約6%,這一水平已足以幾乎完全消除疾病表型。

尤為重要的是,研究未觀察到脫靶編輯、正常蛋白質(zhì)合成異常等安全性風(fēng)險(xiǎn)。研究人員推測(cè),這是因?yàn)椴溉閯?dòng)物細(xì)胞本身具備確保蛋白質(zhì)正確合成的額外機(jī)制,而PERT僅引入低水平的工程化抑制型tRNA,因此對(duì)正常蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程的干擾極小。

PERT技術(shù)的突破性意義在于,它有望打破“一次治療僅針對(duì)一種突變”的限制。若能實(shí)現(xiàn)單種藥物覆蓋多種疾病,可受益的患者群體規(guī)模將呈數(shù)量級(jí)增長(zhǎng)。這既能讓更多患者受益,也將為罕見(jiàn)病基因編輯藥物的研發(fā)創(chuàng)造更強(qiáng)勁的動(dòng)力。

目前,劉如謙團(tuán)隊(duì)正進(jìn)一步優(yōu)化PERT技術(shù),并在更多遺傳疾病的動(dòng)物模型中開(kāi)展系統(tǒng)驗(yàn)證,力爭(zhēng)推動(dòng)其邁向臨床試驗(yàn)。

參考資料:

[1] Pierce, S.E., Erwood, S., Oye, K. et al. Prime editing-installed suppressor tRNAs for disease-agnostic genome editing. Nature (2025). https://doi.org/10.1038/s41586-025-09732-2

[2] Single prime editing system could potentially treat multiple genetic diseases. .Retrieved November 17, 2025, from https://www.broadinstitute.org/news/single-prime-editing-system-could-potentially-treat-multiple-genetic-diseases

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