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PNAS:從球藻到非洲象,生命對溫度的反應(yīng)遵循同一條“萬能曲線”

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導(dǎo)語

PNAS最新生態(tài)學(xué)研究指出,溫度對所有生物學(xué)和生態(tài)學(xué)過程都有強(qiáng)大影響,而熱性能曲線(Thermal Performance Curves, TPCs)已被反復(fù)用于評估這些影響 。在整個生物層級中,TPCs 幾乎總是呈現(xiàn)出一種特定的不對稱形狀,盡管許多不同的競爭機(jī)制和模型在試圖解釋 TPC 現(xiàn)象方面都做得同樣出色 。作者團(tuán)隊分析跨越7界39門、3萬余組測定數(shù)據(jù)后證明:只要將性能與溫度分別用最適值和激活能重縮放,所有熱性能曲線都會坍縮成同一函數(shù) y(x)≈ ex(1-x)——普適熱性能曲線(UTPC),從而從數(shù)學(xué)上解釋了為什么生物系統(tǒng)對溫度的反應(yīng)如此一致 。文中闡明了許多在不同生物、系統(tǒng)和情境中差異巨大 TPC 實際上是同一曲線的重縮放版本。這一發(fā)現(xiàn)將以往紛繁的模型統(tǒng)一為指數(shù)縮放的必然結(jié)果,并從第一性原理揭示:越適應(yīng)高溫的生物,其熱耐受區(qū)間越窄,對溫度波動越敏感,為氣候變暖下的脆弱性篩查提供了可計算標(biāo)尺。

關(guān)鍵詞:熱生物學(xué) (thermal biology),生態(tài)學(xué)代謝理論(MTE),熱性能曲線 (TPC),宏觀生理學(xué) (macrophysiology)

任筱芃丨作者

趙思怡丨審校


論文題目:A universal thermal performance curve arises in biology and ecology 論文鏈接:https://www.pnas.org/doi/abs/10.1073/pnas.2513099122 發(fā)表時間:2025年10月22日 論文來源:PNAS

生命的共同謎題:熱性能曲線的普遍性

溫度,是驅(qū)動地球生命活動最基本的節(jié)拍器之一。從細(xì)胞內(nèi)的生化反應(yīng),到個體的奔跑速度,再到整個生態(tài)系統(tǒng)的能量流動,所有生物和生態(tài)過程都受到溫度的強(qiáng)烈影響 。為了量化這種影響,科學(xué)家們幾十年來一直在使用一種被稱為熱性能曲線(Thermal Performance Curves, TPCs)的工具 。

這些曲線描繪了生物體的性能(如奔跑速度、光合作用速率或種群增長率)如何隨溫度變化 。一個令人著迷的現(xiàn)象是,無論你研究的是細(xì)菌、植物、昆蟲還是蜥蜴,這些 TPC 幾乎總是呈現(xiàn)出一種驚人相似的模式 :隨著溫度升高,性能會呈指數(shù)級增長,達(dá)到一個“最適溫度” (Topt)時表現(xiàn)最佳 ;但一旦超過這個峰值,性能就會急劇下降,墜入“臨界高溫” (Tc)。

這種獨(dú)特的左偏(left-skewed)不對稱形狀(即升溫側(cè)較緩,降溫側(cè)極陡)在整個生物層級中普遍存在 。但為什么會這樣?這個問題的答案卻異常棘手 。

長期以來,科學(xué)家們提出了許多相互競爭的機(jī)制來解釋這一現(xiàn)象。一些模型認(rèn)為是基于酶化學(xué)動力學(xué) (enzyme chemical kinetics),即溫度升高加速反應(yīng),但高溫又會導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性 (protein degradation)。另一些模型則認(rèn)為是供需失配 (supply-demand mismatches),例如在高溫下,生物體(如魚類)對氧氣的需求呈指數(shù)級增長,但其循環(huán)系統(tǒng)(如鰓)的氧氣供應(yīng)能力無法跟上,導(dǎo)致肉身崩潰 。

然而,問題在于,正如作者在論文中(見圖1)所展示的那樣,當(dāng)你用這些不同的模型去擬合同一組實驗數(shù)據(jù)時——比如一種名為 Chlorella vulgaris(普通小球藻)的藻類的光合作用速率 ——你會發(fā)現(xiàn)幾乎所有模型都能給出同樣“出色”的擬合結(jié)果 。這使得我們幾乎無法通過數(shù)據(jù)擬合來辨別究竟哪種理論機(jī)制在起主導(dǎo)作用 。這個重復(fù)出現(xiàn)的形狀,成為了生物學(xué)領(lǐng)域一個懸而未決的核心問題。


本圖采用實證數(shù)據(jù),并調(diào)用 R 語言 rTPC 程序包提供的六種機(jī)制模型完成擬合。

“萬能曲線”:

從阿倫尼烏斯到UTPC的數(shù)學(xué)推導(dǎo)

面對這一僵局,本篇 PNAS 論文的作者們另辟蹊徑。他們沒有試圖尋找又一個近因機(jī)制(proximate mechanisms) ,而是回歸數(shù)學(xué),試圖從第一性原理出發(fā),探尋這種普遍形狀背后的根本原因。他們的研究揭示,這種一致性并非巧合,而是一種深刻的數(shù)學(xué)必然性 。

第一步:簡化阿倫尼烏斯函數(shù)

研究的起點(diǎn)是生物學(xué)中一個廣為人知的理論——生態(tài)學(xué)代謝理論 (Metabolic Theory of Ecology, MTE)。該理論的核心是阿倫尼烏斯函數(shù) (Arrhenius function),它描述了生化反應(yīng)速率隨溫度呈指數(shù)上升的關(guān)系 。然而,阿倫尼烏斯函數(shù)形式復(fù)雜(涉及開爾文溫度的倒數(shù))。

作者的第一個關(guān)鍵洞察是:在生命得以維持的溫度范圍(約-40°C至+80°C)內(nèi) ,這個復(fù)雜的函數(shù)實際上“與一個標(biāo)準(zhǔn)的(以攝氏度為變量的)指數(shù)函數(shù)無法區(qū)分” 。這個看似微小的單位轉(zhuǎn)換,卻帶來了一次徹底的簡化,為后續(xù)推導(dǎo)鋪平了道路。這證實了生物性能在升溫階段的指數(shù)特性是其核心。

第二步:引入一個通用的“衰減因子”

當(dāng)然,生物性能并不會無限地呈指數(shù)增長 。在現(xiàn)實中,高溫必然導(dǎo)致性能下降 。為了在模型中體現(xiàn)這一點(diǎn),作者引入了一個因子函數(shù) (factor function, g(τ))。

這個 g(τ) 非常巧妙,它不代表任何特定的生物機(jī)制(無論是蛋白質(zhì)變性還是氧氣供需失配),而是代表了所有可能導(dǎo)致性能在高溫下衰減的通用過程的集合。因此,任何生物的實際熱性能 Pf ,都可以被建模為指數(shù)上升部分與這個“高溫衰減因子”的乘積 。

那么,性能的峰值——“最適溫度” (Topt)——出現(xiàn)在哪里呢?就出現(xiàn)在指數(shù)上升的速率與“衰減因子”導(dǎo)致的下降速率二者恰好相互平衡的那一刻 。

第三步:重縮放與“萬能曲線”的浮現(xiàn)

這是整個研究中最關(guān)鍵的數(shù)學(xué)步驟。作者們問:如果我們把所有這些形狀各異的 TPC 放到一個統(tǒng)一的坐標(biāo)系下會怎樣?

他們對數(shù)據(jù)進(jìn)行了重縮放 (rescaling)。首先,他們將性能 Pf 相對于其最大值 Pfmax 進(jìn)行歸一化(即數(shù)值范圍重新映射為0-1)。接著,他們將溫度 τ 相對于“最適溫度” τopt 進(jìn)行中心化和縮放。

當(dāng)他們完成了這個過程(在數(shù)學(xué)上使用了泰勒展開),一個驚人的事實出現(xiàn)了:無論最初導(dǎo)致性能衰減的“因子函數(shù)” g(τ) 是什么樣子,也無論它背后的生物學(xué)機(jī)制有多么不同 ,只要它滿足一些非常寬松的條件,最終重縮放后的曲線總是會“坍縮”到同一個、極其簡單的初等函數(shù)上。這個函數(shù)就是


作者將這條曲線命名為——普適熱性能曲線 (Universal Thermal Performance Curve, UTPC)。這個發(fā)現(xiàn)意義重大:它從數(shù)學(xué)上證明了,為什么生物系統(tǒng)對溫度的反應(yīng)如此一致 。許多看似千差萬別的 TPC,實際上都只是這條“萬能曲線”的縮放版本。

跨越生命之樹的證據(jù):萬條曲線歸于一

理論的優(yōu)美固然重要,但它是否符合現(xiàn)實?作者隨后用海量的實證數(shù)據(jù)對 UTPC 理論進(jìn)行了檢驗。

他們首先在論文展示了幾個經(jīng)典案例(見下圖2)。有這樣四組原始數(shù)據(jù):細(xì)菌的特定生長速率、植物的光合作用速率、蜥蜴的奔跑速度以及昆蟲的種群增長率。在它們各自的尺度上,這些曲線的形狀、峰值和寬度天差地別。然而,當(dāng)作者將這些數(shù)據(jù)按照 UTPC 框架進(jìn)行重縮放后,所有數(shù)據(jù)點(diǎn)都緊密地聚集到了同一條 UTPC 曲線周圍。


數(shù)據(jù)與模型共同坍縮至普適熱性能曲線(UTPC),該曲線僅依賴最適與臨界兩個溫度參數(shù)。上排為原始數(shù)據(jù):(A)變形菌門特定生長率(n=131);(B)植物光合速率(n=43);(C)蜥蜴奔跑速度(n=51);(D)昆蟲種群增長率(n=47)。

下排(E–H)給出重縮放后的結(jié)果,所有數(shù)據(jù)點(diǎn)均與 y(x)≈ex(1-x)高度吻合;細(xì)菌數(shù)據(jù)源自 Kontopoulos 等,其余來自 Rezende & Bozinovic。

但這僅僅是開始。為了真正檢驗理論的“普適性”,作者們重分析了兩個超大型數(shù)據(jù)集。這個龐大的數(shù)據(jù)庫(如圖3所示)包含了來自7個生物界(kingdoms)和39個門(phyla)的數(shù)據(jù)——從古菌 (Archea)、細(xì)菌 (Bacteria)到真菌 (Fungi)、植物 (Plantae) 和動物 (Animalia),應(yīng)有盡有。

這些數(shù)據(jù)包含了約30,000條性能測量值,來自2,710項獨(dú)立實驗。性能指標(biāo)也五花八門,包括新陳代謝、個體生長、覓食強(qiáng)度、種群增長等。

結(jié)果是更加震撼的。如下圖3所示,當(dāng)所有這些來自生命之樹各個角落的數(shù)據(jù)點(diǎn)被重縮放后,它們共同匯聚成了一條清晰的曲線。那條黃色的理論 UTPC 曲線完美地穿過了數(shù)據(jù)密度最高的區(qū)域。這強(qiáng)有力地證明了,UTPC 確實是跨越生物尺度、分類單元和性能指標(biāo)的普適規(guī)律。


性能指標(biāo)涵蓋代謝率、個體生長、覓食強(qiáng)度、自發(fā)活動及種群增長等。圖中橫、縱坐標(biāo)均以 2,710 組實驗各自擬合 UTPC 所得的參數(shù),如 Topt、Tc 與 Pf,進(jìn)行無量綱化;黃色實線為 UTPC 理論曲線,數(shù)據(jù)點(diǎn)顏色表示局部密度。

UTPC揭示的深刻權(quán)衡:

激活能、最適溫度與熱范圍

UTPC 框架的威力不僅在于“大一統(tǒng)”,更在于揭示。它揭示了生物在熱適應(yīng)過程中無法逃脫的權(quán)衡 (trade-off)。

研究發(fā)現(xiàn),UTPC 在數(shù)學(xué)上將兩個關(guān)鍵參數(shù)聯(lián)系在了一起:一個是來自阿倫尼烏斯函數(shù)的“激活能” (Ea),它決定了性能隨溫度上升的“陡峭”程度;另一個是“臨界熱范圍” (Tc - Topt),它決定了生物體在峰值性能之上的“耐受”范圍。

UTPC 證明了,這兩者之間存在著嚴(yán)格的反比關(guān)系。換句話說,如果一個生物的激活能 Ea很高(即其性能隨溫度上升非常快),那么它的熱范圍 Tc - Topt必然會很窄 。

與此同時,模型還預(yù)測,更高的激活能 Ea 往往也與更高的最適溫度 Topt相關(guān)聯(lián) 。

將這兩點(diǎn)結(jié)合起來,一個關(guān)乎進(jìn)化和適應(yīng)的根本性權(quán)衡困境就顯而易見。如果一個物種(比如一個熱帶物種)為了適應(yīng)更高的環(huán)境溫度而進(jìn)化出了更高的 Topt,它幾乎必然要通過提高 Ea 來實現(xiàn)。然而,這樣做的代價是,它的熱耐受范圍 Tc - Topt 會被壓縮,變得更窄。

這一發(fā)現(xiàn)為宏觀生理學(xué) (macrophysiology) 中的一個經(jīng)典觀察提供了全新的解釋:為什么適應(yīng)溫暖環(huán)境的物種(高 Topt)往往具有更窄的熱范圍?傳統(tǒng)的解釋(如“Janzen假說”)認(rèn)為這是因為熱帶環(huán)境更穩(wěn)定。但 UTPC 揭示,這可能根本不是一種主動“適應(yīng)”的結(jié)果,而是一種源于生物化學(xué)指數(shù)縮放的、無法逃避的根本性約束。

氣候變化下的“萬能”啟示:一個全新的視角

這項研究為生物學(xué)提供了一項可用于檢驗偏離的零假設(shè)模型(null model)。在 UTPC 出現(xiàn)之前,科學(xué)家們總是在問:“為什么 TPC 是這個形狀?”?,F(xiàn)在,UTPC 告訴我們,這個形狀是指數(shù)縮放的必然結(jié)果。

因此,未來的問題應(yīng)該轉(zhuǎn)變?yōu)椋骸笆鞘裁礄C(jī)制導(dǎo)致了生物偏離UTPC?”或者,“生物體(如恒溫動物和部分變溫動物)在多大程度上可以通過生理調(diào)節(jié)來擺脫 UTPC 的束縛?” 。

最后,這項工作對我們理解氣候變化的影響具有“潛在的令人擔(dān)憂的意義” (potentially concerning implication)。

UTPC 揭示的權(quán)衡是殘酷的:當(dāng)全球變暖迫使生物體通過提高其 Topt 來適應(yīng)時,它們的熱敏感性 (Ea)將不可避免地增加,同時其性能范圍(Tc - Topt)將縮窄。

這對于生物的復(fù)原力 (resilience) 來說是雙重打擊 。未來的氣候不僅平均溫度更高,而且熱浪等極端事件的“熱變率” (thermal variability)也將更大。而那些努力適應(yīng)了更高平均溫度的物種,反而可能因為其熱范圍變得更窄,而更容易在突如其來的溫度波動中崩潰。

UTPC 框架為這一預(yù)測提供了堅實的理論基礎(chǔ)。在氣候變化的時代,理解生物體如何——以及是否能夠——調(diào)整和重塑它們的曲線,可能是區(qū)分未來“贏家”與“輸家”的關(guān)鍵所在。

下一場熱浪,誰會先掉出這條曲線?

參考數(shù)據(jù)庫:https://github.com/AndrewLJackson/UTPC-paper

生命復(fù)雜性讀書會:

生命復(fù)雜系統(tǒng)的構(gòu)成原理

在生物學(xué)中心法則的起點(diǎn),基因作為生命復(fù)雜系統(tǒng)的遺傳信息載體,在生命周期內(nèi)穩(wěn)定存在;而位于中心法則末端的蛋白質(zhì),其組織構(gòu)成和時空變化的復(fù)雜性呈指數(shù)式增長。隨著分子生物學(xué)數(shù)十年來的突飛猛進(jìn),尤其是生命組學(xué)(基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等的集合)等領(lǐng)域的日新月異,當(dāng)代生命科學(xué)臨近爆發(fā)的邊緣。如此海量的數(shù)據(jù)如何幫助我們揭示宇宙中最復(fù)雜的物質(zhì)系統(tǒng)——“人體”的構(gòu)成原理和設(shè)計原理?闡釋人類發(fā)育、衰老和重大疾病的發(fā)生機(jī)制?

集智俱樂部聯(lián)合西湖大學(xué)理學(xué)院及交叉科學(xué)中心講席教授湯雷翰,國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)副研究員常乘、李楊,香港浸會大學(xué)助理教授唐乾元,北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院研究員林一瀚,中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心博士后唐詩婕,共同發(fā)起,從微觀細(xì)胞尺度、介觀組織器官尺度到宏觀人體尺度,梳理生命科學(xué)領(lǐng)域中的重要問題及重要數(shù)據(jù),由生物學(xué)家提問,希望促進(jìn)統(tǒng)計物理、機(jī)器學(xué)習(xí)方法研究者和生命科學(xué)研究者之間的深度交流,建立跨學(xué)科合作關(guān)系,激發(fā)新的研究思路和合作項目。讀書會目前共進(jìn)行10期,現(xiàn)在報名參與讀書會可以加入讀書會社群,觀看視頻回放,解鎖完整讀書會權(quán)限。

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