1975 年，孔令輝出生于黑龍江哈爾濱，家中乒乓氛圍濃厚，父親是黑龍江省乒乓球隊(duì)教練，他從小在乒乓環(huán)境中耳濡目染，對(duì)這項(xiàng)運(yùn)動(dòng)產(chǎn)生了濃厚興趣。

四歲時(shí)，孔令輝進(jìn)入幼兒園開始接觸乒乓球訓(xùn)練，展現(xiàn)出過人的運(yùn)動(dòng)天賦，學(xué)習(xí)新技術(shù)的速度遠(yuǎn)超同齡人。

在其他孩子玩耍時(shí)，他常常主動(dòng)加練，憑借這份刻苦，打下了扎實(shí)的基本功。

十二歲那年，孔令輝成功入選國家青年隊(duì)，1989 年，他一舉斬獲全國少年乒乓球單打冠軍和亞洲少年乒乓球單打冠軍，嶄露頭角。憑借出色的表現(xiàn)，他被蔡振華教練看中，1991 年調(diào)入國家一隊(duì)，與劉國梁并肩訓(xùn)練。

初期兩人因年輕缺乏自律，存在違規(guī)違紀(jì)行為被退回二隊(duì)，但二人知恥后勇，加倍刻苦訓(xùn)練，憑借優(yōu)異的表現(xiàn)重新回到一隊(duì)，蔡振華教練也再次給予他們站上賽場的機(jī)會(huì)。

進(jìn)入一隊(duì)后，孔令輝專注于技術(shù)打磨與提升，1995 年天津世乒賽上，他一路過關(guān)斬將，斬獲男單和男團(tuán)兩項(xiàng)冠軍，在男單決賽中擊敗劉國梁。

他的球風(fēng)極具特色，正手弧圈球力量充沛，防守端穩(wěn)健扎實(shí)，彼時(shí)年僅 20 歲的他，已然成為乒壇焦點(diǎn)人物。

2000 年悉尼奧運(yùn)會(huì)，孔令輝在男單半決賽中對(duì)陣瓦爾德內(nèi)爾，前兩局順利領(lǐng)先的情況下，被對(duì)手連追兩局拖入決勝局。

關(guān)鍵時(shí)刻，他及時(shí)調(diào)整狀態(tài)，頂住壓力拿下決勝局，成功奪得奧運(yùn)金牌，成為乒乓球大滿貫得主。奪冠后他親吻國旗的畫面，點(diǎn)燃了無數(shù)球迷的熱情。

此后，他與劉國梁共同主導(dǎo)中國男乒，多次助力球隊(duì)斬獲團(tuán)體冠軍，對(duì)中國乒乓球隊(duì)的發(fā)展產(chǎn)生了深遠(yuǎn)影響。

巔峰時(shí)期的孔令輝收獲了眾多榮譽(yù)，2004 年雅典奧運(yùn)會(huì)，他助力男隊(duì)拿下團(tuán)體金牌；2005 年上海世乒賽，他又?jǐn)孬@男雙冠軍。

隨著乒壇新生代選手崛起，2006 年，孔令輝的技術(shù)水平逐漸難以跟上國際賽場的節(jié)奏，年初開始兼任教練職務(wù)，競技狀態(tài)也隨之滑坡。

2006 年 10 月 12 日，孔令輝在無錫正式宣布退役，坦言因技術(shù)更新迭代跟不上，已無法適應(yīng)國際高水平賽事的競爭。退役后，他直接轉(zhuǎn)型成為中國女乒助理教練，開啟執(zhí)教生涯。

轉(zhuǎn)型教練后，孔令輝憑借豐富的賽場經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)的技術(shù)認(rèn)知，晉升速度較快，僅用七個(gè)月就成為女隊(duì)領(lǐng)隊(duì)教練。

2010 年起，他開始負(fù)責(zé)重點(diǎn)隊(duì)員培養(yǎng)，帶領(lǐng)郭躍、劉詩雯等選手訓(xùn)練，郭躍在 2007 年薩格勒布世乒賽上奪得女單冠軍，劉詩雯也在他的指導(dǎo)下進(jìn)步顯著。

2013 年 2 月，孔令輝正式出任中國女乒主教練，推行 “女子技術(shù)男性化” 的訓(xùn)練理念，帶隊(duì)拿下 2013 年世界杯女乒團(tuán)體六連冠。2016 年里約奧運(yùn)會(huì)，他率領(lǐng)中國女乒成功衛(wèi)冕團(tuán)體金牌，執(zhí)教成績穩(wěn)定出色。

不過，孔令輝曾多次因個(gè)人行為引發(fā)爭議。2006 年 7 月 21 日凌晨，他駕駛無牌保時(shí)捷在北京朝陽區(qū)工體南門與出租車發(fā)生碰撞，經(jīng)核查存在酒后駕車行為。

事故現(xiàn)場雙方發(fā)生爭執(zhí)，孔令輝最終被處以 1800 元罰款、行政拘留及暫扣駕駛證半年的處罰，相關(guān)事件引發(fā)輿論關(guān)注，不少聲音指出其作為公眾人物缺乏自律意識(shí)。

2011 年 5 月 27 日凌晨，孔令輝在東三環(huán)環(huán)球金融大廈渣打銀行前，因飲酒后想臨時(shí)如廁被保安阻攔，雙方發(fā)生爭執(zhí)并產(chǎn)生肢體接觸。

保安隨后報(bào)警并表示受傷，最終孔令輝賠償醫(yī)療費(fèi)，雙方達(dá)成私下和解。

此次事件再次引發(fā)公眾對(duì)其個(gè)人品行的討論，對(duì)其公眾形象造成一定影響。

2017 年 5 月 29 日，新加坡濱海灣金沙賭場通過香港法院，向孔令輝追討 45.45 萬新加坡元欠款。

據(jù)悉，2015 年 2 月 19 日，孔令輝曾借款 100 萬新加坡元，其中 90 萬兌換為賭博籌碼，10 萬作為 VIP 費(fèi)用，后續(xù)已償還 54.55 萬新加坡元，剩余款項(xiàng)未結(jié)清。

孔令輝通過微博回應(yīng)，稱是幫親友代取籌碼，自身并未參與賭博，但相關(guān)借款單據(jù)上有其簽名，事件真相存在爭議。

該事件曝光后，中國乒協(xié)當(dāng)日便作出決定，暫�？琢钶x中國女乒主教練職務(wù)，要求其立即回國接受調(diào)查。

國家體育總局也明確表示，公職人員必須嚴(yán)守紀(jì)律規(guī)矩，維護(hù)國家和體育隊(duì)伍的形象。

同年 6 月，孔令輝結(jié)清全部欠款，賭場撤回訴訟，但他并未恢復(fù)女乒主教練職務(wù)，此后逐漸淡出國乒執(zhí)教隊(duì)伍。

停職后，孔令輝逐漸淡出公眾視野，行事愈發(fā)低調(diào)。他曾前往重慶少年乒乓球隊(duì)擔(dān)任教練，繼續(xù)深耕乒乓球事業(yè)，不過較少出現(xiàn)在公開場合。2025 年 12 月 29 日，有網(wǎng)友在重慶某超市偶遇孔令輝，照片中的他身形略有變化。