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歸國(guó)!頂尖科學(xué)家,全職加盟復(fù)旦大學(xué)

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3月22日,TOP小編查詢復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系官網(wǎng)發(fā)現(xiàn),舒校坤已全職加盟復(fù)旦大學(xué),擔(dān)任化學(xué)生物學(xué)教授、博導(dǎo)。

此前,校坤教授擔(dān)任美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)藥物化學(xué)系終身正教授、心血管疾病研究所核心研究員、Helen Diller綜合癌癥研究中心成員。


舒校坤教授簡(jiǎn)介


舒校坤,現(xiàn)任復(fù)旦大學(xué)相輝學(xué)者、特聘教授、“百利天恒”冠名教授、化學(xué)生物技術(shù)智能研究所iCOBRAInstitute ofChemical andOpen BiotechnologyResearch andApplication)創(chuàng)始所長(zhǎng)。

回國(guó)前擔(dān)任美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)藥物化學(xué)系終身正教授、心血管疾病研究所核心研究員、Helen Diller綜合癌癥研究中心成員。曾獲美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院主任新創(chuàng)新者獎(jiǎng)(NIH Director’s New Innovator Award)及NIH MIRA等重量級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)。

舒校坤2000年畢業(yè)于四川大學(xué)獲得理論物理學(xué)士學(xué)位,2003年畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)獲得碩士學(xué)位(導(dǎo)師:蔣平教授、車靜光教授);2007年畢業(yè)于俄勒岡大學(xué)獲得生物物理博士學(xué)位(導(dǎo)師:Jim Remington教授)。

舒校坤教授師承諾貝爾獎(jiǎng)獲得者錢永健教授,自2010年起,他成為加州大學(xué)舊金山分校的獨(dú)立PI,并于2020年晉升為正教授。他在Science, Nature Methods, Nature Chemical Biology, Molecular Cell, JACS等頂尖期刊上發(fā)表多篇論文。

近三年代表性學(xué)術(shù)論文及成就(創(chuàng)新性、影響力、與系統(tǒng)性)

2023-2026以通訊作者在Nat. Struct. Mol. Biol., Nat. Chem. Biol., Nat. Microbiol., 和PNAS,ACS Cent. Sci. 等領(lǐng)域內(nèi)頂級(jí)期刊和高水平綜合期刊上發(fā)表多篇具有重大影響力/里程碑學(xué)術(shù)論文。

簡(jiǎn)要總結(jié):1)成像工具創(chuàng)新:基于熱力學(xué)理論(如Flory-Huggins Theory)開發(fā)了系列原創(chuàng)性分子探針及化學(xué)遺傳學(xué)工具,突破了對(duì)活細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)與生物大分子凝聚體高時(shí)空分辨成像與精準(zhǔn)調(diào)控的技術(shù)瓶頸。2)疾病機(jī)制解析:首次解析了細(xì)胞信號(hào)與生物大分子相分離驅(qū)動(dòng)腫瘤發(fā)生的底層分子機(jī)制,為理解復(fù)雜生命現(xiàn)象與重大疾病機(jī)制提供了物理化學(xué)視角。3)新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn):基于上述原創(chuàng)機(jī)制,定義并驗(yàn)證了多個(gè)具有轉(zhuǎn)化潛力的新型藥靶。4)臨床轉(zhuǎn)化:結(jié)合自研的原創(chuàng)工具,開展針對(duì)“不可成藥”靶點(diǎn)在內(nèi)的新型藥靶的創(chuàng)制性藥物研發(fā),打通了從基礎(chǔ)物理化學(xué)原理到臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用的全鏈條。

1) Li X+, Tan SK+, Chung CI+, Hatstat AK, Zhao Q, Luo J, DeGrado WF*,Shu X*. Design of an ultrabright biosensor for dynamic imaging of kinase activity in cells.Proc Natl Acad Sci U S A. 2026. In Press

Innovation (創(chuàng)新): 基于熱力學(xué)原理并結(jié)合蛋白質(zhì)從頭設(shè)計(jì)開發(fā)了激酶活性分子探針NOVARK,對(duì)活細(xì)胞內(nèi)的激酶信號(hào)進(jìn)行高時(shí)空分辨成像。

Impact (影響): 為基于蛋白質(zhì)從頭設(shè)計(jì)原理開發(fā)激酶活性探針鋪平了道路。這些探針可用于對(duì)活細(xì)胞內(nèi)的激酶信號(hào)進(jìn)行讀取,從而解析生命系統(tǒng)的運(yùn)行邏輯。

系統(tǒng)性:NOVARK激酶活性探針是對(duì)本課題組在2018年基于相分離熱力學(xué)原理設(shè)計(jì)的全新激酶活性探針SPARK (發(fā)表于Mol. Cell) 的一次最新拓展。這些激酶活性探針是我們?cè)趯?shí)現(xiàn)生命體內(nèi)細(xì)胞信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的高時(shí)空分辨成像工具開發(fā)方面系統(tǒng)性工作的一部分,其它還包括:1)蛋白酶活性探針,比如2015年開發(fā)的蛋白酶近紅外熒光探針iCasper (發(fā)表于PNAS);2018年開發(fā)的蛋白酶綠色熒光探針 FlipGFP (發(fā)表于JACS);

2)蛋白質(zhì)相互作用分子探針(見下一頁的系統(tǒng)性工作介紹)。

2) Yang J+, Chung CI+, Koach J, Liu H, Navalkar A, He H, Ma Z, Zhao Q, Yang X, He L, Mittag T, Shen Y, Weiss WA,Shu X*. MYC phase separation selectively modulates the transcriptome.Nat Struct Mol Biol. 2024 May 29. PMID: 38811792 PMCID: PMC11479839

Innovation (創(chuàng)新): 首次發(fā)現(xiàn)相分離本身對(duì)MYC靶向基因的調(diào)控具有高度選擇性,對(duì)癌細(xì)胞增殖起關(guān)鍵作用。

Impact (影響): 定義并驗(yàn)證了MYC相分離是一個(gè)全新的潛在藥物靶點(diǎn),其優(yōu)點(diǎn)是相分離抑制劑具有高度選擇性。由于MYC對(duì)70%腫瘤發(fā)生或發(fā)展、以及侵襲、轉(zhuǎn)移、耐藥、重塑腫瘤微環(huán)境、免疫逃逸密切相關(guān),此發(fā)現(xiàn)對(duì)腫瘤分子機(jī)制研究具有重大指導(dǎo)意義,并且提出了針對(duì)“不可成藥”靶點(diǎn)藥物研發(fā)的新范式。

系統(tǒng)性:此項(xiàng)工作,結(jié)合我們?cè)谥掳┤诤限D(zhuǎn)錄因子YAP-MAML2上的工作,共同揭示了相分離的全新生物學(xué)功能,加深了對(duì)生物大分子凝聚體及相分離在生理與病理過程中的作用機(jī)制理解,為研發(fā)“不可成藥”靶點(diǎn)藥物提供了全新理論依據(jù)。

3) Li X, Combs D, Salaita K,Shu X*. Polarized activity of the focal adhesion kinase within single focal adhesions during cell migration.Nat. Chem.Biol. 2023 Jun 22

Innovation (創(chuàng)新): 利用熱力學(xué)的相分離機(jī)制開發(fā)了基因編碼的黏著斑激酶(FAK)活性分子探針,能在活細(xì)胞和脊椎動(dòng)物中可視化內(nèi)源FAK 活性,并且具有高時(shí)空分辨率。首次揭示了 FAK在遷移細(xì)胞前緣高度極化的全新特點(diǎn)。

Impact (影響): 闡明了 FAK 如何充當(dāng)力學(xué)傳感器,在細(xì)胞遷移的黏著斑更新中扮演重要角色,對(duì)理解細(xì)胞遷移包括癌細(xì)胞在腫瘤中的遷移機(jī)制、及開發(fā)新型抑制劑具有重大指導(dǎo)意義。此探針對(duì)探索生命體運(yùn)行的底層邏輯有重大價(jià)值。

4) Chung CI, Yang J, Yang X, Liu H, Ma Z, Szulzewsky F, Holland EC, Shen Y,Shu X*. Phase separation of YAP-MAML2 differentially regulates the transcriptome.Proc Natl Acad Sci U S A. 2024. 121(7): e2310430121.

Innovation (創(chuàng)新): 首次揭示致癌融合轉(zhuǎn)錄因子YAP-MAML2發(fā)生相分離并形成具有轉(zhuǎn)錄活性的生物大分子凝聚體?;跓崃W(xué)Flory-Huggins Theory,通過增加溶質(zhì)與溶劑的相互作用,開發(fā)了可逆的化學(xué)遺傳學(xué)工具,發(fā)現(xiàn)相分離并非全面調(diào)控所有受控基因,而是高度選擇性地影響一小部分目標(biāo)基因。

Impact (影響): 加深了對(duì)生物分子凝聚體在基因轉(zhuǎn)錄中的作用理解,表明相分離在不同靶基因的選擇性調(diào)控中扮演獨(dú)特角色。

系統(tǒng)性:此次研究開發(fā)的化學(xué)遺傳學(xué)工具 (SPARK-OFF),可以精準(zhǔn)溶解轉(zhuǎn)錄因子凝聚體。SPARK-OFF是我們?cè)趯?shí)現(xiàn)對(duì)生命體內(nèi)對(duì)生物大分子凝聚體相分離操控工具開發(fā)方面系統(tǒng)性工作的一部分,另一個(gè)與之互補(bǔ)的工具是SPARK-ON,可以精準(zhǔn)誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子相分離,形成凝聚體。相較于傳統(tǒng)方法,我們工具的優(yōu)勢(shì)是可以在不引入突變、且不改變蛋白質(zhì)豐度情況下精準(zhǔn)操控相分離,廣泛適用于生物大分子凝聚體的研究,對(duì)理解相分離的生物學(xué)功能具有重大意義。

5) Chung CI, Yang J,Shu X*. Chemogenetic Minitool for Dissecting the Roles of Protein Phase Separation.ACS Cent Sci.2023 Jul 26; 9(7):1466-1479.

Innovation (創(chuàng)新): 基于熱力學(xué)Flory-Huggins Theory,通過增加溶質(zhì)與溶質(zhì)相互作用,首次開發(fā)了能夠精準(zhǔn)誘導(dǎo)特定蛋白質(zhì)相分離的化學(xué)遺傳學(xué)工具(SPARK-ON), 用于探索生物分子凝聚物中相分離如何調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子的基因轉(zhuǎn)錄活性。

Impact (影響): SPARK-ON 可以在不引入突變、且不改變蛋白質(zhì)豐度的情況下誘導(dǎo)相分離,為深入研究多種轉(zhuǎn)錄因子及其他生物分子凝聚物的相分離生物學(xué)功能提供了一個(gè)強(qiáng)有力的工具。克服了傳統(tǒng)研究相分離方法的致命缺陷-通常依賴突變,但突變往往會(huì)改變轉(zhuǎn)錄因子自身的活性,導(dǎo)致難以區(qū)分是相分離還是突變直接影響了轉(zhuǎn)錄。

6) Yang J, Xiao Y, Lidsky PV, Wu CT, Bonser LR, Peng S, Garcia-Knight MA, Tassetto M, Chung CI, Li X, Nakayama T, Lee IT, Nayak JV, Ghias K, Hargett KL, Shoichet BK, Erle DJ, Jackson PK, Andino R*,Shu X*. Fluorogenic reporter enables identification of compounds that inhibit SARS-CoV-2.Nat Microbiol. 2023 Jan; 8(1):121-134.

Innovation (創(chuàng)新): 基于全新三級(jí)結(jié)構(gòu)的熒光蛋白UnaG(不同于GFP),開發(fā)了名為SURF的可逆的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用熒光探針。證明SURF適用于高通量篩選,并成功發(fā)現(xiàn)了三種能阻斷病毒在小鼠模型中復(fù)制的天然化合物。

Impact (影響): SURF系統(tǒng)首次能同時(shí)具有高時(shí)空分辨率、無須外源輔因子、由暗到亮熒光變化、能定量檢測(cè)蛋白質(zhì)之間的相互作用強(qiáng)度、定量測(cè)量抑制劑的活性。已成功應(yīng)用于篩選“不可成藥”靶點(diǎn)的抑制劑,包括MYC(未發(fā)表)。對(duì)在活細(xì)胞中研究蛋白質(zhì)相互作用及開發(fā)抑制劑或結(jié)合劑具有重大應(yīng)用價(jià)值。

系統(tǒng)性:SURF是我們?cè)谠O(shè)計(jì)蛋白互作分子探針方面系統(tǒng)性工作的最新進(jìn)展,前幾項(xiàng)工作包括:1)2014年基于Singlet oxygen-mediated Triplet Energy Transfer原理的STET探針,突破了FRET在探測(cè)距離上的限制;2)2018年基于相分離原理設(shè)計(jì)的SPPIER (Separation of Phases-based Protein-protein Interaction Reporter) 探針,比其它基于GFP的探針在亮度上提升了10倍,而且其信號(hào)圖案極易檢測(cè)。

編輯、審核:石瑾鵬

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