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Nat Commun |?陳子江/劉洪彬/頡偉/杜振海團(tuán)隊(duì)合作揭示核仁遷移調(diào)控減數(shù)分裂性染色體沉默的新機(jī)制

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在哺乳動(dòng)物中,雌性( XX )與雄性( XY )細(xì)胞具有性染色體二態(tài)性。為平衡基因表達(dá)劑量水平,在胚胎發(fā)育早期,雌性細(xì)胞內(nèi)一條X染色體會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)錄失活( X chromosome inactivation,XCI)。類似地,在雄性精子發(fā)生的減數(shù)分裂粗線期精母細(xì)胞中, XY 染色體也會(huì)發(fā)生基因轉(zhuǎn)錄沉默,即 減數(shù)分裂性染色體沉默( meiotic sex chromosome inactivation ,MSCI) 。在減數(shù)分裂前期,由于 XY 染色體缺乏同源配對(duì),它們被選擇性地轉(zhuǎn)錄沉默并形成特殊的性泡結(jié)構(gòu)( XY body )。 MSCI 對(duì)維持減數(shù)分裂正常進(jìn)行和雄性生育能力至關(guān)重要,其異??蓪?dǎo)致減數(shù)分裂阻滯和男性不育。已有研究表明,DNA損傷應(yīng)答( DNA damage response ,DDR)因子是 MSCI 啟動(dòng)的關(guān)鍵調(diào)控因子。然而, DDR 信號(hào)介導(dǎo)的 MSCI 啟動(dòng)后,進(jìn)一步實(shí)現(xiàn) XY 染色體基因轉(zhuǎn)錄沉默的具體調(diào)控機(jī)制,仍有待闡明。

近日,山東大學(xué) 婦兒與生殖健康研究院、生殖醫(yī)學(xué)與子代健康全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室陳子江院士、劉洪彬教授,清華大學(xué)頡偉教授,中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心 (上海生化細(xì)胞所)杜振海研究員團(tuán)隊(duì)合作 在 Nature Communications 發(fā)表題為 Nucleolar migration regulates meiotic sex chromosome inactivation via phase separation during mammalian spermatogenesis 的研究論文 。該研究通過系統(tǒng)解析哺乳動(dòng)物精子發(fā)生過程中核仁結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)重塑及其與性染色體的空間互作,揭示了核仁組分通過相分離機(jī)制排除RNA聚合酶II,從而實(shí)現(xiàn)調(diào)控MSCI的分子機(jī)制。


研究者首先利用超分辨率成像技術(shù)( 3D-SIM ),繪制了小鼠精子發(fā)生過程中核仁結(jié)構(gòu)的動(dòng)態(tài)變化圖譜。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在減數(shù)分裂粗線期,核仁發(fā)生顯著重組變化:核仁顆粒組分GC)蛋白 NPM1 和 SENP3 逐步遷移至 XY 染色體并覆蓋整個(gè) XY body ,而致密纖維組DFC)蛋白 FBL 則在后期遷移并局限于 XY body 的一角。這表明不同核仁組分在 MSCI 過程中具有精細(xì)的時(shí)序和空間分工。


圖 1 核仁遷移模式圖

進(jìn)一步研究顯示,核仁組分的遷移依賴于 DDR 信號(hào)。 DDR 關(guān)鍵因子(如 γH2AX 、 MDC1 等)的募集對(duì)核仁組分在 XY 染色體的定位至關(guān)重要,但核仁組分的缺失并不影響 DDR 因子的富集,提示核仁組分變化位于 DDR 信號(hào)的下游。機(jī)制上,SENP3通過去SUMO化修飾調(diào)控NPM1rRNA的結(jié)合能力,從而促進(jìn)其在XY body中的聚集與遷移。

在功能層面,研究者構(gòu)建了 Npm1 和 Senp3 的生殖細(xì)胞特異性敲除小鼠模型。結(jié)果顯示,兩個(gè)基因異常均會(huì)導(dǎo)致 XY body 結(jié)構(gòu)異常、 MSCI 嚴(yán)重受損以及精子發(fā)生阻滯,從而引起雄性不育。轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)一步證實(shí), XY 染色體上絕大多數(shù)基因在突變體中異常激活,證明核仁組分對(duì)于 MSCI 的建立至關(guān)重要。在分子機(jī)制方面,研究發(fā)現(xiàn)核仁組分通過相分離實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)錄機(jī)器的排斥。 NPM1 在 rRNA 存在的條件下形成具有液體性質(zhì)的凝聚體,并在體內(nèi)外均表現(xiàn)出典型的相分離特征。體外重構(gòu)實(shí)驗(yàn)表明, NPM1–rRNA 凝聚體能夠?qū)?RNA 聚合酶 II 及其轉(zhuǎn)錄相關(guān)因子排斥至凝聚體外圍,從而抑制轉(zhuǎn)錄活性。通過構(gòu)建相分離缺陷的 NPM1 突變體小鼠模型,研究者發(fā)現(xiàn)該突變體無法定位至 XY body ,且無法恢復(fù) MSCI 缺陷,說明其相分離能力對(duì)于其功能至關(guān)重要。

此外,研究還揭示了 rRNA 在此過程中的關(guān)鍵作用。通過抑制 RNA 聚合酶 I 轉(zhuǎn)錄,研究者發(fā)現(xiàn) rRNA 缺失會(huì)導(dǎo)致核仁組分無法正常覆蓋 XY 染色體,同時(shí)引起 MSCI 失效和轉(zhuǎn)錄異常激活。由此表明, rRNA 不僅是核仁結(jié)構(gòu)的重要組成部分,也直接參與 MSCI 調(diào)控。

值得注意的是,在 MSCI 建立的早期階段, XY 染色體缺乏穩(wěn)定的抑制性表觀修飾(如 H3K9me2/3 等),此時(shí)核仁組分介導(dǎo)的相分離機(jī)制提供了一種可逆的轉(zhuǎn)錄抑制方式。隨著減數(shù)分裂進(jìn)程推進(jìn),穩(wěn)定的異染色質(zhì)標(biāo)記逐漸建立, MSCI 由可逆狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)椴豢赡鏍顟B(tài)。這一發(fā)現(xiàn)為理解染色體沉默過程中不同調(diào)控層級(jí)之間的銜接提供了新的視角。

綜上所述,該研究揭示了核仁在哺乳動(dòng)物精子發(fā)生中的動(dòng)態(tài)重編程過程,提出了核仁遷移相分離轉(zhuǎn)錄排斥的新機(jī)制,闡明了MSCI的關(guān)鍵分子基礎(chǔ)。這一發(fā)現(xiàn)不僅深化了我們對(duì)MSCI調(diào)控機(jī)制的理解,也為核內(nèi)結(jié)構(gòu)調(diào)控基因表達(dá)及男性不育相關(guān)疾病的研究提供了重要理論依據(jù)。

審稿人評(píng)價(jià) “This is truly a remarkable study and will mark a significant milestone in our understanding of MSCI and the nucleolus.”


圖 2 NPM1 、 SENP3 和 rRNA 是 MSCI 中 DDR 信號(hào)通路至關(guān)重要的下游效應(yīng)因子

山東大學(xué)陳子江院士、劉洪彬教授,清華大學(xué)頡偉教授 及中國(guó)科學(xué)院 杜振海研究員為本文共同通訊作者。山東大學(xué)博士后李孟靜、博士生李涵臻 與 中國(guó)科學(xué)院 杜振海博士為本文共同第一作者。 研究過程中還 得到了劉默芳教授、童明漢 研究員、 陸林宇教授 、羅孟成教授 等專家的支持與幫助,在此一并致謝。

博后招聘 兩則:

中科院 上海生化細(xì)胞所 杜振海實(shí)驗(yàn)室 招聘 博后 / 助理研究員 :

https://cemcs.cas.cn/rczp/yjz/202603/t20260313_8159131.html

山東大學(xué)婦兒與生殖健康研究院博后招聘信息:

https://mp.weixin.qq.com/s/Snvl05uTE1Xul_8Gvc7Hpg

https://www.nature.com/articles/s41467-026-70932-z

制版人: 十一

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