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Journal of Medical Virology

巴西圣保羅州和塞阿拉州的研究人員與中國(guó)香港大學(xué)的同事合作，在蝙蝠中發(fā)現(xiàn)了一種新型冠狀病毒研究人員在刺突蛋白的RBD中發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵殘基，表明可能與 MERSr-CoV 的受體 DPP4 相互作用。

這些發(fā)現(xiàn)凸顯了冠狀病毒的廣泛遺傳多樣性、新病毒譜系的存在以及在巴西傳播的蝙蝠冠狀病毒中發(fā)生的重組事件，并強(qiáng)調(diào)了持續(xù)監(jiān)測(cè)與冠狀病毒溢出事件相關(guān)的公共衛(wèi)生風(fēng)險(xiǎn)的必要性。

南美洲蝙蝠中的MERS樣冠狀病毒發(fā)現(xiàn)

研究人員在 2022 年 5 月至 2023 年 7 月期間從巴西東北部塞阿拉州的不同地理來(lái)源采集了樣本。這項(xiàng)研究旨在通過(guò)分子檢測(cè)篩選來(lái)自 16 種不同蝙蝠物種的 423 個(gè)口腔和直腸拭子，然后進(jìn)行深度 RNA 測(cè)序 (RNA-Seq) 和進(jìn)化分析，以識(shí)別冠狀病毒。

研究人員在兩種蝙蝠物種（Molossus molossus 和 Artibeus lituratus）中檢測(cè)出了七種不同的冠狀病毒（CoVs）。通過(guò)RNA-Seq獲得病毒基因組信息，并利用MegaBLAST和BLASTn分析基因序列的同源性。為了填補(bǔ)基因組中的空白區(qū)域，研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一套新的引物并通過(guò)Sanger測(cè)序完成了擴(kuò)增。

通過(guò)MegaBLAST分析發(fā)現(xiàn)，其中一株病毒（BetaCoV UNIFESP mBSS）與中東呼吸綜合征相關(guān)冠狀病毒（MERSr-CoV）具有71.9%的核苷酸相似度，且覆蓋了82.8%的病毒基因組。此外，該病毒在巴西的發(fā)現(xiàn)引發(fā)了對(duì)該地區(qū)可能存在人畜共患傳染病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)注。

此外，研究人員利用多種算法（如RDP、GENECONV、MaxChi等）對(duì)病毒基因組進(jìn)行了重組檢測(cè)。結(jié)果顯示，存在明顯的重組信號(hào)，尤其在刺突蛋白編碼基因區(qū)域（spike gene）。

病毒變種的發(fā)現(xiàn)

除了BetaCoV UNIFESP mBSS外，研究還發(fā)現(xiàn)了一種SARSr-CoV樣病毒，其基因組覆蓋率為30%，與SARSr-CoV具有65.1%的核苷酸相似性。

此外，研究團(tuán)隊(duì)鑒定出了多種其他冠狀病毒，包括：

• 與人類普通感冒相關(guān)的229E樣蝙蝠冠狀病毒

• Tylonycteris bat CoV HKU4（與MERSr-CoV密切相關(guān)）

• Pipistrellus bat CoV HKU5（與Vs-CoV-1類似）

• Hedgehog-CoV-1（與刺猬冠狀病毒和Betacoronavirus Erinaceus具有較高相似性）

基因組特征及進(jìn)化分析

通過(guò)最大似然（Maximum Likelihood）系統(tǒng)發(fā)育樹分析，研究發(fā)現(xiàn)部分病毒可能屬于未分類的冠狀病毒。

進(jìn)一步的基因組比對(duì)顯示，這些新發(fā)現(xiàn)的CoVs在RBD（受體結(jié)合域）上具有多種關(guān)鍵氨基酸殘基（如P463、Y499、D510、D537、Y540、R542），這可能影響其與人類受體DPP4的結(jié)合能力。

此外，為了弄清楚它是否能與人體細(xì)胞結(jié)合，必須在高生物安全性實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。這些試驗(yàn)計(jì)劃于 2025 年在香港大學(xué)進(jìn)行。

研究強(qiáng)調(diào)了南美洲蝙蝠體內(nèi)存在豐富的冠狀病毒多樣性，其中一些病毒與MERSr-CoV等人畜共患病原體存在較高的相似性，提示這些病毒可能存在跨種傳播和適應(yīng)人類宿主的潛力。

總結(jié)

本研究首次在南美洲蝙蝠中發(fā)現(xiàn)了與MERSr-CoV密切相關(guān)的冠狀病毒及多種尚未分類的病毒株。研究結(jié)果突顯了蝙蝠在攜帶潛在人畜共患病毒方面的重要性，并強(qiáng)調(diào)了全球范圍內(nèi)持續(xù)監(jiān)測(cè)野生動(dòng)物病毒的必要性，以及時(shí)發(fā)現(xiàn)和防范可能引發(fā)疫情的病毒株。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.70173?saml_referrer

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