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深度科學(xué)| Nat. Catal.:元素機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù):用隨機(jī)探索打開多相催化研究新紀(jì)元

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編者語:

模型不需要理解整個結(jié)構(gòu),只需要理解局部原子環(huán)境的物理特性,EMLP能夠像DFT一樣真正描述原子間相互作用。

01

背景介紹

催化研究領(lǐng)域,密度泛函理論(DFT)數(shù)十年來一直是揭示催化反應(yīng)微觀機(jī)理的核心工具。然而,隨著研究的深入,DFT的計算瓶頸日益凸顯,其計算成本隨體系規(guī)模呈指數(shù)級增長,使得研究大型復(fù)雜體系或探索動態(tài)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)變得不切實(shí)際。雖然經(jīng)典力場方法計算成本較低,但在定量精度和普適性方面遠(yuǎn)不及量子力學(xué)方法。

1. 用于材料模擬的機(jī)器學(xué)習(xí)方法

神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)(MLPs)的出現(xiàn)開始緩解這一矛盾(圖1),能夠在保持DFT級精度的同時實(shí)現(xiàn)接近經(jīng)典力場的計算效率。但當(dāng)前的MLP方法存在一個根本性局限——它們通?!跋到y(tǒng)依賴”,即只能在訓(xùn)練時見過的特定結(jié)構(gòu)體系上表現(xiàn)良好。這就像是一個只會解答特定題目的學(xué)生,遇到新問題就束手無策

2025年9月23日,上??萍即髮W(xué)/英國貝爾法斯特女王大學(xué)胡培君、上??萍即髮W(xué)謝聞博團(tuán)隊(duì)在Nature Catalysis期刊發(fā)表題為“General reactive element-based machine learning potentials for heterogeneous catalysis”的研究論文,開發(fā)了一種革命性的元素級機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)(EMLP),通過獨(dú)特的隨機(jī)探索虛擬化學(xué)優(yōu)化(REICO)采樣策略(圖2),打破了這一局限。該方法不再依賴特定的結(jié)構(gòu)或反應(yīng)路徑,而是專注于學(xué)習(xí)元素間的基本相互作用,從而實(shí)現(xiàn)了真正的普適性和反應(yīng)性預(yù)測能力。

2. 圖文總覽

02

核心創(chuàng)新

1.革命性采樣策略:REICO方法

該研究提出了隨機(jī)探索虛擬化學(xué)優(yōu)化(REICO)采樣策略,徹底改變了傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)的訓(xùn)練數(shù)據(jù)生成方式。與傳統(tǒng)方法依賴特定表面結(jié)構(gòu)或反應(yīng)路徑不同,REICO通過完全隨機(jī)采樣來構(gòu)建訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,生成包含隨機(jī)晶胞參數(shù)、原子數(shù)量和元素比例的虛擬化學(xué)結(jié)構(gòu)。這種方法使訓(xùn)練數(shù)據(jù)完全脫離結(jié)構(gòu)空間的限制,專注于原子間相互作用的多樣性本質(zhì)。

2.元素級機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)(EMLP)架構(gòu)

開發(fā)了元素級機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)(EMLP)新架構(gòu),其核心創(chuàng)新在于僅需要知道涉及元素即可構(gòu)建模型,無需任何領(lǐng)域?qū)I(yè)知識。通過多階段選擇方案,從數(shù)百萬隨機(jī)結(jié)構(gòu)中精選出最具代表性的數(shù)據(jù)點(diǎn),確保了訓(xùn)練集既包含隨機(jī)結(jié)構(gòu)的多樣性,又涵蓋穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的合理性。

3.卓越的普適性與反應(yīng)性

EMLP展現(xiàn)了前所未有的普適性預(yù)測能力,能夠準(zhǔn)確處理訓(xùn)練時未見過的任意結(jié)構(gòu)體系。在二聚體掃描測試中,EMLP精確預(yù)測了各種元素組合的相互作用;在分子動力學(xué)模擬中,其軌跡與DFT參考高度一致;在復(fù)雜催化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中,EMLP成功預(yù)測了從簡單表面到特殊表面的各種反應(yīng)能壘和焓變。

4.多相體系的統(tǒng)一描述

實(shí)現(xiàn)了固液氣多相體系的統(tǒng)一精確描述,超越了傳統(tǒng)MLP的應(yīng)用局限。研究證明EMLP不僅能準(zhǔn)確預(yù)測多相催化反應(yīng),還能可靠模擬有機(jī)化學(xué)反應(yīng)、表面動力學(xué)和液相環(huán)境,展示了其真正的通用性和跨領(lǐng)域應(yīng)用潛力。

5.計算效率與可及性

相比傳統(tǒng)方法,REICO-EMLP框架具有顯著的計算效率優(yōu)勢,僅需要約10,000個結(jié)構(gòu)/元素的訓(xùn)練數(shù)據(jù)即可達(dá)到優(yōu)異性能。這種modest的CPU和GPU需求使該方法具有廣泛的可及性,為大規(guī)模推廣應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

3. REICO采樣、EMLP訓(xùn)練流程及應(yīng)用總結(jié)

03

圖文解析

1.開發(fā)了通用且高精度的EMLP勢函數(shù)

研究團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了針對Pd-Ag催化劑與含C/H/O物種相互作用的Ag-Pd-C-H-O五元素EMLP。該勢函數(shù)僅基于元素信息,無需預(yù)設(shè)反應(yīng)路徑或特定結(jié)構(gòu),即能實(shí)現(xiàn)與密度泛函理論(DFT)相媲美的定量精度。測試表明,其在能量和力預(yù)測上的誤差顯著低于MACE-mp、EquiformerV2和M3GNet等現(xiàn)有主流基礎(chǔ)模型。通過與傳統(tǒng)分子動力學(xué)(MD)采樣數(shù)據(jù)的對比,REICO生成的數(shù)據(jù)集不僅涵蓋了MD樣本的所有區(qū)域,還在能量和局部原子環(huán)境方面實(shí)現(xiàn)了顯著擴(kuò)展。這種隨機(jī)采樣方法有效避免了傳統(tǒng)方法因過度依賴穩(wěn)定金屬結(jié)構(gòu)的周期性對稱性而導(dǎo)致的過擬合問題。

4. 分析RECIO生成的數(shù)據(jù)集和二聚體掃描性能

2.在多項(xiàng)基準(zhǔn)測試中表現(xiàn)優(yōu)異

二聚體掃描測試:對所有元素組合的二聚體相互作用預(yù)測與DFT結(jié)果高度吻合,準(zhǔn)確捕捉了短程排斥作用和原子分離時的力變化趨勢。

分子動力學(xué)模擬:在Ag28O22和Pd34O56團(tuán)簇的MD模擬中,EMLP軌跡與DFT

大分子吸附:對包含364個原子的PTCDA分子在Ag(111)表面的弛豫,EMLP精確預(yù)測了吸附構(gòu)型和分子-表面距離。

5. 來自EMLP和其他基礎(chǔ)模型的MD和表面吸附結(jié)構(gòu)預(yù)測

3.在多相催化反應(yīng)預(yù)測中實(shí)現(xiàn)突破

研究系統(tǒng)評估了CO氧化、乙炔加氫、費(fèi)-托合成等多個典型催化反應(yīng)體系:

CO氧化:在多種Pd和Pd/Ag表面(包括簡單晶面、孿晶界、納米棒及單原子催化劑)上,EMLP均能準(zhǔn)確預(yù)測反應(yīng)能壘和焓變。

表面覆蓋效應(yīng):成功預(yù)測了清潔Pd(111)和氫覆蓋Pd(111)表面的乙炔加氫反應(yīng)路徑,與DFT結(jié)果高度一致。

復(fù)雜反應(yīng)網(wǎng)絡(luò):對費(fèi)-托合成過程中從C1到C6的21個基元步驟,EMLP完整復(fù)現(xiàn)了DFT計算的能量曲線,過渡態(tài)搜索成功率達(dá)100%。

6. 各種鈀和 Pd/Ag 表面上 CO 氧化反應(yīng)的預(yù)測

7. 對具有覆蓋效應(yīng)的各種鈀基表面上C2H2氫化(氫原子逐步添加到C2H2中形成C2H6)的反應(yīng)預(yù)測。

8. 對 Pd(100) 上費(fèi)托合成反應(yīng)的擴(kuò)展反應(yīng)路徑的反應(yīng)預(yù)測

4.超越多相催化的廣泛應(yīng)用能力

研究還將EMLP拓展至有機(jī)化學(xué)反應(yīng)、固-液界面和水溶液環(huán)境等多個領(lǐng)域:

有機(jī)反應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)測試:對Baker和Chan提出的標(biāo)準(zhǔn)測試反應(yīng),EMLP預(yù)測的活化能和反應(yīng)焓與DFT值偏差僅0.1-0.2 eV。

液相環(huán)境模擬:通-過umbrella sampling獲得了Pd(111)表面CO氧化在explicit 水分子存在下的自由能剖面,與DFT結(jié)果高度一致。

溶液體系結(jié)構(gòu):對液態(tài)甲醇的徑向分布函數(shù)模擬成功復(fù)現(xiàn)了氫鍵網(wǎng)絡(luò)等關(guān)鍵結(jié)構(gòu)特征。

9. 跨固相、液相和氣相的附加基準(zhǔn)

04

總結(jié)

這項(xiàng)研究代表了機(jī)器學(xué)習(xí)勢函數(shù)發(fā)展的范式轉(zhuǎn)變:構(gòu)建多相催化MLP不再僅僅是一個回歸問題,而根本上是一個采樣問題。通過REICO采樣策略,研究團(tuán)隊(duì)成功地將訓(xùn)練集構(gòu)建與傳統(tǒng)的"有意義結(jié)構(gòu)"概念分離,專注于生成多樣化和代表性的局部原子環(huán)境。

EMLP 的卓越性能體現(xiàn)在: 1 )在目標(biāo)元素領(lǐng)域內(nèi)實(shí)現(xiàn)了普適性和反應(yīng)性的平衡; 2 )能夠準(zhǔn)確預(yù)測任意結(jié)構(gòu)的能量和力; 3 )在復(fù)雜催化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中保持高度一致性; 4 )超越多相催化的廣泛應(yīng)用能力。

05

展望(巨人肩上前行)

1. 增加訓(xùn)練數(shù)據(jù)規(guī)模來系統(tǒng)探索和提升EMLP的潛力。

2. 將自旋態(tài)、磁性、長程相互作用和外部場等更復(fù)雜的化學(xué)信息納入EMLP框架,拓展其應(yīng)用范圍?

3. 利用EMLP的直接反應(yīng)模擬能力,大規(guī)模研究反應(yīng)機(jī)理和動力學(xué)。

文獻(xiàn)信息

Changxi Yang, Chenyu Wu, Wenbo Xie, Daiqian Xie & P. Hu, General reactive element-based machine learning potentials for heterogeneous catalysis, Nature Catalysis, 2025, 8, 891-904.

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