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63次實驗鎖定184萬種可能!清華團隊用AI撬開化學(xué)新反應(yīng)寶藏

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只做 63 次實驗,從 100 多萬中可能的配方組合中,找到了最優(yōu)解。

這是清華大學(xué)教授羅三中和團隊的最新成果,他們使用AI找到了一個高效的全新化學(xué)反應(yīng)寶藏。這個反應(yīng)可以使用鈷配合物和一種名為烯胺的中間體進行巧妙結(jié)合,把生活中常見的醛類分子變成藥物或者材料中間體,事實上日常中的很多香料和氣味就來自于醛類分子。

羅三中告訴 DeepTech:“我們大概將發(fā)現(xiàn)時間從傳統(tǒng)可能需要的兩年縮短到了兩個月,將實驗嘗試次數(shù)從通??赡苄枰^ 200 次縮減到了 63 次?!?/p>

更重要的是,AI 找到的最優(yōu)配方和人工找到的最優(yōu)配方幾乎完全不同。這就好比人類從東邊上山找到了一條路,而 AI 從西邊出發(fā)找到了另一條更快的捷徑。這說明 AI 的思維方式確實能夠跳出人類的思維定式,發(fā)現(xiàn)那些被人類忽略的寶藏角落。

同時,這一成果也展示了一種關(guān)于未來化學(xué)研究的強大新模式:即由人類專家提供想法和方向,AI 算法負責探索和優(yōu)化,兩者進行強強聯(lián)合。這意味著人們開發(fā)新藥、新材料和新能源的效率將能得到加快,化學(xué)的疆域也將變得更加廣闊。


圖 | 羅三中(來源:羅三中)

化學(xué)世界的尋寶路徑變遷:從憑經(jīng)驗到憑算法

據(jù)了解,羅三中長期從事物理有機化學(xué)研究,以發(fā)展仿生手性伯胺催化體系和推動人工智能與催化研究融合著稱,其開發(fā)的催化劑被國際同行稱為“羅催化劑”。

對于羅三中這樣的化學(xué)家來說,他們的目標之一就是把簡單的小分子底物,通過特定的連接方式,也就是化學(xué)反應(yīng),組裝成復(fù)雜且有用的大分子結(jié)構(gòu),比如能夠治病的藥物分子或者能讓屏幕發(fā)光的材料分子。這個過程需要用到一個工具箱,里面裝著催化劑、試劑、溶劑等各種工具,能夠幫助小分子底物以正確的方式進行連接。

傳統(tǒng)方式是一個經(jīng)驗豐富的手工大師。在過去,化學(xué)家要想找到一個新的化學(xué)反應(yīng),主要依靠化學(xué)直覺。這個過程就像在黑暗中摸索,非常依賴個人的經(jīng)驗。有時,一個微小的改變比如催化劑上某個原子的大小就會讓結(jié)果天差地別。面對成百上千種可能的工具組合(即化學(xué)反應(yīng)空間),即使是資深化學(xué)家也有可能漏掉隱藏的最優(yōu)組合。

而羅三中此次瞄準的是一個特別復(fù)雜的組裝任務(wù):讓烯胺和一種高價態(tài)的金屬鈷配合物合作。這種合作模式在以前很少被實現(xiàn),因為這就像讓來自兩個不同種類的生物學(xué)會默契地配合一樣困難。

并且,羅三中團隊面對的工具箱大得驚人:有 44 種可能的伯胺催化劑、20 種鈷催化劑、15 種氧化劑、14 種添加劑、10 種溶劑。簡單算一下,這些工具的排列組合超過了 184.8 萬種類。如果使用傳統(tǒng)方法一一嘗試,是一個絕對不可能的任務(wù)。

他告訴 DeepTech:“當我們要創(chuàng)制物質(zhì),包括精細化學(xué)品、藥物、功能材料、高分子等物質(zhì),都離不開形成新的化學(xué)鍵。人們把形成新化學(xué)鍵的模式稱為新反應(yīng)。通常,一類新反應(yīng)的出現(xiàn)會帶來合成這些分子的變革性進步?!?/p>

因此,如何找到新反應(yīng)是有機合成化學(xué)的核心問題,其背后是產(chǎn)值巨大的精細化學(xué)品產(chǎn)業(yè),這也是中國制造業(yè)的支柱性行業(yè)之一。所以,羅三中希望將傳統(tǒng)依賴試錯的模式,轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€智能化、數(shù)據(jù)驅(qū)動、自動化的完整流程。這其中,如何用算法和數(shù)據(jù)加速是不可或缺的。


(來源:https://www.nature.com/articles/s44160-025-00944-y)

化學(xué)獵犬登場:AI與人類的夢幻聯(lián)動

于是,羅三中團隊請來了他們的超級助手,一種基于貝葉斯優(yōu)化算法的 AI 工具。在使用時:

首先,要構(gòu)建反應(yīng)空間。該團隊提出了一個巧妙的反應(yīng)設(shè)想:先是使用有機胺和醛反應(yīng)生成烯胺,然后讓鈷催化劑把烯胺氧化,借此生成一個活潑的中間體,最后這個中間體進一步被氧化后就能和各種親核試劑比如醇進行結(jié)合,從而得到目標產(chǎn)物?;谶@個設(shè)想,他們確定了上面提到的包含 184.8 萬種可能的工具箱列表。

接著,他們進行了第一輪的貝葉斯優(yōu)化。

AI 并不是一頭扎進去亂找,而是利用 CVT 算法選擇了 5 個具有代表性的起始點進行實驗。拿到實驗結(jié)果之后,算法模型就會進行飛速學(xué)習(xí)。它能從這幾次嘗試中,推測出哪些區(qū)域更可能有寶藏,然后重點推薦下一批實驗點。這時,該團隊就可以根據(jù) AI 推薦去做實驗,再把新結(jié)果反饋給它。

就這樣,通過人類實驗和 AI 分析推薦,形成了一個高效的學(xué)習(xí)-探索循環(huán)。AI 就像一個永不疲倦的超級導(dǎo)航員,不斷地縮小搜索范圍。同時,羅三中團隊也會在此期間進行介入,根據(jù)AI發(fā)現(xiàn)的一些線索例如某個氧化劑的特殊表現(xiàn),來動態(tài)地調(diào)整工具箱,從而去掉一些希望不大的工具,同時也會加入一些新的候選者。這個過程讓搜索范圍從 184.8 萬種,一步步縮小到 54.6 萬種,再到 11.44 萬種。

期間,僅僅經(jīng)過 63 次實驗,AI 就鎖定了一個完美的配方:使用特定的胺催化劑、鈷催化劑、以 N-氯代丁二酰亞胺為氧化劑,碳酸氫鉀為添加劑,在二氯甲烷溶劑中進行反應(yīng)。通過這個配方得到了 57% 的產(chǎn)率和 90% 的對映選擇性,成功制造出了目標分子。

另外,他們在另一組實驗里完全依靠自己的化學(xué)直覺和經(jīng)驗,期間也進行了超過 200 次組合的實驗篩選,最終也找到了一個不錯的配方,但是效果略遜于 AI 找到的配方。

最后,他們還做了一些對比實驗。

在第一個對比實驗里,他們發(fā)現(xiàn)如果讓 AI 一開始就學(xué)習(xí)人類專家篩選過的、比較好的數(shù)據(jù),AI 確實能夠更快地在這個優(yōu)勢區(qū)域里找到更好的點,但是它也會被困在這個區(qū)域,失去了探索更廣闊未知世界的動力。

在第二個對比實驗里,他們讓 AI 從一個完全不同于前兩輪的區(qū)域開始探索,它雖然沒有找到更好的配方,但卻意外發(fā)現(xiàn)了一條新路。在某些條件下,這一反應(yīng)甚至不需要之前認為必須使用的堿。這說明化學(xué)反應(yīng)的最優(yōu)組合可能不止一個,可能有多個不同的配方組合都能達到好效果。


(來源:https://www.nature.com/articles/s44160-025-00944-y)

AI 配方和人類配方相差無幾

找到一個好配方,故事才完成了一半。羅三中團隊還需要知道:這個新反應(yīng)的通用性到底有多高?它能組裝哪些不同形狀的小分子底物?

過去,在評估底物適用范圍的時候,人們一般會挑選一些看起來容易反應(yīng)的、結(jié)構(gòu)類似的分子來嘗試。但是,這可能會漏掉很多其他類型的分子,無法真正看清楚這個反應(yīng)的全貌。

這一次,該團隊再次讓AI幫忙,使用上了聚類分析的方法。他們從市場上 6,000 多種含羥基的化合物中,篩選出 2,356 種結(jié)構(gòu)各異的候選者。這時,AI 就像超級圖書管理員一樣,根據(jù)這些分子的結(jié)構(gòu)特性,把它們分成了13個不同的類別。

這時,該團隊要做的就是從每個類別中挑選幾個代表進行實驗。這樣一來,只需做幾十次實驗,就能大致摸清楚這個反應(yīng)對于 2,356 種不同分子的適應(yīng)能力。這比隨機測試或者只測試少數(shù)幾種,要科學(xué)得多。

實驗證明,這個新的鈷-烯胺催化系統(tǒng)就像是一個萬能選手。

對于各種帶有取代基的苯甲醇,無論是帶供電子基團還是吸電子基團,反應(yīng)效果都很好。簡單的乙醇、長鏈的烷基醇甚至一些結(jié)構(gòu)復(fù)雜的天然產(chǎn)物分子和藥物分子衍生物,都能順利地參加反應(yīng),并能達到高產(chǎn)率和高選擇性的產(chǎn)物。當然,新的鈷-烯胺催化系統(tǒng)也有不擅長的地方,比如對于一些酚類化合物和空間位阻特別大的醇,效果就不太理想,但是恰恰幫助該團隊看清楚了這個反應(yīng)的邊界。

更有趣的是,利用 AI 優(yōu)化的配方和人類專家優(yōu)化的配方,在面對一大批各種樣式的小分子底物時,前者和后者的表現(xiàn)各有千秋、旗鼓相當。這說明 AI 不僅可以找到新路徑,并且有著較高的可靠性和通用性。


(來源:https://www.nature.com/articles/s44160-025-00944-y)

以新原理做杠桿撬動未知分子世界

那么,這個新反應(yīng)為何可以成功?為了弄清這一問題,該團隊又做了很多實驗。結(jié)果發(fā)現(xiàn),如果去掉鈷催化劑、胺催化劑或氧化劑中的任何一個,反應(yīng)就會完全停止,這說明三者缺一不可。

他們還直接使用一種預(yù)先準備好的具有氧化性的鈷化合物,來代替鈷催化劑和氧化劑,這時反應(yīng)竟然也能發(fā)生。這證明了鈷催化劑是引發(fā)后續(xù)反應(yīng)的關(guān)鍵氧化物種。

他們還在反應(yīng)體系中加入了一種名為 TEMPO 的自由基捕捉劑,結(jié)果反應(yīng)卻被抑制了,同時他們捕捉到了自由基中間體的加成產(chǎn)物,這證明反應(yīng)過程中確實有高活性自由基中間體的生成。

通過電化學(xué)和紫外可見光譜實驗,該團隊親眼看到了鈷催化劑從烯胺/亞胺中間體那里獲得電子的過程。

綜合所有線索,他們描繪出了這個精巧的分子機理工作原理圖,期間最妙的地方在于,鈷催化劑不再只是一個旁觀者,而是直接參與了最關(guān)鍵的電子轉(zhuǎn)移,并與有機中間體形成了動態(tài)的鈷-碳鍵,實現(xiàn)了真正意義上的協(xié)同催化。這就像兩個工人不再是各干各的,而是手拉手、步調(diào)一致地完成了一個高難度動作。

羅三中總結(jié)稱,這次成果展示了一種 AI 加速新反應(yīng)發(fā)現(xiàn)的可行方法論;并且其催化的化學(xué)模式本身是全新的。這種模式有巨大的應(yīng)用潛力,可以用于合成藥物分子、高分子材料等,帶來物質(zhì)創(chuàng)造維度的創(chuàng)新。

他表示,“從化學(xué)角度來說,我們在這個新反應(yīng)中操控了兩個壽命極短(毫秒級以下)的高活性物種,讓它們以可控的方式發(fā)生全新的轉(zhuǎn)化。而且,使用的催化劑體系非常廉價:鈷是廉價金屬,有機胺催化劑分子量小、成本低,二者的結(jié)合實現(xiàn)了過去做不到的反應(yīng)?!薄?/p>


(來源:https://www.nature.com/articles/s44160-025-00944-y)

當然,這項研究的意義遠遠不止于發(fā)現(xiàn)了一個新的鈷-烯胺反應(yīng),更像是展示了一套可復(fù)用的工具箱,掀開了未來化學(xué)研究的一角。

那就是,它證明人類設(shè)計 +AI 探索的模式,可以極大加速新反應(yīng)的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化,讓科學(xué)家可以從繁瑣的試錯中解放出來,讓他們更有時間去思考真正前沿和根本的科學(xué)問題。

同時,AI 也讓上述過程變得更加系統(tǒng)、更加客觀和更加可量化。由此而發(fā)現(xiàn)的新反應(yīng)預(yù)計可被用于新藥研發(fā)、新材料創(chuàng)制、綠色化學(xué)等多領(lǐng)域。

正如羅三中所言:“未來,我們將有可能去探索:能否用AI發(fā)現(xiàn)更多像點擊化學(xué)這樣具有變革性的新反應(yīng)?我們這項工作提供了一個起點,后續(xù)希望更多研究者能將這類工具引入他們的工作。如能與自動化實驗結(jié)合,人的角色將主要是提供靈感和思想,而整個發(fā)現(xiàn)流程可以通過機器人、數(shù)據(jù)和算法來完成加速?!?/p>

這實際上是“AI for Science”在化學(xué)、尤其是有機合成領(lǐng)域的一個具體實踐范例。它也回應(yīng)了《科學(xué)》雜志提出的“未來 125 個重要科學(xué)問題”之一:AI 如何改變化學(xué)研究,能否加速新反應(yīng)發(fā)現(xiàn)、創(chuàng)造性地設(shè)計合成路線。而羅三中團隊則用本次研究給出了肯定的回答。

參考資料:

相關(guān)論文https://doi.org/10.1038/s44160-025-00944-y

運營/排版:何晨龍

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