從“藍(lán)圖”到“施工隊(duì)”——揭秘生命真正的執(zhí)行者

在中心法則的指引下，mRNA如同生命的“藍(lán)圖”，而核糖體則是高效的“施工隊(duì)”。然而，僅僅知道有哪些“藍(lán)圖”（轉(zhuǎn)錄組）是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。哪些藍(lán)圖正在被高效執(zhí)行？施工進(jìn)度如何？是否存在“停工”或“擁堵”？這些動(dòng)態(tài)過程，才是決定細(xì)胞命運(yùn)和功能的關(guān)鍵。

歡迎關(guān)注“翻譯組學(xué)”，這片連接基因組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)的重要前沿領(lǐng)域。作為國(guó)內(nèi)專業(yè)的翻譯組技術(shù)服務(wù)商，卿澤生物致力于為您提供全方位、高精度的翻譯組學(xué)研究解決方案，助力您揭開基因表達(dá)調(diào)控的最后一層神秘面紗。

公司簡(jiǎn)介：前沿技術(shù)驅(qū)動(dòng)，專注翻譯組技術(shù)服務(wù)

卿澤生物是一家專注于翻譯組學(xué)技術(shù)開發(fā)與服務(wù)的生物科技公司。我們以深厚的專業(yè)技術(shù)積累和先進(jìn)的硬件平臺(tái)為基石，為國(guó)內(nèi)外高校、科研院所、醫(yī)院及藥企提供一站式的頂尖科研服務(wù)。

核心技術(shù)平臺(tái)：以多聚核糖體圖譜技術(shù)為根基，建立了覆蓋Polysome-seq, Ribo-seq, 線粒體Ribo-seq, Disome-seq等全方位的技術(shù)體系。

核心硬件保障：擁有專業(yè)的蔗糖梯度分離系統(tǒng)和超速離心機(jī)等核心設(shè)備，確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的高分辨率與卓越重復(fù)性。

資深團(tuán)隊(duì)：核心團(tuán)隊(duì)成員均來自知名院校，具備多年翻譯組學(xué)技術(shù)實(shí)操與數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，能為您提供從課題設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)執(zhí)行到數(shù)據(jù)解讀的全程專業(yè)支持。

核心技術(shù)詳解：多維度捕捉翻譯動(dòng)態(tài)

基石技術(shù)：多聚核糖體圖譜

原理簡(jiǎn)介：利用蔗糖密度梯度超速離心技術(shù)，將細(xì)胞提取物中的核糖體及其結(jié)合的mRNA按大?。▎魏颂求w、二聚體、多聚核糖體等）進(jìn)行分離。通過監(jiān)測(cè)各梯度的吸光度，即可得到一幅反映整體翻譯效率的“圖譜”。

解決的科學(xué)問題：

（1）全局翻譯水平評(píng)估：快速判斷細(xì)胞或組織在特定條件（如應(yīng)激、藥物處理、疾病狀態(tài)）下的整體蛋白質(zhì)合成活性。

（2）特定基因翻譯效率：結(jié)合qPCR，可定量分析特定mRNA的翻譯效率，區(qū)分轉(zhuǎn)錄調(diào)控和翻譯調(diào)控。

技術(shù)延伸：Polysome-seq

在Polysome Profiling的基礎(chǔ)上，收集多聚核糖體結(jié)合的mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序。從而在全基因組范圍內(nèi)，精確量化每一條mRNA的翻譯效率。

金標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)：SelectiveRibo-seq

原理簡(jiǎn)介：利用核酸酶消化未被核糖體保護(hù)的mRNA片段，再通過蔗糖密度梯度超速離心技術(shù)捕捉單個(gè)核糖體嚴(yán)密保護(hù)的約28-30 nt的“足跡”。對(duì)這些足跡進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序，可實(shí)現(xiàn)對(duì)正在翻譯的核糖體進(jìn)行單核苷酸精度的定位。

解決的科學(xué)問題：

（1）精確鑒定翻譯起始位點(diǎn)：發(fā)現(xiàn)上游開放閱讀框和短肽。

（2）揭示翻譯速率：通過核糖體密度分析基因各區(qū)域的翻譯速度。

（3）從頭鑒定開放閱讀框：發(fā)現(xiàn)新型微肽或非經(jīng)典ORF。

特色技術(shù)：線粒體Ribo-seq

原理簡(jiǎn)介：在Ribo-seq基礎(chǔ)上，通過優(yōu)化線粒體提取或富集方案，專門用于研究線粒體基因組編碼基因的翻譯過程。線粒體核糖體保護(hù)的特征性片段長(zhǎng)度與胞質(zhì)核糖體不同。

解決的科學(xué)問題：研究線粒體蛋白質(zhì)合成的獨(dú)特調(diào)控機(jī)制，與細(xì)胞能量代謝、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)退行性疾病及癌癥等重要生物學(xué)過程密切相關(guān)。

前沿技術(shù)：Disome-seq

原理簡(jiǎn)介：專門捕獲和測(cè)序由兩個(gè)核糖體形成的“雙核糖體”所保護(hù)的mRNA片段。這通常代表了核糖體在mRNA上翻譯暫?；驕舻膮^(qū)域。

解決的科學(xué)問題：

識(shí)別翻譯暫停位點(diǎn)：發(fā)現(xiàn)哪些密碼子或mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)會(huì)導(dǎo)致核糖體“卡頓”。

研究共翻譯調(diào)控：理解蛋白質(zhì)折疊、翻譯質(zhì)量控制等過程。

揭示mRNA穩(wěn)定性調(diào)控新機(jī)制：翻譯暫停常與mRNA降解途徑相關(guān)聯(lián)。

合作共贏：客戶案例與文獻(xiàn)展示

案例一：[中山大學(xué)]，[Molecular Cancer]，[IF=37.3]

本研究發(fā)現(xiàn)了一種新的低氧應(yīng)答環(huán)狀RNA circINSIG1，該環(huán)狀RNA在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)上調(diào)，并與晚期臨床分期和低生存率相關(guān)。機(jī)制上，采用Polysome profiling和qPCR分析等技術(shù)證實(shí)circINSIG1編碼一個(gè)121個(gè)氨基酸的蛋白circINSIG1-121，通過募集CUL5-ASB6復(fù)合物(一種泛素E3連接酶復(fù)合物)，促進(jìn)關(guān)鍵膽固醇代謝調(diào)節(jié)因子INSIG1第156和158位賴氨酸的k48關(guān)聯(lián)泛素化，從而誘導(dǎo)膽固醇生物合成，促進(jìn)結(jié)直腸癌的增殖和轉(zhuǎn)移。原位異種移植腫瘤模型和患者源異種移植模型進(jìn)一步確定了circINSIG1在CRC進(jìn)展中的作用和CRC的潛在治療靶點(diǎn)。

總之，本研究發(fā)現(xiàn)的circINSIG1提供了一種表觀遺傳機(jī)制，揭示了缺氧與膽固醇代謝之間的聯(lián)系，為CRC的治療提供了一個(gè)有希望的治療靶點(diǎn)。

案例二：[復(fù)旦大學(xué)]，[Advanced Science]，[IF=15]

本研究通過系統(tǒng)分析非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)細(xì)胞分泌的外泌體，發(fā)現(xiàn)了一種缺氧誘導(dǎo)的外泌體環(huán)狀RNA--circPLEKHM1。它可將巨噬細(xì)胞極化為M2型來驅(qū)動(dòng)NSCLC轉(zhuǎn)移。機(jī)制上，外泌體circPLEKHM1促進(jìn)PABPC1-eIF4G相互作用，促進(jìn)抑瘤素M受體(OSMR)的翻譯（Polysome profiling+qPCR），從而促進(jìn)巨噬細(xì)胞極化與癌癥轉(zhuǎn)移。重要的是，circPLEKHM1靶向治療可顯著降低NSCLC體內(nèi)轉(zhuǎn)移，因此，circPLEKHM1可作為非小細(xì)胞肺癌患者轉(zhuǎn)移和生存不良的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。

本研究揭示了癌細(xì)胞如何在缺氧腫瘤微環(huán)境中與巨噬細(xì)胞相互作用以促進(jìn)轉(zhuǎn)移的新機(jī)制，并強(qiáng)調(diào)了外泌體circPLEKHM1作為肺癌轉(zhuǎn)移預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的重要性。

客戶文章部分展示

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INTERVIEW

翻譯組學(xué)正以前所未有的深度和精度，推動(dòng)著生命科學(xué)研究的革命。無論您是研究發(fā)育分化、疾病機(jī)制，還是進(jìn)行藥物靶點(diǎn)開發(fā)，卿澤生物都將是您最值得信賴的合作伙伴?。?！

如果您正面臨以下科學(xué)問題：

• 表型差異無法用mRNA水平解釋？
  

• 想深入探索基因表達(dá) beyond transcription？
  

• 希望從翻譯層面發(fā)現(xiàn)新的調(diào)控機(jī)制？
  

請(qǐng)立即聯(lián)系我們！我們的技術(shù)專家團(tuán)隊(duì)將為您量身定制最合適的研究方案，助您的研究成果邁向新高峰！

我們已成功完成了近萬次的樣品測(cè)試

樣品類型包括細(xì)胞、組織、植株

物種涵蓋了哺乳動(dòng)物、斑馬魚、水生生物如牡蠣、植物（如水稻、小麥、白菜、擬南芥）、細(xì)菌、真菌、酵母、單核生物如賈第蟲，特殊樣品軟骨、眼結(jié)膜等

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