第二天大家告別卡露乃繼續(xù)旅程，途中小智先是收服了一只號稱為森林冠軍的摔角鷹人，再是參加了一次空中挑戰(zhàn)賽讓小箭雀進化成為火箭雀。隨后他們經(jīng)過一路的磨煉總算來到了娑羅道館進行挑戰(zhàn)，館主名為科爾尼，眾人還幫助她和路卡利歐完成了mega進化。

很快比試開始前幾輪對決雙方各有勝負，其中小智的摔角鷹人擊敗了功夫鼬，火箭雀則是戰(zhàn)勝了豪力，不過它們都敗給了科爾尼的mega路卡利歐。

面對這樣強大的對手小智選擇用皮卡丘上陣迎敵，只見雙方爆發(fā)了激烈的交鋒，電氣與能量彼此沖撞，數(shù)十個回合的苦戰(zhàn)之后賽場已是煙霧迷茫，但是戰(zhàn)斗仍舊沒有結(jié)束，小智和科爾尼依然斗志高昂。就此皮卡丘擊敗了mega路卡利歐，小智成功取得第三枚徽章戰(zhàn)斗徽章。

接著又是一番旅途，大家結(jié)識了一位忍者朋友三普，對方正在執(zhí)行上忍布置的送信任務(wù)，可是有一位忍者卻帶著龜足巨鎧想要搶奪書信，這只龜足巨鎧異常強大，一個照面三普立刻陷入險境。

為了幫助好友小智指揮呱呱泡蛙迎戰(zhàn)龜足巨鎧，但是無論是甲賀忍蛙、皮卡丘還是呱呱泡蛙都無法戰(zhàn)勝龜足巨鎧，而神秘忍者更是下令龜足巨鎧痛下殺手，就這樣呱呱泡蛙進化為呱頭蛙，靠著一招居合斬龜足巨鎧和神秘忍者被成功擊敗。

其實神秘忍者就是三普的上忍，此行的目的也是為了對三普進行忍者的試煉。在此之后先前的烏賊王再次展開行動，原來它隸屬于一個神秘組織并且有著眾多的同伙，這次它們搶奪了科學(xué)家的能量儀器想要以此重塑世界，見狀小智等人和君莎小姐都想要阻止對方，然而依靠催眠術(shù)烏賊王輕松制服了眾人。

危難之際小次郎的栗烏賊召集了無數(shù)烏賊同伴進行反擊，團結(jié)產(chǎn)生的力量擊退了神秘組織的烏賊王，隨即本次的能量危機總算解除，另一邊小智遇到了一只弱小自卑的黏黏寶，在他和皮卡丘的鼓勵下黏黏寶恢復(fù)自信主動加入小智團隊。

接著大家來到了第四座海翼道館進行挑戰(zhàn)，戰(zhàn)斗中火箭雀輕松戰(zhàn)勝了毽子棉，不過館主的口呆花卻先后擊敗了火箭雀和摔角鷹人。好在小智的呱頭蛙力挽狂潤，先是逆屬性地戰(zhàn)勝了口呆花，再是看穿了坐騎山羊的招式并用水之波動擊潰對手，借此小智成功得到第四枚徽章植物徽章。

在離開了海翼道館后小智還與莎莉娜進行了首次約會，兩人在誓約之樹下互贈禮物場面溫馨感人。第二天受到鼓勵的莎莉娜首次參加了三冠衛(wèi)星表演賽，雖然這次比賽莎莉娜表演失誤慘遭淘汰，但是她會帶著小智贈予的緞帶向著更高的目標邁進。之后眾人繼續(xù)上路。