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Sci Adv?| 肖俊宇團(tuán)隊(duì)與趙明輝、譚穎團(tuán)隊(duì)合作揭示補(bǔ)體系統(tǒng)C3轉(zhuǎn)化酶組裝及識(shí)別底物C3的分子機(jī)制

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補(bǔ)體系統(tǒng)是天然免疫的重要組成部分,是人體免疫的第一道防線。補(bǔ)體系統(tǒng)由50多種可溶性蛋白和細(xì)胞表面受體組成,在清除病原體、調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)及維持體內(nèi)穩(wěn)態(tài)等過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。補(bǔ)體系統(tǒng)的功能紊亂與多種人類疾病有關(guān),包括腎臟病、風(fēng)濕性疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和心血管疾病等。補(bǔ)體系統(tǒng)通過三條獨(dú)立但相互關(guān)聯(lián)的激活途徑發(fā)揮功能:經(jīng)典途徑、凝集素途徑和旁路途徑。這三條途徑最終在核心成分C3處匯合,C3經(jīng)由C3轉(zhuǎn)化酶裂解,生成C3a和C3b兩個(gè)片段。C3a作為一種過敏毒素,誘導(dǎo)炎癥反應(yīng);C3b則作為調(diào)理素結(jié)合在病原體表面,放大補(bǔ)體激活信號(hào),增強(qiáng)被標(biāo)記病原被吞噬細(xì)胞識(shí)別和清除的能力以及參與激活補(bǔ)體下游組分【1-4】。

C3轉(zhuǎn)化酶是補(bǔ)體系統(tǒng)中的關(guān)鍵酶復(fù)合物,在激活補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)中起核心作用。C3轉(zhuǎn)化酶主要有兩種形式:經(jīng)典途徑和凝集素途徑中的C4b2a復(fù)合物,以及旁路途徑中的C3bBb復(fù)合物。C4b2a中C4b由經(jīng)典途徑中的絲氨酸蛋白酶C1s或凝集素途徑中的MASP-2切割C4形成,隨后與C2結(jié)合形成酶原C4b2,C2再次被兩種酶切割形成具有活性的C4b2a復(fù)合物;C3bBb轉(zhuǎn)化酶則由C3b與因子B結(jié)合并在因子D作用下形成,形成的C3bBb復(fù)合物可被Properdin穩(wěn)定。然而,C4b2a和C3bBb復(fù)合物高度不穩(wěn)定,在形成后數(shù)分鐘內(nèi)即完全解離,這給其研究帶來了很大挑戰(zhàn)。補(bǔ)體核心環(huán)節(jié)的C3bBb轉(zhuǎn)化酶識(shí)別C3的詳細(xì)機(jī)制仍未明確。以及,經(jīng)典/凝集素途徑C4b2a轉(zhuǎn)化酶的組裝及其底物結(jié)合機(jī)制也尚不清楚,這在一定程度上限制了其作為治療靶點(diǎn)的開發(fā)【5-8】。


圖1. 補(bǔ)體級(jí)聯(lián)通路示意圖。紅色標(biāo)記為本研究中解析完成的復(fù)合物。

2026年2月20日,北京大學(xué)肖俊宇課題組聯(lián)合北京大學(xué)第一醫(yī)院腎內(nèi)科趙明輝、譚穎團(tuán)隊(duì)在Science Advances期刊發(fā)表題為

Complement C3 recognition by C3 convertases
的研究論文,系統(tǒng)揭示了補(bǔ)體系統(tǒng)兩種C3轉(zhuǎn)化酶的組裝機(jī)制,同時(shí)獲得了兩種轉(zhuǎn)化酶結(jié)合底物C3后形成的“Michaelis”復(fù)合物(酶與底物形成的中間體) ,闡明了補(bǔ)體系統(tǒng)轉(zhuǎn)化酶識(shí)別并切割核心組分C3的分子機(jī)制,解決了補(bǔ)體生物學(xué)中長期存在的關(guān)鍵問題,為靶向補(bǔ)體治療研究提供了堅(jiān)實(shí)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)(圖1) 。


補(bǔ)體C3、C4等蛋白分子量大,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,重組表達(dá)困難,因此研究者首先從人血漿中純化得到補(bǔ)體C3、C4等蛋白以進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時(shí)鑒于補(bǔ)體系統(tǒng)的兩種轉(zhuǎn)化酶高度不穩(wěn)定的特性,研究者對(duì)轉(zhuǎn)化酶組裝條件進(jìn)行優(yōu)化,將生理?xiàng)l件下轉(zhuǎn)化酶組裝所需的鎂離子替換為鎳離子,從而顯著延長轉(zhuǎn)化酶的半衰期。C3轉(zhuǎn)化酶是由催化單元(C2,CFB)與支架蛋白(C4b,C3b)共同組成,只有催化單元時(shí)無法實(shí)現(xiàn)對(duì)底物特異性的識(shí)別和切割,但完整的轉(zhuǎn)化酶識(shí)別底物C3時(shí)具有高度特異性,研究者由此推測(cè)底物C3與轉(zhuǎn)化酶結(jié)合時(shí)存在與催化單元之外的結(jié)合表位,這種額外的結(jié)合表位保證了底物識(shí)別的特異性。因此,研究者在轉(zhuǎn)化酶復(fù)合物的催化單元C2和B因子中引入突變使其無法有效切割底物C3,從而保留了C3轉(zhuǎn)化酶與底物C3處于結(jié)合狀態(tài)下的復(fù)合物。


圖2. 補(bǔ)體經(jīng)典途徑/凝集素途徑C3轉(zhuǎn)化酶與底物C3形成的復(fù)合物C4b2a-C3結(jié)構(gòu)示意圖。

研究者根據(jù)以上思路制備樣品并首先利用冷凍電子顯微鏡解析了經(jīng)典途徑和凝集素途徑共同的轉(zhuǎn)化酶C4b2a結(jié)合底物C3形成的“Michaelis”復(fù)合物C4b2a-C3的高分辨率結(jié)構(gòu)(圖2),可以觀察到C3中的可剪切鍵位于ANA結(jié)構(gòu)域的羧基端與α’-NT結(jié)構(gòu)域的氨基端形成的loop狀結(jié)構(gòu)上,該loop插入到C2a的絲氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域的催化口袋中。除此之外,C4b與C3,C2與C3形成的相互作用界面提供了轉(zhuǎn)化酶結(jié)合底物的親和力,保證底物識(shí)別的特異性。值得注意的是,冷凍電鏡樣品中還存在兩種經(jīng)典途徑轉(zhuǎn)化酶的酶原形式C4b2(未展示),這在此前的研究中未被發(fā)現(xiàn)。C4b2復(fù)合物存在兩種明顯不同的構(gòu)象,一種被命名為“l(fā)oading”狀態(tài),即C2剛結(jié)合至C4b還未完成SP結(jié)構(gòu)域的固定;另一種則成為“activation”狀態(tài),即活化狀態(tài),此時(shí)C2的SP結(jié)構(gòu)域與C4b形成相互作用并被固定,固定后暴露出可被C1s切割的剪切鍵,切割后vWF結(jié)構(gòu)域離去,從而完成C4b2到C4b2a的過程,形成最終具有活性的轉(zhuǎn)化酶“C4b2a”,該過程的解析完整的闡明了C3轉(zhuǎn)化酶從組裝到成熟的分子過程,


圖3. 補(bǔ)體旁路途徑C3轉(zhuǎn)化酶與底物C3形成的復(fù)合物C3bBbP-C3結(jié)構(gòu)示意圖。

研究者采用相似的思路解析了旁路途徑轉(zhuǎn)化酶C3bBb結(jié)合底物C3形成的“Michaelis”復(fù)合物C3bBbP-C3的高分辨結(jié)構(gòu)(圖3)。與C4b2a-C3類似,C3的可剪切鍵所在的loop結(jié)構(gòu)插入到B因子的催化口袋中,且C3b與C3相互作用。C3b展示出與C4b類似的C3結(jié)合界面,但B因子與C3的相互作用界面展示出明顯不同的特征,B因子與C3剪切鍵一側(cè)的α’-NT結(jié)構(gòu)域形成β片狀結(jié)構(gòu),顯然這些特征性的相互作用保證了底物識(shí)別的特異性。Properdin是補(bǔ)體系統(tǒng)中已知的唯一正向調(diào)節(jié)因子,結(jié)合在C3bBb上起到延長其半衰期的作用。研究者分析了Properdin與C3bBb的相互作用界面,發(fā)現(xiàn)Properdin主要通過TSR5-stirrup和TSR6-stirrup兩個(gè)區(qū)域與C3b和Bb相互作用,起到加固C3bBb的功能。

最后,研究者利用獲得的高分辨結(jié)構(gòu)對(duì)兩種代表性的靶向補(bǔ)體C3環(huán)節(jié)的藥物作用機(jī)制進(jìn)行分析,闡明了兩種藥物作用的分子機(jī)制,為開發(fā)補(bǔ)體靶向藥物提供重要信息。

北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院2021級(jí)博士研究生賈長昊、北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后楊曉珂為論文的共同第一作者。肖俊宇教授與北京大學(xué)第一醫(yī)院腎內(nèi)科譚穎副教授、趙明輝教授為本文的共同通訊作者。

10.1126/sciadv.adz5404

制版人: 十一

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