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J Med Chem | 吳叔文、周海兵、藍(lán)柯等合作開發(fā)基于N-端法則的新型廣譜抗腸道病毒降解劑

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近日,高致病性病毒與生物安全全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室藍(lán)柯/吳叔文研究組和周海兵研究組開展合作,在腸道病毒廣譜抗病毒藥物的設(shè)計(jì)與開發(fā)上取得重要進(jìn)展,研究成果發(fā)表于Journal of Medicinal Chemistry,題為“Identification of Novel Amino Acid-based PROTACs Exhibiting Broad-spectrum Antiviral Activity against Enteroviruses”。該研究通過創(chuàng)新性地應(yīng)用氨基酸介導(dǎo)的靶向蛋白降解(AATacs)技術(shù),成功開發(fā)出一種針對(duì)腸道病毒3D聚合酶(3Dpol)的高效降解劑。


腸道病毒71型(EV-A71)是引起手足口?。℉FMD)的主要病原體之一,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致腦炎、心肌炎等危及生命的并發(fā)癥。雖然目前已有針對(duì)EV-A71的滅活疫苗上市,但因其對(duì)不同基因型病毒缺乏交叉保護(hù)力,且臨床上尚無批準(zhǔn)使用的靶向抗病毒藥物,開發(fā)廣譜、低毒的抗腸道病毒藥物具有迫切的臨床需求。

針對(duì)這一挑戰(zhàn),研究團(tuán)隊(duì)聚焦于新興的靶向蛋白降解(TPD)技術(shù)。傳統(tǒng)的PROTACs技術(shù)雖能降解靶蛋白,但往往因分子量過大導(dǎo)致細(xì)胞滲透性差,此外還存在脫靶毒性、Hook效應(yīng)、E3連接酶依賴性強(qiáng)、適用靶點(diǎn)受限及藥代動(dòng)力學(xué)不佳等問題。研究團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性地提出并采用了一種新型的“氨基酸降解劑(AATacs)”策略。不同于傳統(tǒng)的PROTACs,AATacs 通過偶聯(lián)堿性或疏水性氨基酸,直接“劫持”宿主細(xì)胞內(nèi)源性的E3泛素連接酶發(fā)揮功能。該策略模擬細(xì)胞內(nèi)天然的“N-端法則(N-end rule)”降解途徑,利用小分子量的氨基酸殘基作為降解信號(hào)(N-degron),引導(dǎo)宿主細(xì)胞的E3泛素連接酶識(shí)別并降解病毒關(guān)鍵蛋白。

在前期研究中,研究團(tuán)隊(duì)通過高通量篩選,鑒定出一種具有廣譜抗腸道病毒活性的酰硫脲類小分子抑制劑AcTU。隨后,團(tuán)隊(duì)針對(duì)該骨架開展了深入的構(gòu)效關(guān)系(SAR)分析。研究發(fā)現(xiàn),酰硫脲骨架左側(cè)的叔丁基對(duì)維持抗病毒活性至關(guān)重要,任何結(jié)構(gòu)改動(dòng)都會(huì)導(dǎo)致藥效顯著下降;而骨架右側(cè)的苯胺/氨基區(qū)域則展現(xiàn)出較好的修飾耐受性,且處于蛋白結(jié)合口袋的溶劑暴露區(qū)?;谶@一發(fā)現(xiàn),研究人員鎖定右側(cè)區(qū)域作為理想的連接位點(diǎn),通過不同長度的烷基鏈引入賴氨酸和色氨酸(作為人工N-端降解信號(hào)),設(shè)計(jì)并合成了14個(gè)AATacs?;螂孱惢衔铩?shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,候選化合物N-6在保持原有核心骨架抗病毒活性的同時(shí),表現(xiàn)出了卓越的靶向降解效率。

機(jī)理研究發(fā)現(xiàn),化合物N-6不僅具有極高的3D聚合酶親和力和選擇性,還能同時(shí)利用宿主細(xì)胞的泛素-蛋白酶體和自噬-溶酶體兩條途徑,實(shí)現(xiàn)對(duì)EV-A71 3D聚合酶的“雙重降解”,從而徹底阻斷病毒的轉(zhuǎn)錄與復(fù)制過程。更重要的是,N-6展現(xiàn)出顯著的廣譜抗病毒潛力,對(duì)柯薩奇病毒CV-A16、CV-B1、CV-A21以及腸道病毒EV-D68均具有強(qiáng)效抑制作用。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)也進(jìn)一步證實(shí)了N-6在體內(nèi)能有效抑制病毒復(fù)制,成功使60%的受感染小鼠免于死亡,有效減輕了組織損傷,且初步表現(xiàn)出良好的安全性。盡管成藥性研究提示N-6在吸收效率與代謝穩(wěn)定性方面仍有改進(jìn)空間,但其獨(dú)特的雙路徑降解機(jī)制和廣譜抗病毒活性,使其作為新型抗腸道病毒藥物的先導(dǎo)化合物,仍具有極高的研究?jī)r(jià)值與開發(fā)前景。

總之,該研究首次將AATacs技術(shù)應(yīng)用于抗病毒藥物的研發(fā),不僅為腸道病毒感染的治療提供了極具潛力的候選藥物,也為開發(fā)新型廣譜抗病毒藥物開辟了創(chuàng)新的技術(shù)路徑。


AATac化合物N-6靶向降解EV-A71 3Dpol及其廣譜抗病毒效果示意圖

武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院碩士研究生范天愛和藥學(xué)院碩士研究生楊茂澤為該論文的共同第一作者,吳叔文副教授、周海兵教授和藍(lán)柯教授為本文的共同通訊作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的資助。

本文轉(zhuǎn)載自:病毒與生物安全全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

本期編輯:木木

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