廣東
近日，廣東省農(nóng)科院果樹所在Horticulture Research期刊上發(fā)表題為“The pangenome enhances the understanding of the genetic diversity of papaya”的研究成果。果樹所楊敏副研究員、周陳平副研究員為論文共同第一作者，楊敏副研究員和魏岳榮研究員為論文共同通訊作者。
該研究通過(guò)整合多個(gè)番木瓜資源基因組構(gòu)建泛基因組，重點(diǎn)開展四方面研究：（1）構(gòu)建同源基因、圖形、線性三種泛基因組并比較，互補(bǔ)揭示番木瓜基因組變異全景，發(fā)現(xiàn)非核心基因與品種抗性、風(fēng)味相關(guān)；（2）挖掘到T3品種RRG基因內(nèi)含子區(qū)94 bp缺失變異，首次在番木瓜中揭示該基因通過(guò)調(diào)控根分生組織細(xì)胞增殖與伸長(zhǎng)影響根長(zhǎng)的分子機(jī)制；（3）利用222份種質(zhì)重測(cè)序數(shù)據(jù)鑒定26173個(gè)高可信結(jié)構(gòu)變異（SV），發(fā)現(xiàn)其可揭示SNP分析未捕捉的遺傳關(guān)系，鑒定出馴化相關(guān)候選基因；（4）新增3個(gè)關(guān)鍵番木瓜品種（貯豐、T3和T5）及重新組裝的紫暉品種高質(zhì)量基因組，豐富了番木瓜基因組資源。
泛基因組分析鑒定到的功能基因結(jié)構(gòu)變異（SVs）
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