人體免疫系統(tǒng)具有高度的多樣性，其中大部分差異源于非遺傳因素。腸道微生物群對免疫系統(tǒng)有著至關(guān)重要的影響；然而，其與健康人體基本免疫狀態(tài)之間的關(guān)系仍不完全清楚。

2026年3月9日，加利福尼亞大學(xué)舊金山分校Matthew H. Spitzer團(tuán)隊在Cell在線發(fā)表題為“Immune-microbiome coordination defines interferon setpoints in healthy humans”的研究論文，該研究通過“免疫微生物組”研究對 110 名健康參與者進(jìn)行了多組學(xué)分析。

基于因素的整合方法發(fā)現(xiàn)了協(xié)調(diào)變化，結(jié)果表明干擾素反應(yīng)是健康參與者中最具變異性的一種免疫特征。微生物群組成、通路和糞便代謝物會與干擾素反應(yīng)通路同時發(fā)生變化�？缭匠^一年的縱向數(shù)據(jù)表明，這些參數(shù)在個體之間隨著時間的推移具有顯著的穩(wěn)定性。總之，該研究提供了大量數(shù)據(jù)，用于研究健康個體在穩(wěn)定狀態(tài)下免疫狀態(tài)與微生物群之間的關(guān)系，這為闡明與疾病易感性和對治療的反應(yīng)相關(guān)的個體間差異鋪平了道路。

個體間的免疫差異對人類健康和疾病有著廣泛的影響。相關(guān)人群研究已經(jīng)開始探尋免疫差異的驅(qū)動因素，結(jié)果表明環(huán)境因素可能比遺傳因素的影響更大。更深入的理解可能會為疾病易感性、嚴(yán)重程度以及對免疫調(diào)節(jié)療法（包括疫苗接種、癌癥免疫療法以及自身免疫性疾病免疫抑制治療）的反應(yīng)性變化提供見解。

腸道微生物群能夠影響免疫反應(yīng)。在癌癥患者中，微生物群的特征與臨床結(jié)果以及檢查點抑制劑免疫療法的效果相關(guān)聯(lián)。在自身免疫性疾病中，微生物群以及共生微生物產(chǎn)生的代謝物會影響治療反應(yīng)。在疫苗接種中，微生物群可以作為佐劑，增強免疫原性。這些研究表明，微生物群及其產(chǎn)生的分子可能塑造患者的基線免疫狀態(tài)，并影響對治療的免疫反應(yīng)。動物模型已經(jīng)揭示了微生物群與免疫細(xì)胞發(fā)育和活動之間的因果關(guān)系。然而，健康人體在穩(wěn)定狀態(tài)下微生物群特征與免疫狀態(tài)的差異之間的關(guān)系仍不完全清楚。

一個例子是對于基線或持續(xù)性干擾素（IFN）信號傳導(dǎo)的調(diào)控。這可以從缺乏微生物組的小鼠中 IFN 刺激基因（ISGs）表達(dá)的降低以及抗病毒免疫反應(yīng)的受損中得到證明。實際上，在體內(nèi)平衡狀態(tài)下，IFN 的產(chǎn)生量較低，而對 IFN 的感知會導(dǎo)致持續(xù)的信號傳導(dǎo)，這對于抗菌免疫反應(yīng)以及塑造免疫環(huán)境和免疫活動至關(guān)重要。至于這種 IFN 信號在健康人類中的變化情況，以及它是否與人類腸道微生物組有關(guān)，目前仍不完全清楚。

文章模式圖（圖源自Cell）

該研究對健康個體之間的免疫學(xué)差異進(jìn)行了研究，并探究了微生物組特征是否與這些免疫狀態(tài)有關(guān)。該研究生成了免疫系統(tǒng)、微生物組和代謝組的多模態(tài)數(shù)據(jù)，作為該領(lǐng)域的研究資源。該研究采用基于因子的整合分析來捕捉隊列中相互變化的特征，并在健康個體中確定了兩個主要的免疫變異性軸，涉及 IFN 反應(yīng)程序。其中一個軸與腸道微生物組特征相關(guān)，而另一個則獨立于前者。

與變異相關(guān)的微生物組軸特別捕捉到了 IFN 反應(yīng)基因表達(dá)以及 SIGLEC-1high表達(dá)單核細(xì)胞、激活的記憶 T 細(xì)胞亞群、激活的 CD69high表達(dá)自然殺傷（NK）細(xì)胞和黏膜相關(guān)不變 T（MAIT）細(xì)胞的豐度和表型的差異。將這些特征應(yīng)用于公共數(shù)據(jù)集表明，與微生物組相關(guān)的 IFN 特征與增強的疫苗反應(yīng)以及治療相關(guān)的癌癥免疫治療反應(yīng)有關(guān)。此外，這些特征在同一個人身上會隨著時間的推移保持穩(wěn)定，這有助于我們更好地理解健康人體內(nèi)的免疫系統(tǒng)和微生物組的設(shè)定值。

參考消息：

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00168-6