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【OPR&D】超強(qiáng)縮合試劑TCFH/NMI竟然可以用水作為溶劑!不光綠色環(huán)保,而且還易于分離純化!

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酰胺鍵形成在藥物合成中是一種基礎(chǔ)反應(yīng),已有多種酰胺化試劑被開發(fā)用于高效偶聯(lián)羧酸和胺【】。2018年,Beutner等人報(bào)道了TCFH-NMI組合,可用于偶聯(lián)位阻羧酸與非親核胺,且在許多情況下無相鄰立體中心的差向異構(gòu)化【】。后續(xù)研究證實(shí)了TCFH-NMI在千克級(jí)規(guī)模上的有效性。近期,Takeda的Bailey等人報(bào)道了在水中進(jìn)行TCFH-NMI酰胺化的例子,使用水作為主要反應(yīng)溶劑,這有助于減少有機(jī)溶劑使用(有機(jī)溶劑占制藥廢物的50%以上)。


2025年,BMS公司的 Richard J. Fox和Dung L. Golden等人報(bào)道了 使用TCFH-NMI(四甲基氯甲脒六氟磷酸鹽-N-甲基咪唑)酰胺化條件以水為主要反應(yīng)溶劑的研究結(jié)果。研究了超過100個(gè)例子,包括簡(jiǎn)單和更復(fù)雜的藥物相關(guān)活性藥物成分結(jié)構(gòu),并發(fā)現(xiàn)了關(guān)于反應(yīng)范圍的一般趨勢(shì)。還開發(fā)并描述了監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)XGBoost和梯度提升回歸模型,用于預(yù)測(cè)水中TCFH-NMI酰胺化的轉(zhuǎn)化率?!?Org. Process Res. Dev. 2025, https://doi.org/10.1021/acs.oprd.5c00299 】

初始實(shí)驗(yàn)與底物范圍


研究首先嘗試在水中合成酰胺5(一種免疫腫瘤藥物中間體),但使用異丙胺時(shí)轉(zhuǎn)化率低(<40%相對(duì)面積百分?jǐn)?shù),RAP),即使添加表面活性劑(如TPGS-750-M)也無顯著改善。這歸因于異丙胺的位阻效應(yīng)。改用位阻較小的胺(如苯胺衍生物)時(shí),轉(zhuǎn)化率顯著提高,且丙酮作為共溶劑比乙腈或THF更可持續(xù)。



進(jìn)行了80個(gè)底物的篩選(4種羧酸和20種胺在水中/丙酮中)。


胺的影響:高吸電子苯胺(如對(duì)硝基苯胺)反應(yīng)差;中等吸電子至給電子苯胺反應(yīng)良好;強(qiáng)親核脂肪胺(如芐胺)反應(yīng)良好;增加位阻(如叔丁胺)降低反應(yīng)性。

羧酸的影響:增加位阻(如從酸15到17)降低轉(zhuǎn)化率。使用對(duì)映純羧酸16時(shí),13種酰胺產(chǎn)物的對(duì)映體比率均>99.5:0.5 er,表明水中條件無顯著差向異構(gòu)化。

其中RAP值用顏色編碼表示趨勢(shì)(綠色>90%,黃色60-90%,橙色30-60%,紅色<30%)。



肽偶聯(lián)與差向異構(gòu)化風(fēng)險(xiǎn)

測(cè)試了NBoc-L-苯基甘氨酸(36)、NBoc-L-苯丙氨酸(38)和Z-Gly-Phe肽(40)與芐胺的偶聯(lián)。

1、36和38在水中/丙酮中轉(zhuǎn)化率高,er >99.9:0.1。


2、40與芐胺偶聯(lián)時(shí)轉(zhuǎn)化率低且差向異構(gòu)化增加(er 83:17),這與非水條件相似,可能因反應(yīng)混合物形成稠漿,降低偶聯(lián)速率。改用NBoc哌嗪時(shí),轉(zhuǎn)化率提高至66 RAP,但差向異構(gòu)化仍存在(er 71:29)。

3、NMI當(dāng)量(2.1 vs 3.5 equiv)對(duì)轉(zhuǎn)化率和差向異構(gòu)化無顯著影響。


羧酸pKa和電子效應(yīng)

羧酸pKa影響轉(zhuǎn)化率:pKa從3增至4.5時(shí),轉(zhuǎn)化率穩(wěn)步增加;pKa在3.8至5.0時(shí)轉(zhuǎn)化率優(yōu)秀(≥90% RAP),但對(duì)二甲氨基苯甲酸(pKa ~5.0)僅22% RAP。


Hammett類研究(23種對(duì)位取代苯甲酸衍生物)顯示:

1、中性至中等電子取代基(σ-para值在-0.3至+0.5)轉(zhuǎn)化率最高。

2、強(qiáng)吸電子取代基(σ-para > +0.5,如SO2NH2、CF3、CN、NO2)轉(zhuǎn)化率稍低。

3、強(qiáng)給電子取代基(σ-para < -0.4,如n-BuNH、NHEt、NEt2、NMe2)轉(zhuǎn)化率陡降,僅回收羧酸。


氨作為親核試劑

使用氨作為親核試劑時(shí),水條件效果差于乙腈控制條件,可能因水中氫鍵增強(qiáng)和親核性降低。但在~50:50水:乙腈中可實(shí)現(xiàn)良好轉(zhuǎn)化率。



放大實(shí)驗(yàn)與收率

在10克規(guī)模進(jìn)行了5個(gè)例子(化合物49、60、61、62、63),使用15 vol%丙酮在水中(總?cè)軇?0 L/kg),所有反應(yīng)均形成均勻溶液后轉(zhuǎn)化為良好懸浮液,過濾后分離產(chǎn)物。所有產(chǎn)物純度高,過程質(zhì)量強(qiáng)度(PMI)≤21,低于行業(yè)平均值43。



藥物分子合成應(yīng)用

Linrodostat (65):在水/乙腈(85:15)中,使用1.3 equiv 4-氯苯胺、3.5 equiv NMI和1.8 equiv TCFH,10克規(guī)模收率93%,純度98.5%。無差向異構(gòu)化,PMI=16.8。


Olaparib (69):在水/丙酮(85:15)中,使用1.2 equiv胺68(HCl鹽)、4.8 equiv NMI和1.8 equiv TCFH,10克規(guī)模收率84%,純度>99%。需額外添加NMI和TCFH以實(shí)現(xiàn)完全轉(zhuǎn)化,PMI=17.6。


Rivaroxaban衍生物(74):因酸71 pKa低(~3.2),水中轉(zhuǎn)化率僅53%;改用甲氧基取代酸73(pKa ~3.9)后,轉(zhuǎn)化率>99% RAP,10克規(guī)模收率92%,純度>99%。共溶劑(乙腈、THF、丙酮)均可,但乙腈利于結(jié)晶。



Nilotinib (77):水中轉(zhuǎn)化率<5%,可能因反應(yīng)混合物稠厚、溶解度差。交叉實(shí)驗(yàn)表明酸75和胺76均有反應(yīng)性問題。



Imatinib (83):使用酸82和胺81,在水中/丙酮(80:20)中轉(zhuǎn)化率>95% RAP。


機(jī)器學(xué)習(xí)回歸模型

開發(fā)了監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)模型(使用Python和Scikit-learn)預(yù)測(cè)RAP,特征包括酸和胺的立體和電子性質(zhì)(通過Auto-QChem量化)。模型評(píng)估顯示樹基模型(XGBoost和Gradient Boosting)性能最佳(驗(yàn)證RMSE0.25-0.28,MAE0.19-0.26),優(yōu)于線性模型。特征分析表明酸和胺的偶極和摩爾體積是關(guān)鍵影響因素,溶解度特征(如懸浮液外觀)也有一定貢獻(xiàn)。模型成功預(yù)測(cè)了保留底物(如69、72、77、83)的RAP。

機(jī)理討論

TCFH/NMI水作為主要溶解酰胺化方法的成功取決于反應(yīng)路徑(形成N-?;溥蜴f中間體,后與胺反應(yīng))與非反應(yīng)水解路徑TCFH或中間體水解)的平衡。羧酸電子效應(yīng)過強(qiáng)(吸電子)或過弱(給電子)及位阻增加均會(huì)降低反應(yīng)路徑速率。


實(shí)驗(yàn)操作

General Amidation Procedure in Water/Cosolvent:To the carboxylic acid (500 mg, 1 equiv) in a 20 mL glass scintillation vial equipped with a pressure-rated screw cap septum and magnetic stir bar was charged water (15 L/kg) and cosolvent (2.65 L/kg, either THF, acetone, or CH3CN, 15 vol% cosolvent), followed by the amine (1.1?1.3 equiv) and NMI (3.5 equiv). TCFH (3 × 0.5 equiv) was then added in portions, waiting ~10 min between each 0.5 equiv of charge. After an additional 30 min, the reactions were analyzed.

作者研究了超過100個(gè)以水為主要反應(yīng)溶劑的TCFH-NMI酰胺化例子。組合數(shù)據(jù)集支持這種試劑/溶劑組合是可行的,并且在許多情況下可以導(dǎo)致產(chǎn)物的高效形成和直接分離,但它不是所有底物組合的通用解決方案。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)支持羧酸和胺起始材料的立體和電子特征影響了水中TCFH-NMI偶聯(lián)的成功??傮w而言,雖然不是通用解決方案,但希望這項(xiàng)工作能激勵(lì)其他人探索使用水作為TCFH-NMI和其他常見有機(jī)轉(zhuǎn)化的主要反應(yīng)溶劑。

參考資料

Tetramethylchloroformamidinium Hexafluorophosphate?N?Methylimidazole Amidation in Water: Successes, Limitations, and a Regression Model for Prediction;Richard J. Fox,* Dung L. Golden,* Caitlin C. Chartrand, Lauren N. Grant, William P. Gallagher, and Matthew J. Goldfogel;

Org. Process Res. Dev. 2025, https://doi.org/10.1021/acs.oprd.5c00299。


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