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Science:耶魯大學(xué)Clark團(tuán)隊(duì)揭示線粒體如何成為神經(jīng)元的“身份密碼”

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神經(jīng)元需要大量能量來(lái)工作,而線粒體就是細(xì)胞的“能量工廠”。但科學(xué)家不清楚:這些線粒體在大腦中是如何分布的?它們的位置和形狀是隨意的,還是跟神經(jīng)元類型、活動(dòng)水平有關(guān)?

近日,耶魯大學(xué)Damon A. Clark研究團(tuán)隊(duì)在Science雜志發(fā)表了“Spatial and morphological organization of mitochondria in neurons across a connectome”揭示了年神經(jīng)元在連接組中線粒體的空間與形態(tài)組織。


利用果蠅全腦電子顯微鏡連接組圖譜,作者發(fā)現(xiàn):線粒體的形狀和位置并非隨機(jī),而是高度依賴神經(jīng)元類型和所用神經(jīng)遞質(zhì),甚至可作為識(shí)別神經(jīng)元的“細(xì)胞指紋”。它們?cè)谳S突或樹突中的定位非常精準(zhǔn)(誤差僅2–3微米)且不同神經(jīng)元及其亞細(xì)胞區(qū)域有各自固定的分布模式。更重要的是,線粒體傾向于聚集在活動(dòng)頻繁或突觸密集的區(qū)域。在小鼠視覺皮層中也觀察到類似的細(xì)胞類型特異性,盡管具體規(guī)則略有不同。這項(xiàng)研究揭示:線粒體不僅是能量工廠,更是連接神經(jīng)環(huán)路結(jié)構(gòu)與功能的“亞細(xì)胞信標(biāo)”。


圖一 在果蠅LC視覺投射神經(jīng)元中可視化線粒體

要理解大腦如何工作,光看神經(jīng)元之間的“連線”(突觸)還不夠,還得看支撐這些連接的“能量站”:線粒體。

電子顯微鏡連接組不僅能重建神經(jīng)環(huán)路,還保留了線粒體等亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的高清圖像。雖然知道線粒體會(huì)聚集在突觸附近供能,但它們?cè)诓煌窠?jīng)元中是如何系統(tǒng)性分布的?形狀和位置是否具有規(guī)律?又如何與環(huán)路功能匹配?這些問題長(zhǎng)期不清楚。

作者利用果蠅半腦連接組這一超大規(guī)模數(shù)據(jù)集(包含約25,000個(gè)神經(jīng)元、10萬(wàn)多個(gè)線粒體),聚焦于已知功能的視覺投射神經(jīng)元(LC細(xì)胞)。這些神經(jīng)元結(jié)構(gòu)清晰、類型明確、數(shù)量充足,非常適合分析。

研究發(fā)現(xiàn):線粒體的形態(tài)和定位并非隨機(jī),而是高度依賴神經(jīng)元類型,并精準(zhǔn)對(duì)應(yīng)其突觸分布和功能需求。


圖二 線粒體形態(tài)具有神經(jīng)元區(qū)段和神經(jīng)元類型的特異性

作者利用果蠅和小鼠的高分辨率電子顯微鏡連接組數(shù)據(jù),系統(tǒng)分析了數(shù)十萬(wàn)個(gè)線粒體的形態(tài)。他們發(fā)現(xiàn):線粒體的形狀(如大小、圓潤(rùn)度、復(fù)雜度)并非隨機(jī),而是高度依賴神經(jīng)元類型和神經(jīng)遞質(zhì)類型,甚至能作為識(shí)別細(xì)胞身份的“指紋”。

在果蠅視覺神經(jīng)元中,不同類型的細(xì)胞(如LC4 vs LC11)在線粒體體積和形狀上存在明顯差異;GABA能神經(jīng)元的線粒體普遍比多巴胺能的小。更驚人的是,僅憑一段幾十微米長(zhǎng)神經(jīng)纖維中的線粒體形態(tài),機(jī)器學(xué)習(xí)模型就能較準(zhǔn)確地判斷該神經(jīng)元屬于哪種類型或使用哪種神經(jīng)遞質(zhì)。

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這種特異性不僅存在于果蠅,在小鼠皮層中同樣成立:興奮性與抑制性神經(jīng)元的線粒體形態(tài)截然不同,分類準(zhǔn)確率高達(dá)99%。

此外,同一神經(jīng)元的不同部分(樹突、軸突、連接段)雖然線粒體形態(tài)有區(qū)段特征,但不同類型神經(jīng)元之間的差異模式在各區(qū)段中高度一致,提示存在一種“全局調(diào)控機(jī)制”統(tǒng)一設(shè)定整顆神經(jīng)元的線粒體形態(tài)。

簡(jiǎn)言之:線粒體不只是能量工廠,它們的“長(zhǎng)相”藏著神經(jīng)元的身份密碼,并在進(jìn)化上保守,為連接組研究提供了新的細(xì)胞識(shí)別工具。


圖三 線粒體在突觸前的定位與自發(fā)活動(dòng)和連接性相關(guān)

作者接下來(lái)探究:線粒體在大腦中的分布是否與神經(jīng)活動(dòng)和環(huán)路連接有關(guān)?

他們首先發(fā)現(xiàn),不同腦區(qū)的線粒體密度和突觸密度高度一致并且與該區(qū)域的自發(fā)神經(jīng)活動(dòng)(如鈣信號(hào)波動(dòng)),尤其是“有多少突觸靠近線粒體”和“每個(gè)突觸分配到多少線粒體體積”這兩個(gè)指標(biāo),最能預(yù)測(cè)活動(dòng)強(qiáng)弱。

這提示兩種可能:要么線粒體增強(qiáng)了突觸功能,使活動(dòng)更強(qiáng);要么活躍的突觸主動(dòng)“吸引”線粒體聚集。無(wú)論哪種機(jī)制,都說(shuō)明線粒體與突觸活動(dòng)緊密耦合

更關(guān)鍵的問題是:線粒體是否偏好某些特定類型的突觸?比如,是否更愿意靠近某些特定下游目標(biāo)的突觸?

結(jié)果發(fā)現(xiàn):5-羥色胺能神經(jīng)元的突觸最“受寵”,線粒體覆蓋度最高;多巴胺能和章魚胺能神經(jīng)元的突觸則較少被覆蓋。

進(jìn)一步分析顯示,大多數(shù)神經(jīng)元投向不同靶細(xì)胞的突觸在線粒體覆蓋上差異不大。但有一個(gè)例外:肯揚(yáng)細(xì)胞(Kenyon cells,果蠅學(xué)習(xí)記憶的關(guān)鍵神經(jīng)元)。它們投向不同靶標(biāo)的突觸,線粒體覆蓋度差異顯著且穩(wěn)定,說(shuō)明線粒體的定位可能由突觸后靶標(biāo)的身份決定。

這表明:線粒體不僅響應(yīng)整體活動(dòng)水平,還可能參與調(diào)控特定神經(jīng)連接的功能特異性,為理解突觸多樣性提供了新視角。

總結(jié)

本研究開發(fā)的定量與機(jī)器學(xué)習(xí)方法,不僅揭示了線粒體形態(tài)和定位的細(xì)胞類型特異性,還可推廣至其他亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分析。隨著連接組數(shù)據(jù)日益豐富,這類方法將助力發(fā)現(xiàn)細(xì)胞組織新規(guī)律,并闡明亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)如何支撐神經(jīng)環(huán)路功能。

文章來(lái)源

https://www.science.org/doi/10.1126/science.ads6674

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