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Molecular Psychiatry |?謝鵬團隊基于抑郁癥患者多組織蛋白質(zhì)組學(xué)繪制差異分子網(wǎng)絡(luò)及生物學(xué)功能圖譜

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抑郁癥是一種常見且嚴(yán)重的精神障礙,全球有超過 3 億人受其影響,是全球致殘的主要原因之一。其發(fā)病機制涉及遺傳、神經(jīng)生化、神經(jīng)內(nèi)分泌及心理社會等多因素的復(fù)雜交互作用,至今仍未完全闡明。在精準(zhǔn)醫(yī)療時代,從分子層面系統(tǒng)解析抑郁癥的病理機制,對于開發(fā)新型診斷工具和治療方法至關(guān)重要。蛋白質(zhì)作為基因表達的最終執(zhí)行者和生命活動的直接承擔(dān)者,其表達水平、翻譯后修飾和相互作用網(wǎng)絡(luò)的異常,與抑郁癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。然而,該領(lǐng)域研究長期面臨兩大瓶頸:一是不同研究間結(jié)果可重復(fù)性低;二是以往研究多聚焦于單一組織(如腦或血液),難以捕捉抑郁癥作為一種系統(tǒng)性疾病所涉及的復(fù)雜跨組織對話。

為了系統(tǒng)克服這些挑戰(zhàn), 重慶醫(yī)科大學(xué)謝鵬教授團隊在國際 精神病學(xué)期刊Molecular Psychiatry上發(fā)表了題為Differential protein network and biological functions atlas from multi-tissue proteomics in patients with depression的重要研究。該研究大規(guī)模整合了來自抑郁癥患者腦組織、腦脊液、外周血和尿液的多組織蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),構(gòu)建了一個全面的蛋白質(zhì)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖譜,深刻揭示了抑郁癥患者中樞與外周系統(tǒng)存在的廣泛而協(xié)同的蛋白質(zhì)失調(diào)模式


研究團隊從其自主研發(fā)并維護的“抑郁癥蛋白質(zhì)與代謝物數(shù)據(jù)庫”( Pro-MENDA )中,系統(tǒng)篩選并納入了 39 項高質(zhì)量研究,涵蓋總計 1804 例樣本。通過“投票計數(shù)”統(tǒng)計算法對數(shù)據(jù)進行分析,最終在腦、腦脊液、血液和尿液四種組織類型中,共鑒定出 2094 個差異表達蛋白,繪制出一幅抑郁癥多組織分子全景圖。

研究發(fā)現(xiàn),不同組織呈現(xiàn)出特征鮮明但又相互關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì)表達譜。在腦組織中,膠質(zhì)纖維酸性蛋白( GFAP )的表達一致性下調(diào),而組氨酸三聯(lián)體核苷酸結(jié)合蛋白 1 ( HINT1 )、細(xì)胞色素 C ( CYCS )和 ATP 合成酶 β 亞基 ( ATP5F1B )等蛋白則顯著上調(diào)。這些變化指向抑郁癥大腦中星形膠質(zhì)細(xì)胞功能異常、線粒體能量代謝障礙和突觸活動受損等核心病理過程。尤為值得注意的是,對前額葉皮質(zhì)、前扣帶回和垂體等不同腦區(qū)的分析顯示,各腦區(qū)的差異蛋白幾乎沒有重疊,這表明抑郁癥在不同腦區(qū)可能通過截然不同的分子通路發(fā)揮作用,例如前額葉皮質(zhì)側(cè)重于突觸與能量代謝,而垂體則更多與激素分泌和應(yīng)激應(yīng)答相關(guān),揭示了抑郁癥腦內(nèi)病理的復(fù)雜性與區(qū)域性。

在外周系統(tǒng)中,研究同樣發(fā)現(xiàn)了疾病信號。血液中 Serpin 家族 F 成員 1 ( SERPINF1 )的下調(diào)和 Afamin ( AFM )的上調(diào),提示全身性免疫炎癥反應(yīng)和脂代謝紊亂。腦脊液的蛋白質(zhì)組則富集于補體激活和血小板脫顆粒等相關(guān)通路。甚至在尿液中,也檢測到與中性粒細(xì)胞激活相關(guān)的蛋白變化,暗示了抑郁癥可能伴隨的全身性免疫激活狀態(tài)。

最為關(guān)鍵的發(fā)現(xiàn)之一是,研究團隊成功在腦、腦脊液和血液這三種關(guān)鍵組織中,鑒定出 13 個共有的差異表達蛋白,其中 Clusterin ( CLU )作為核心分子尤為突出。對這些共享蛋白的深入分析表明,它們主要參與補體與凝血級聯(lián)反應(yīng)以及化學(xué)致癌 - 活性氧等通路。這一發(fā)現(xiàn)為“腦 - 外周軸”在抑郁癥中的作用提供了直接分子證據(jù):大腦內(nèi)的病理變化(如神經(jīng)炎癥、血腦屏障完整性改變)可能通過特定蛋白泄漏或 HPA 軸(下丘腦 - 垂體 - 腎上腺軸)介導(dǎo)的體液信號,影響外周系統(tǒng)的蛋白質(zhì)表達;反之,外周的系統(tǒng)性炎癥或代謝產(chǎn)物也可能進入中樞,加劇腦內(nèi)病理。這種雙向、循環(huán)的交互作用,可能是抑郁癥慢性化及共病高發(fā)的重要機制。

此外,該研究還對蛋白質(zhì)翻譯后修飾進行了大規(guī)模分析,發(fā)現(xiàn)磷酸化是抑郁癥中最常見的修飾類型。

總的來說,這項研究是抑郁癥蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的一項里程碑式工作。它超越了傳統(tǒng)單一組織研究的局限,通過多組織整合分析,全景式描繪了抑郁癥的系統(tǒng)性分子網(wǎng)絡(luò),將大腦的突觸功能障礙、能量 紊亂 與外周的免疫炎癥 反應(yīng) 、代謝失衡有機地聯(lián)系在一起。這不僅極大地深化了我們對抑郁癥作為一種全身性疾病本質(zhì)的理解,更重要的是,該研究鑒定出的多組織共享蛋白和特異性生物標(biāo)志物,為未來開發(fā)基于 體液 的客觀診斷工具、構(gòu)建多靶點聯(lián)合治療策略以及實現(xiàn)抑郁癥的分型診療與精準(zhǔn)干預(yù)奠定了科學(xué)基礎(chǔ)。隨著單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)、空間蛋白質(zhì)組學(xué)等新技術(shù)的融合應(yīng)用, 抑郁癥分子網(wǎng)絡(luò) 圖譜將不斷被細(xì)化與豐富,指引我們走向 探索 抑郁癥的新 開端 。


重慶醫(yī)科大學(xué)向涯潔博士后 和 杜小燕 博士為論文的共同第一作者。 重慶醫(yī)科大學(xué) 謝鵬教授 為通訊作者。

原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41380-026-03443-4

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