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新春重磅!一日內(nèi)Nature+2,交大醫(yī)學(xué)院醫(yī)工交叉與基因治療雙獲重大突破!

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新春傳捷報!北京時間2026年2月19日,國際頂級學(xué)術(shù)期刊Nature同期發(fā)表了上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院,以及松江研究院、附屬新華醫(yī)院聯(lián)合其他單位的兩項重磅研究成果,分別在罕見病AI診斷、神經(jīng)發(fā)育疾病基因治療領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)世界性突破。

兩項成果同日登國際頂刊,是上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院和附屬醫(yī)院堅持醫(yī)教研協(xié)同發(fā)展、深耕前沿交叉領(lǐng)域的重要成果,以科技創(chuàng)新賦能臨床診療、守護人民健康的生動實踐,也是堅持“四個面向”,強化“有組織的科研”,不斷提升科技創(chuàng)新能力的實力彰顯。


孫錕教授團隊聯(lián)合發(fā)布:全球首創(chuàng)可溯源AI系統(tǒng),破解罕見病診斷世界性難題


由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫錕教授、余永國教授與上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院、醫(yī)學(xué)人工智能研究院張婭教授、上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院謝偉迪副教授領(lǐng)銜的聯(lián)合團隊,以臨床問題為導(dǎo)向、聯(lián)合研究為核心、技術(shù)落地為支撐,完成了從臨床需求到技術(shù)突破、再到臨床應(yīng)用的全鏈條創(chuàng)新,研發(fā)出全球首個可溯源智能體式罕見病診斷系統(tǒng)DeepRare,首創(chuàng)“中樞-分身”可溯源Agentic AI架構(gòu),讓AI診斷從“黑盒”變?yōu)椤巴该髟\室”,徹底破解傳統(tǒng)醫(yī)療AI推理過程不可追溯的“信任危機”。

該架構(gòu)從三大維度實現(xiàn)對傳統(tǒng)醫(yī)療AI的代際超越:知識儲備上打破醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)孤島,深度整合并內(nèi)化海量醫(yī)學(xué)文獻知識庫與真實臨床病例數(shù)據(jù);診斷思維上跳出“模式匹配快思考”,擁有人類醫(yī)生的“慢思考”能力,通過“假設(shè)-驗證-自我反思”迭代循環(huán)推敲診斷線索;推理過程上實現(xiàn)全流程白盒推理,每一個結(jié)論均附帶完整證據(jù)鏈條。硬核實測數(shù)據(jù)顯示,DeepRare診斷精度刷新世界紀錄,僅依靠臨床表型信息時,首位診斷準確率達57.18%,較此前國際最佳模型提升23.79個百分點,為缺乏基因檢測條件的基層醫(yī)院打造了罕見病快速篩查的“金鑰匙”;引入基因測序數(shù)據(jù)后,復(fù)雜病例綜合首位診斷準確率突破70.6%,顯著優(yōu)于國際通用的Exomiser工具,其推理報告更獲新華醫(yī)院專家團隊95.4%的高度認可。

目前,DeepRare罕見病在線診斷平臺已上線半年,吸引超1000名專業(yè)用戶注冊,服務(wù)全球600余家頂尖醫(yī)療科研機構(gòu);該系統(tǒng)已在新華醫(yī)院完成院內(nèi)部署并進入內(nèi)測階段,即將作為“數(shù)字質(zhì)控員”應(yīng)用于全院罕見病診療質(zhì)控流程。孫錕教授透露,團隊更正積極籌備發(fā)起“全球AI罕見病診療聯(lián)盟”,同步啟動“萬人臨床驗證計劃”,計劃完成20000例疑難罕見病真實世界驗證,讓中國AI診斷方案惠及全球患者。

值得一提的是,在Nature上線該論文的同期,期刊還特別邀請了澳大利亞西澳大學(xué)兒童健康研究中心專家Timo Lassmann撰寫并配發(fā)了題為《AI成功診斷罕見病》(AI succeeds in diagnosing rare diseases)的“新聞與觀點”(News & views)專文評論 。文章對DeepRare給予了極高評價。Lassmann在文中指出,DeepRare這種多模塊協(xié)同的架構(gòu),完美映射了罕見病??浦行亩鄬W(xué)科團隊(MDT)的會診模式,但其“運行的速度和規(guī)模卻是人類團隊無法企及的”。針對該系統(tǒng)的白盒化特征,文章給出了核心定調(diào):“該系統(tǒng)可溯源的推理能力,可能是其走向未來臨床應(yīng)用最卓著的貢獻?!痹u論強調(diào),在面臨重大醫(yī)療決策時,相比于給出“黑盒”答案,像DeepRare這樣“能夠展示其推演過程的系統(tǒng),才能經(jīng)得起人類專家的審查并贏得信任,最終證明其更具實用價值?!?/p>

上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院博士研究生趙唯珂、助理教授吳超逸博士、醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院副研究員范燕潔博士為論文的共同第一作者,人工智能學(xué)院張婭教授,謝偉迪副教授與醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫錕教授、余永國教授為論文的通訊作者。上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院博士研究生邱芃鋮、哈佛大學(xué)博士后張小嫚博士、上海交通大學(xué)本科生孫瑜澤、上海人工智能實驗室博士后周曉博士、中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院張樹菊博士和彭聿博士、上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院執(zhí)行院長王延峰教授、醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫新教授對研究給予了指導(dǎo)、合作和支持。該項目得到了科技創(chuàng)新2030—“新一代人工智能”重大項目、上海市科學(xué)智能“百團百項”專項、上海市科委人工智能科技支撐專項項目支持。


仇子龍教授、李斐教授團隊聯(lián)合發(fā)布:腦內(nèi)精準基因編輯,為神經(jīng)發(fā)育疾病治療點亮曙光


上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院仇子龍教授,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院李斐教授、楊侃副研究員團隊聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院程田林研究員團隊和中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心李勁松院士團隊,聚焦由CHD3基因突變導(dǎo)致的Snijders Blok–Campeau綜合征(SNIBCPS)這一典型神經(jīng)發(fā)育性疾病,實現(xiàn)了腦內(nèi)基因位點的精準“修錯”,為自閉癥等神經(jīng)發(fā)育疾病的基因治療帶來突破性進展。

研究團隊首先針對CHD3-R1025W熱點高頻突變,構(gòu)建了復(fù)刻患者核心癥狀的人源化突變小鼠模型,為治療研究搭建精準的“疾病模擬平臺”;并創(chuàng)新性設(shè)計新型腺嘌呤堿基編輯器TeABE,這款“基因工匠”可精準識別并將突變的A?T堿基對修復(fù)為正常的G?C堿基對,與傳統(tǒng)技術(shù)相比,全程無DNA雙鏈斷裂風(fēng)險,大幅降低基因組紊亂風(fēng)險。經(jīng)細胞水平多輪篩選,團隊鎖定了編輯效率最高、脫靶效應(yīng)最低的sgRNA與編輯器組合,通過尾靜脈注射將其送入突變小鼠體內(nèi)后,編輯器成功抵達小鼠多個腦區(qū)實現(xiàn)靶向修復(fù),且旁觀者效應(yīng)極低。隨著小鼠體內(nèi)CHD3蛋白水平顯著恢復(fù),其社交回避、認知遲鈍、運動不協(xié)調(diào)等行為異常得到顯著改善,在三箱社交、新物體識別、巴恩斯迷宮等實驗中均恢復(fù)正常表現(xiàn)。

為筑牢臨床轉(zhuǎn)化的安全防線,團隊通過GUIDE-seq技術(shù)全基因組排查脫靶位點,結(jié)果顯示人類細胞中潛在脫靶位點編輯率均低于1%,小鼠腦中該數(shù)值更低;同時對次要突變開展功能驗證,確認其不影響CHD3蛋白正常功能。更重要的是,團隊在非人靈長類(獼猴)模型中開展鞘內(nèi)注射AAV9-TeABE實驗,成功檢測到明確的堿基編輯活性,驗證了該技術(shù)的跨物種應(yīng)用可行性,為后續(xù)臨床試驗積累了充足前期數(shù)據(jù)。

新華醫(yī)院團隊深耕兒童神經(jīng)發(fā)育障礙領(lǐng)域二十余年,致力于其遺傳及環(huán)境病因的基礎(chǔ)到臨床轉(zhuǎn)化研究。李斐教授團隊聚焦基因精準編輯在《Nature》發(fā)表重磅成果的同時,還在環(huán)境病因研究方面有所突破,近期牽頭完成的“神經(jīng)發(fā)育障礙的生命早期環(huán)境風(fēng)險因素識別和防控體系建立與推廣”項目,在2025年中華醫(yī)學(xué)科技獎評選中獲醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)獎一等獎。圍繞兒童神經(jīng)發(fā)育障礙領(lǐng)域的系列豐碩成果,將為該病的精準治療開辟新路徑。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院楊侃副研究員、復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院博士后李維克、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院博士研究生耿一嘯、山東大學(xué)齊魯醫(yī)院小兒內(nèi)科博士后張淑倩、中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)卓越中心博士研究生程艷波、云南大學(xué)醫(yī)學(xué)院吳詩昊副研究員為論文的共同第一作者,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院楊侃副研究員、李斐教授、復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院程田林研究員、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院仇子龍教授為論文的共同通訊作者。中國科學(xué)院分子細胞科學(xué)卓越中心李勁松院士團隊與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬松江醫(yī)院都愛蓮主任團隊對研究給予了指導(dǎo)與大力支持。本研究得到了國家科技重大專項,國家自然科學(xué)基金、科技部科技創(chuàng)新2030-“腦科學(xué)與類腦研究”重大項目、上海市科學(xué)技術(shù)委員會、上海市高水平地方高校創(chuàng)新團隊、上海市衛(wèi)生健康委員會、中科院青年創(chuàng)新促進會、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院“學(xué)科攀峰計劃”等資助。

近年來,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院堅持“四個面向”,圍繞醫(yī)學(xué)重大熱點和難點問題,強化“有組織的科研”,不斷提升科技創(chuàng)新能力、完善科研組織模式、建立成果轉(zhuǎn)化體系,構(gòu)建完善科研效能提升架構(gòu),產(chǎn)生了大量具有影響力的科研成果,為醫(yī)學(xué)科技進步注入了強勁動能。

未來,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院和附屬醫(yī)院將錨定國家戰(zhàn)略新需求,深化創(chuàng)新評價“新激勵”,打造創(chuàng)新策源“強引擎”,勇闖科研創(chuàng)新“無人區(qū)”,系統(tǒng)推進科技創(chuàng)新和成果轉(zhuǎn)化的高質(zhì)量發(fā)展,為建設(shè)中國特色世界一流醫(yī)學(xué)院和一流醫(yī)學(xué)學(xué)科、服務(wù)國家高水平科技自立自強貢獻源源不斷的“交醫(yī)”力量。


編輯:陳露

資料:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院

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