編輯丨王多魚

排版丨水成文

在自身免疫疾病中，翻譯后修飾的蛋白質(zhì)是重要的自身抗原，而瓜氨酸化蛋白（蛋白質(zhì)中的精氨酸殘基在酶催化下轉(zhuǎn)化為瓜氨酸的翻譯后修飾產(chǎn)物）是類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎（RA）自身抗體的關(guān)鍵靶點(diǎn)。

然而，現(xiàn)有檢測(cè)方法和計(jì)算工具的不足，限制了瓜氨酸化蛋白質(zhì)組的精準(zhǔn)分析和自身抗原的鑒定。

2026 年 3 月 3 日，四川大學(xué)華西醫(yī)院戴倫治、趙毅團(tuán)隊(duì)合作（胡夢(mèng)、朱晨曦、孫蕊、龔艷秋、劉藝、許志強(qiáng)為論文共同第一作者），在 Nature 子刊Nature Biomedical Engineering上發(fā)表了題為：Low-input deep learning platform for citrullinated peptide identification, autoantigen discovery and rheumatoid arthritis treatment stratification 的研究論文。

該研究開發(fā)了Iseq-Cit技術(shù)，用于正常人、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎高危個(gè)體以及 類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎 患者的瓜氨酸化蛋白質(zhì)組分析，建立了疾病活動(dòng)度與瓜氨酸化的關(guān)聯(lián)，證實(shí)了部分瓜氨酸化多肽具有早期診斷和預(yù)測(cè)藥物治療響應(yīng)的潛力，該研究還建立了 AI 模型預(yù)測(cè)瓜氨酸化多肽的類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血清反應(yīng)活性。

這項(xiàng)研究為瓜氨酸化多肽鑒定、自身抗原發(fā)現(xiàn)以及類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎治療分層提供了創(chuàng)新策略。

在這項(xiàng)最新研究中，研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了Iseq-Cit技術(shù)（internal standard-assisted enrichment-free approach for high-throughput quantitative analysis of citrullinome，內(nèi)標(biāo)輔助免富集高通量瓜氨酸化蛋白質(zhì)組定量分析技術(shù)），通過對(duì)縱向隊(duì)列中類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎高危個(gè)體和類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者進(jìn)行全局瓜氨酸化蛋白質(zhì)組分析，僅需傳統(tǒng)方法不足 1% 的樣本量即可完成。

該研究發(fā)現(xiàn)，血漿瓜氨酸化蛋白質(zhì)組譜與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎疾病進(jìn)展和嚴(yán)重程度密切相關(guān)。研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步開發(fā)了整合臨床指標(biāo)與瓜氨酸化數(shù)據(jù)的預(yù)測(cè)模型，在治療響應(yīng)預(yù)測(cè)方面展現(xiàn)出高精度。

為評(píng)估已鑒定瓜氨酸化多肽的類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血清反應(yīng)性，研究團(tuán)隊(duì)采用 67399 個(gè)類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血清陰性多肽和 8816 個(gè)類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎血清陽(yáng)性多肽訓(xùn)練了雙向門控循環(huán)單元（BiGRU）模型。通過酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)的外部驗(yàn)證證實(shí)，該模型預(yù)測(cè)瓜氨酸化多肽血清反應(yīng)性的準(zhǔn)確率達(dá) 84.2%，并篩選出 19 個(gè)具有潛力的類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎診斷候選標(biāo)志物。

總的來說，該研究為瓜氨酸化多肽的鑒定、自身抗原發(fā)現(xiàn)以及類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎治療分層提供了創(chuàng)新策略。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41551-026-01628-4