編輯丨王多魚

排版丨水成文

增強(qiáng)子-啟動子（enhancer-promoter，E-P）相互作用，在細(xì)胞命運(yùn)決定過程中調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。然而，E-P 相互作用的調(diào)控機(jī)制，目前仍不清楚。

2025 年 12 月 16 日，中山大學(xué)丁俊軍教授聯(lián)合四川大學(xué)華西二院肖雪教授、南方醫(yī)科大學(xué)深圳眼科醫(yī)院遲瑋教授、徐州醫(yī)科大學(xué)白津教授、暨南大學(xué)中醫(yī)學(xué)院范麗麗博士（中山大學(xué)姜少帥、劉心儀、章主恒、楊明珠為論文共同第一作者）在Nature Genetics期刊發(fā)表了題為： JMJD2 regulates enhancer-promoter interactions via biomolecular condensate formation 的研究論文。

該研究開發(fā)了可鑒定特定染色質(zhì)互作上蛋白組分（Looposome）的新技術(shù)——LoopID。作為目前唯一的基于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)組學(xué)方法， LoopID 技術(shù)基于細(xì)胞內(nèi)真實(shí)發(fā)生的染色質(zhì)折疊，為解析特定染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)如何被介導(dǎo)、如何發(fā)揮功能提供了全新的工具。

在這項(xiàng)最新研究中，研究團(tuán)隊(duì)提出了一種基于染色質(zhì)相互作用的蛋白質(zhì)組學(xué)方法——LoopID，用于分析特定 E-P 錨點(diǎn)處的蛋白質(zhì)（looposome）。該研究發(fā)現(xiàn)，組蛋白去甲基化酶JMJD2作為 looposome 的關(guān)鍵組分，能夠通過形成生物分子凝聚體以非催化依賴的方式調(diào)控 E-P 相互作用及 looposome 功能。進(jìn)一步，研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種在特定基因組位點(diǎn)組裝 JMJD2 凝聚體來工程化 E-P 相互作用的系統(tǒng)，從而能夠構(gòu)建細(xì)胞類型特異性的 E-P 相互作用以促進(jìn)細(xì)胞重編程為多能性或類二細(xì)胞期細(xì)胞。

該研究揭示了組蛋白去甲基化酶在染色質(zhì)組織調(diào)控中的非經(jīng)典功能，并為通過 E-P 相互作用調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變提供了新策略。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41588-025-02415-8