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同樣是沉淀法,為什么師姐提取的外泌體又多又好?

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大概每個(gè)做外泌體提取的科研人都踩過沉淀法的坑:

  • 純度不達(dá)標(biāo):明明嚴(yán)格按步驟操作,提取物里還是有蛋白、雜質(zhì),純度不達(dá)標(biāo);

  • 假陽性結(jié)構(gòu):后續(xù) WB 檢測條帶模糊、電鏡觀察背景雜亂,甚至出現(xiàn)假陽性結(jié)果;

  • 不同樣本不兼容:不同樣本(組織、血清、植物等)的雜質(zhì)類型天差地別,單純靠通用沉淀試劑,換個(gè)樣本就翻車,根本沒法精準(zhǔn)去除雜質(zhì)……


雖然沉淀法操作簡單、成本低、還能快速針對大量樣本完成提取,但很多人忽略了沉淀法的核心是通過試劑改變滲透壓,讓外泌體快速沉降,但這個(gè)過程根本沒法區(qū)分外泌體和蛋白、核酸等雜質(zhì),因此單純的沉淀試劑純度不會太好。想要獲得干凈的外泌體,就要從源頭減少雜質(zhì)干擾,針對不同樣本類型選對專屬試劑盒,宇玫博生物自主開發(fā)的外泌體提取純化試劑盒,適用于組織、細(xì)胞上清、血清血漿、乳液、尿液以及其他體液等多種樣本,已有七百余篇發(fā)表文章支持,點(diǎn)擊下方即可申請免費(fèi)試用,獲取外泌體提取解決方案 >>

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那到底該怎么確保外泌體的提取質(zhì)量,徹底避開這些坑呢?核心就抓兩個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié),也是宇玫博外泌體提取純化試劑盒的設(shè)計(jì)邏輯:

  • 樣本處理:初始樣本雜質(zhì)越少,沉淀得到的外泌體自然越干凈。而不同樣本(組織、血清、植物等)的雜質(zhì)類型天差地別,所以沉淀法去除雜質(zhì)的核心在于針對性的樣本獲取規(guī)范 + 專屬預(yù)處理流程。


  • 后期除菌:除菌和去除大囊泡這兩步常常被很多人忽略,這樣不僅容易出現(xiàn)污染,還會讓大囊泡混入導(dǎo)致假陽性結(jié)果,常見的 WB 條帶模糊、電鏡背景雜亂,往往和這兩個(gè)因素有關(guān)。

不同樣本,如何確定處理方案?

1

細(xì)胞樣本

細(xì)胞樣本處理的關(guān)鍵在于前期培養(yǎng),常規(guī)培養(yǎng)基含血清蛋白,易與外泌體共沉淀;樣本雜質(zhì)會增加后續(xù)提取難度,影響純度。

因此建議采用外泌體專用培養(yǎng)基。在李一星教授和周磊教授團(tuán)隊(duì)共同發(fā)表的文章中,團(tuán)隊(duì)就采用搭配試劑盒專用化學(xué)成分限定培養(yǎng)基(低蛋白含量),所提取的外泌體純度高、得率穩(wěn)定,很好的適配了細(xì)胞共孵育、組學(xué)研究等下游實(shí)驗(yàn)[1]。

2

血液樣本(血清/血漿)

血清/血漿樣本中高豐度雜蛋白、代謝廢物多,雜質(zhì)成分復(fù)雜,通用試劑難以精準(zhǔn)去除。

通過差異化預(yù)處理能夠很好的解決這個(gè)問題,魏從文教授團(tuán)隊(duì)采用 Umibio 血清-血漿外泌體提取純化試劑盒,高效去除血清雜蛋白,提取的外泌體支撐了結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移研究,適配蛋白組學(xué)分析需求[2]。

3

組織樣本(心肌、肝臟等)

這些組織質(zhì)地致密難破碎,易殘留組織碎屑、胞內(nèi)蛋白等雜質(zhì);無菌控制難度高,易出現(xiàn)污染和假陽性。

因此在處理樣本時(shí)需要先進(jìn)行組織破碎與雜質(zhì)分離,協(xié)和醫(yī)院程敏教授團(tuán)隊(duì),用 Umibio 組織外泌體提取試劑盒處理小鼠組織樣本,經(jīng)酶解、專用試劑孵育等步驟去除雜質(zhì),提取的外泌體通過 TEM、NTA 鑒定,在心肌纖維化研究中起到了重要作用[3]。

4

植物樣本

植物樣本細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)堅(jiān)固,且富含色素、多糖、多酚及次生代謝物等多種干擾物質(zhì),使得囊泡的完整提取與高純度獲取難度加大,而且植物樣本種類較多,不同部位的樣本提取方法也存在差異。

因此在處理時(shí),針對不同種類的植物樣本,有效破解細(xì)胞壁并高效去除各類雜質(zhì)是關(guān)鍵,可以選用 Umibio 植物囊泡提取試劑盒對植物組織進(jìn)行預(yù)處理,不僅針對果實(shí)、花/葉、根莖、干品植物(花、根莖、種子)、大型真菌等五大類研發(fā)了「專屬」試劑盒,更能通過優(yōu)化的酶解方法與專用純化試劑相結(jié)合,能夠溫和釋放囊泡并深度去除多糖、蛋白等污染物。


除此之外還有細(xì)胞上清、尿液等其他樣本,宇玫博生物自主開發(fā)的外泌體提取純化試劑盒也都有解決方案。

特別值得一提的是,如果研究涉及到深度蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)分析或者想讓電鏡下外泌體形態(tài)更清晰,還可以采用聯(lián)用法進(jìn)行外泌體提取,比如沉淀 + 超離、沉淀 + SEC 等,進(jìn)一步減少微量雜質(zhì)對高精度實(shí)驗(yàn)的干擾。如果你也有更高的實(shí)驗(yàn)要求,點(diǎn)此申請免費(fèi)試用,把雜質(zhì)多、得率低等問題交給我們吧!

內(nèi)容策劃:鄒禮平

內(nèi)容審核:吳軍

題圖來源:圖蟲創(chuàng)意

參考文獻(xiàn):

[1]. HLF and PPARαaxis regulates metabolic‐associated fatty liver disease through extracellular vesicles derived from the intestinal microbiota. Imeta. 2025 Apr 07;4(2):e70022.

[2]. GP73-dependent regulation of exosome biogenesis promotes colorectal cancer liver metastasis. Molecular Cancer. 2025 May 26;24(1):151.

[3]. Lung-Derived Small Extracellular Vesicles Containing miR-15a-5p/miR-96-5p Promote Myocardial Fibrosis in Hypertrophic Cardiomyopathy via Targeting SMAD7. small. 2025 July 31:e01610.

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